RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358543.8

ALKAL1-201, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 1,217 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-201ENST00000358543 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.23■■■■■ 6.91
ALKAL1-201ENST00000358543 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.56■■■■■ 5.84
ALKAL1-201ENST00000358543 ABCC9O60706 1549 aa50.01■■■■■ 5.6
ALKAL1-201ENST00000358543 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
ALKAL1-201ENST00000358543 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.45■■■■■ 5.35
ALKAL1-201ENST00000358543 NACADO15069 1562 aa48.42■■■■■ 5.34
ALKAL1-201ENST00000358543 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.34■■■■■ 5.33
ALKAL1-201ENST00000358543 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.32■■■■■ 5.33
ALKAL1-201ENST00000358543 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.26■■■■■ 5.32
ALKAL1-201ENST00000358543 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.17■■■■■ 5.14
ALKAL1-201ENST00000358543 SCRIBQ14160 1630 aa47.01■■■■■ 5.12
ALKAL1-201ENST00000358543 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.84■■■■■ 5.09
ALKAL1-201ENST00000358543 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.83■■■■■ 5.09
ALKAL1-201ENST00000358543 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.46■■■■■ 5.03
ALKAL1-201ENST00000358543 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
ALKAL1-201ENST00000358543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.56■■■■■ 4.88
ALKAL1-201ENST00000358543 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.29■■■■■ 4.84
ALKAL1-201ENST00000358543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.26■■■■■ 4.84
ALKAL1-201ENST00000358543 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
ALKAL1-201ENST00000358543 SMARCA4P51532 1647 aa45.06■■■■■ 4.8
ALKAL1-201ENST00000358543 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.85■■■■■ 4.77
ALKAL1-201ENST00000358543 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.75■■■■■ 4.75
ALKAL1-201ENST00000358543 SMARCA2P51531 1590 aa44.71■■■■■ 4.75
ALKAL1-201ENST00000358543 NCAPD3P42695 1498 aa44.7■■■■■ 4.75
ALKAL1-201ENST00000358543 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.67■■■■■ 4.74
ALKAL1-201ENST00000358543 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
ALKAL1-201ENST00000358543 HMGXB3Q12766 1538 aa44.47■■■■■ 4.71
ALKAL1-201ENST00000358543 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
ALKAL1-201ENST00000358543 WIZO95785 1651 aa44.36■■■■■ 4.69
ALKAL1-201ENST00000358543 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
ALKAL1-201ENST00000358543 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
ALKAL1-201ENST00000358543 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.46■■■■■ 4.55
ALKAL1-201ENST00000358543 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.41■■■■■ 4.54
ALKAL1-201ENST00000358543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.4■■■■■ 4.54
ALKAL1-201ENST00000358543 NESP48681 1621 aa43.4■■■■■ 4.54
ALKAL1-201ENST00000358543 CFTRP13569 1480 aa43.24■■■■■ 4.51
ALKAL1-201ENST00000358543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.14■■■■■ 4.5
ALKAL1-201ENST00000358543 ERCC6Q03468 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
ALKAL1-201ENST00000358543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.87■■■■■ 4.45
ALKAL1-201ENST00000358543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.86■■■■■ 4.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.75■■■■■ 4.43
ALKAL1-201ENST00000358543 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
ALKAL1-201ENST00000358543 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.62■■■■■ 4.41
ALKAL1-201ENST00000358543 CUX2O14529 1486 aa42.52■■■■■ 4.4
ALKAL1-201ENST00000358543 WDR62O43379 1518 aa42.47■■■■■ 4.39
ALKAL1-201ENST00000358543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
ALKAL1-201ENST00000358543 ABCC8Q09428 1581 aa42.31■■■■■ 4.36
ALKAL1-201ENST00000358543 TOPBP1Q92547 1522 aa42.23■■■■■ 4.35
ALKAL1-201ENST00000358543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.21■■■■■ 4.35
ALKAL1-201ENST00000358543 CUX1P39880 1505 aa42.05■■■■■ 4.32
ALKAL1-201ENST00000358543 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
ALKAL1-201ENST00000358543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
ALKAL1-201ENST00000358543 IFT140Q96RY7 1462 aa41.88■■■■■ 4.29
ALKAL1-201ENST00000358543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.85■■■■■ 4.29
ALKAL1-201ENST00000358543 TOP2BQ02880 1626 aa41.82■■■■■ 4.29
ALKAL1-201ENST00000358543 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.79■■■■■ 4.28
ALKAL1-201ENST00000358543 SYNJ1O43426 1573 aa41.79■■■■■ 4.28
ALKAL1-201ENST00000358543 SOGA1O94964 1423 aa41.76■■■■■ 4.28
ALKAL1-201ENST00000358543 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
ALKAL1-201ENST00000358543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.7■■■■■ 4.27
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
ALKAL1-201ENST00000358543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.5■■■■■ 4.23
ALKAL1-201ENST00000358543 WDR97A6NE52 1622 aa41.47■■■■■ 4.23
ALKAL1-201ENST00000358543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
ALKAL1-201ENST00000358543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
ALKAL1-201ENST00000358543 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
ALKAL1-201ENST00000358543 TRIM41Q8WV44 630 aa41.3■■■■■ 4.2
ALKAL1-201ENST00000358543 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.27■■■■■ 4.2
ALKAL1-201ENST00000358543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.25■■■■■ 4.19
ALKAL1-201ENST00000358543 GRIN2BQ13224 1484 aa41.21■■■■■ 4.19
ALKAL1-201ENST00000358543 PBRM1Q86U86 1689 aa41.08■■■■■ 4.17
ALKAL1-201ENST00000358543 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.08■■■■■ 4.17
ALKAL1-201ENST00000358543 KIF27Q86VH2 1401 aa41.08■■■■■ 4.17
ALKAL1-201ENST00000358543 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
ALKAL1-201ENST00000358543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.05■■■■■ 4.16
ALKAL1-201ENST00000358543 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.01■■■■■ 4.16
ALKAL1-201ENST00000358543 SYNJ2O15056 1496 aa40.9■■■■■ 4.14
ALKAL1-201ENST00000358543 IGF1RP08069 1367 aa40.88■■■■■ 4.14
ALKAL1-201ENST00000358543 OSCARQ8IYS5 282 aa40.88■■■■■ 4.13
ALKAL1-201ENST00000358543 FBLN2P98095 1184 aa40.86■■■■■ 4.13
ALKAL1-201ENST00000358543 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
ALKAL1-201ENST00000358543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.83■■■■■ 4.13
ALKAL1-201ENST00000358543 ADAMTS12P58397 1594 aa40.81■■■■■ 4.12
ALKAL1-201ENST00000358543 CHD1O14646 1710 aa40.81■■■■■ 4.12
ALKAL1-201ENST00000358543 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.78■■■■■ 4.12
ALKAL1-201ENST00000358543 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.75■■■■■ 4.11
ALKAL1-201ENST00000358543 CUL7Q14999 1698 aa40.69■■■■■ 4.1
ALKAL1-201ENST00000358543 GRIN2AQ12879 1464 aa40.67■■■■■ 4.1
ALKAL1-201ENST00000358543 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.63■■■■■ 4.1
ALKAL1-201ENST00000358543 EEA1Q15075 1411 aa40.6■■■■■ 4.09
ALKAL1-201ENST00000358543 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.5■■■■■ 4.07
ALKAL1-201ENST00000358543 NUP160Q12769 1436 aa40.5■■■■■ 4.07
ALKAL1-201ENST00000358543 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.44■■■■■ 4.06
ALKAL1-201ENST00000358543 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.43■■■■■ 4.06
ALKAL1-201ENST00000358543 CEP170Q5SW79 1584 aa40.42■■■■■ 4.06
ALKAL1-201ENST00000358543 PRXQ9BXM0 1461 aa40.4■■■■■ 4.06
ALKAL1-201ENST00000358543 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
ALKAL1-201ENST00000358543 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.22■■■■■ 4.03
ALKAL1-201ENST00000358543 ARHGEF11O15085 1522 aa40.14■■■■■ 4.02
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