RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.1■■■■■ 6.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.4■■■■■ 5.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCC9O60706 1549 aa45.23■■■■■ 4.83
RARA-AS1-201ENST00000581080 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.81■■■■■ 4.76
RARA-AS1-201ENST00000581080 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.78■■■■■ 4.76
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.45■■■■■ 4.71
RARA-AS1-201ENST00000581080 NACADO15069 1562 aa44.3■■■■■ 4.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.01■■■■■ 4.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.7■■■■■ 4.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCRIBQ14160 1630 aa43.46■■■■■ 4.55
RARA-AS1-201ENST00000581080 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.06■■■■■ 4.48
RARA-AS1-201ENST00000581080 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.68■■■■■ 4.42
RARA-AS1-201ENST00000581080 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.57■■■■■ 4.4
RARA-AS1-201ENST00000581080 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.05■■■■■ 4.32
RARA-AS1-201ENST00000581080 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
RARA-AS1-201ENST00000581080 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.76■■■■■ 4.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMARCA4P51532 1647 aa41.67■■■■■ 4.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 WIZO95785 1651 aa41.37■■■■■ 4.21
RARA-AS1-201ENST00000581080 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.23■■■■■ 4.19
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.14■■■■■ 4.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMARCA2P51531 1590 aa41.11■■■■■ 4.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
RARA-AS1-201ENST00000581080 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.94■■■■■ 4.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NCAPD3P42695 1498 aa40.9■■■■■ 4.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 HMGXB3Q12766 1538 aa40.77■■■■■ 4.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.53■■■■■ 4.08
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.37■■■■■ 4.05
RARA-AS1-201ENST00000581080 CFTRP13569 1480 aa39.84■■■■□ 3.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.82■■■■□ 3.96
RARA-AS1-201ENST00000581080 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.81■■■■□ 3.96
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.56■■■■□ 3.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRDM2Q13029 1718 aa39.55■■■■□ 3.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 NESP48681 1621 aa39.55■■■■□ 3.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCC8Q09428 1581 aa39.48■■■■□ 3.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM41Q8WV44 630 aa39.41■■■■□ 3.9
RARA-AS1-201ENST00000581080 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.34■■■■□ 3.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.33■■■■□ 3.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.29■■■■□ 3.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNJ1O43426 1573 aa39.16■■■■□ 3.86
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.14■■■■□ 3.86
RARA-AS1-201ENST00000581080 CUX1P39880 1505 aa39.07■■■■□ 3.85
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOP2BQ02880 1626 aa39.07■■■■□ 3.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.06■■■■□ 3.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.02■■■■□ 3.84
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.88■■■■□ 3.82
RARA-AS1-201ENST00000581080 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOPBP1Q92547 1522 aa38.86■■■■□ 3.81
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERCC6Q03468 1493 aa38.85■■■■□ 3.81
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.78■■■■□ 3.8
RARA-AS1-201ENST00000581080 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.73■■■■□ 3.79
RARA-AS1-201ENST00000581080 SOGA1O94964 1423 aa38.66■■■■□ 3.78
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR62O43379 1518 aa38.61■■■■□ 3.77
RARA-AS1-201ENST00000581080 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
RARA-AS1-201ENST00000581080 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.54■■■■□ 3.76
RARA-AS1-201ENST00000581080 EEA1Q15075 1411 aa38.54■■■■□ 3.76
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.48■■■■□ 3.75
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.41■■■■□ 3.74
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF27Q86VH2 1401 aa38.4■■■■□ 3.74
RARA-AS1-201ENST00000581080 CUX2O14529 1486 aa38.38■■■■□ 3.74
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.37■■■■□ 3.73
RARA-AS1-201ENST00000581080 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR97A6NE52 1622 aa38.27■■■■□ 3.72
RARA-AS1-201ENST00000581080 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.25■■■■□ 3.71
RARA-AS1-201ENST00000581080 IFT140Q96RY7 1462 aa38.25■■■■□ 3.71
RARA-AS1-201ENST00000581080 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGF1RP08069 1367 aa38.12■■■■□ 3.69
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.1■■■■□ 3.69
RARA-AS1-201ENST00000581080 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.07■■■■□ 3.69
RARA-AS1-201ENST00000581080 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.04■■■■□ 3.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF21BO75037 1637 aa38.03■■■■□ 3.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRXQ9BXM0 1461 aa38.02■■■■□ 3.68
RARA-AS1-201ENST00000581080 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.95■■■■□ 3.67
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA3Q08378 1498 aa37.94■■■■□ 3.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.91■■■■□ 3.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.91■■■■□ 3.66
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRIN2BQ13224 1484 aa37.86■■■■□ 3.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 PBRM1Q86U86 1689 aa37.84■■■■□ 3.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 CUL7Q14999 1698 aa37.84■■■■□ 3.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.75■■■■□ 3.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.66■■■■□ 3.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADAMTS12P58397 1594 aa37.63■■■■□ 3.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.63■■■■□ 3.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEP162Q5TB80 1403 aa37.48■■■■□ 3.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNJ2O15056 1496 aa37.45■■■■□ 3.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRIN2AQ12879 1464 aa37.39■■■■□ 3.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBLN2P98095 1184 aa37.32■■■■□ 3.57
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLIP1P30622 1438 aa37.32■■■■□ 3.57
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