RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376191.2

MCCD1-201, Transcript of mitochondrial coiled-coil domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MCCD1, Length 955 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1-201ENST00000376191 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.4■■■■■ 7.26
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MCCD1-201ENST00000376191 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.7■■■■■ 5.55
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MCCD1-201ENST00000376191 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.06■■■■■ 5.28
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MCCD1-201ENST00000376191 SMARCA2P51531 1590 aa46.63■■■■■ 5.06
MCCD1-201ENST00000376191 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.52■■■■■ 5.04
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MCCD1-201ENST00000376191 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.45■■■■■ 5.03
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MCCD1-201ENST00000376191 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.69■■■■■ 4.9
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MCCD1-201ENST00000376191 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.4■■■■■ 4.86
MCCD1-201ENST00000376191 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
MCCD1-201ENST00000376191 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.31■■■■■ 4.84
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MCCD1-201ENST00000376191 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.99■■■■■ 4.79
MCCD1-201ENST00000376191 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.93■■■■■ 4.78
MCCD1-201ENST00000376191 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.93■■■■■ 4.78
MCCD1-201ENST00000376191 WDR62O43379 1518 aa44.88■■■■■ 4.78
MCCD1-201ENST00000376191 PRDM2Q13029 1718 aa44.68■■■■■ 4.74
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MCCD1-201ENST00000376191 TOPBP1Q92547 1522 aa44.12■■■■■ 4.65
MCCD1-201ENST00000376191 ABCC8Q09428 1581 aa44.07■■■■■ 4.65
MCCD1-201ENST00000376191 IFT140Q96RY7 1462 aa44.03■■■■■ 4.64
MCCD1-201ENST00000376191 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.98■■■■■ 4.63
MCCD1-201ENST00000376191 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
MCCD1-201ENST00000376191 OSCARQ8IYS5 282 aa43.89■■■■■ 4.62
MCCD1-201ENST00000376191 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
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MCCD1-201ENST00000376191 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.52■■■■■ 4.56
MCCD1-201ENST00000376191 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
MCCD1-201ENST00000376191 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.35■■■■■ 4.53
MCCD1-201ENST00000376191 FBLN2P98095 1184 aa43.28■■■■■ 4.52
MCCD1-201ENST00000376191 TOP2BQ02880 1626 aa43.28■■■■■ 4.52
MCCD1-201ENST00000376191 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.28■■■■■ 4.52
MCCD1-201ENST00000376191 WDR97A6NE52 1622 aa43.27■■■■■ 4.52
MCCD1-201ENST00000376191 SYNJ1O43426 1573 aa43.23■■■■■ 4.51
MCCD1-201ENST00000376191 CHD1O14646 1710 aa43.2■■■■■ 4.51
MCCD1-201ENST00000376191 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.16■■■■■ 4.5
MCCD1-201ENST00000376191 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.16■■■■■ 4.5
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MCCD1-201ENST00000376191 ARHGEF11O15085 1522 aa43.1■■■■■ 4.49
MCCD1-201ENST00000376191 GRIN2BQ13224 1484 aa43.09■■■■■ 4.49
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MCCD1-201ENST00000376191 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
MCCD1-201ENST00000376191 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
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MCCD1-201ENST00000376191 SYNJ2O15056 1496 aa42.89■■■■■ 4.46
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MCCD1-201ENST00000376191 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.84■■■■■ 4.45
MCCD1-201ENST00000376191 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.77■■■■■ 4.44
MCCD1-201ENST00000376191 ARAP1Q96P48 1450 aa42.71■■■■■ 4.43
MCCD1-201ENST00000376191 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.61■■■■■ 4.41
MCCD1-201ENST00000376191 ADAMTS12P58397 1594 aa42.54■■■■■ 4.4
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MCCD1-201ENST00000376191 KIF27Q86VH2 1401 aa42.46■■■■■ 4.39
MCCD1-201ENST00000376191 NUP160Q12769 1436 aa42.38■■■■■ 4.38
MCCD1-201ENST00000376191 CEP170Q5SW79 1584 aa42.34■■■■■ 4.37
MCCD1-201ENST00000376191 IGF1RP08069 1367 aa42.28■■■■■ 4.36
MCCD1-201ENST00000376191 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
MCCD1-201ENST00000376191 CUL7Q14999 1698 aa42.22■■■■■ 4.35
MCCD1-201ENST00000376191 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.16■■■■■ 4.34
MCCD1-201ENST00000376191 SHROOM2Q13796 1616 aa42.08■■■■■ 4.33
MCCD1-201ENST00000376191 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.04■■■■■ 4.32
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