RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342790.8

ZDHHC3-203, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZDHHC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3-203ENST00000342790 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.94■■■■■ 7.19
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ZDHHC3-203ENST00000342790 SCRIBQ14160 1630 aa48.64■■■■■ 5.38
ZDHHC3-203ENST00000342790 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.62■■■■■ 5.37
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ZDHHC3-203ENST00000342790 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.15■■■■■ 5.14
ZDHHC3-203ENST00000342790 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.85■■■■■ 5.09
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ZDHHC3-203ENST00000342790 SMARCA2P51531 1590 aa46.18■■■■■ 4.98
ZDHHC3-203ENST00000342790 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.02■■■■■ 4.96
ZDHHC3-203ENST00000342790 HMGXB3Q12766 1538 aa45.98■■■■■ 4.95
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ZDHHC3-203ENST00000342790 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.97■■■■■ 4.79
ZDHHC3-203ENST00000342790 ERCC6Q03468 1493 aa44.95■■■■■ 4.79
ZDHHC3-203ENST00000342790 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.88■■■■■ 4.78
ZDHHC3-203ENST00000342790 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.7■■■■■ 4.75
ZDHHC3-203ENST00000342790 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.69■■■■■ 4.75
ZDHHC3-203ENST00000342790 CFTRP13569 1480 aa44.62■■■■■ 4.73
ZDHHC3-203ENST00000342790 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
ZDHHC3-203ENST00000342790 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.55■■■■■ 4.72
ZDHHC3-203ENST00000342790 CUX2O14529 1486 aa44.43■■■■■ 4.7
ZDHHC3-203ENST00000342790 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ZDHHC3-203ENST00000342790 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.38■■■■■ 4.7
ZDHHC3-203ENST00000342790 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.32■■■■■ 4.69
ZDHHC3-203ENST00000342790 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.26■■■■■ 4.68
ZDHHC3-203ENST00000342790 PRDM2Q13029 1718 aa44.18■■■■■ 4.66
ZDHHC3-203ENST00000342790 WDR62O43379 1518 aa44.1■■■■■ 4.65
ZDHHC3-203ENST00000342790 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.63
ZDHHC3-203ENST00000342790 TOPBP1Q92547 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
ZDHHC3-203ENST00000342790 ABCC8Q09428 1581 aa43.61■■■■■ 4.57
ZDHHC3-203ENST00000342790 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.6■■■■■ 4.57
ZDHHC3-203ENST00000342790 IFT140Q96RY7 1462 aa43.38■■■■■ 4.53
ZDHHC3-203ENST00000342790 CUX1P39880 1505 aa43.36■■■■■ 4.53
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ZDHHC3-203ENST00000342790 SYNJ1O43426 1573 aa42.98■■■■■ 4.47
ZDHHC3-203ENST00000342790 TOP2BQ02880 1626 aa42.95■■■■■ 4.47
ZDHHC3-203ENST00000342790 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.93■■■■■ 4.46
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ZDHHC3-203ENST00000342790 WDR97A6NE52 1622 aa42.79■■■■■ 4.44
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ZDHHC3-203ENST00000342790 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.62■■■■■ 4.41
ZDHHC3-203ENST00000342790 GRIN2BQ13224 1484 aa42.61■■■■■ 4.41
ZDHHC3-203ENST00000342790 OSCARQ8IYS5 282 aa42.61■■■■■ 4.41
ZDHHC3-203ENST00000342790 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.59■■■■■ 4.41
ZDHHC3-203ENST00000342790 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.57■■■■■ 4.41
ZDHHC3-203ENST00000342790 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
ZDHHC3-203ENST00000342790 PBRM1Q86U86 1689 aa42.48■■■■■ 4.39
ZDHHC3-203ENST00000342790 FBLN2P98095 1184 aa42.47■■■■■ 4.39
ZDHHC3-203ENST00000342790 CHD1O14646 1710 aa42.43■■■■■ 4.38
ZDHHC3-203ENST00000342790 SYNJ2O15056 1496 aa42.34■■■■■ 4.37
ZDHHC3-203ENST00000342790 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
ZDHHC3-203ENST00000342790 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.25■■■■■ 4.35
ZDHHC3-203ENST00000342790 ADAMTS12P58397 1594 aa42.19■■■■■ 4.34
ZDHHC3-203ENST00000342790 KIF27Q86VH2 1401 aa42.17■■■■■ 4.34
ZDHHC3-203ENST00000342790 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.13■■■■■ 4.33
ZDHHC3-203ENST00000342790 TRIM41Q8WV44 630 aa42.08■■■■■ 4.33
ZDHHC3-203ENST00000342790 GRIN2AQ12879 1464 aa42.07■■■■■ 4.33
ZDHHC3-203ENST00000342790 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.02■■■■■ 4.32
ZDHHC3-203ENST00000342790 IGF1RP08069 1367 aa42.01■■■■■ 4.32
ZDHHC3-203ENST00000342790 ARHGEF11O15085 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
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ZDHHC3-203ENST00000342790 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
ZDHHC3-203ENST00000342790 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
ZDHHC3-203ENST00000342790 NUP160Q12769 1436 aa41.88■■■■■ 4.29
ZDHHC3-203ENST00000342790 CEP170Q5SW79 1584 aa41.86■■■■■ 4.29
ZDHHC3-203ENST00000342790 CUL7Q14999 1698 aa41.85■■■■■ 4.29
ZDHHC3-203ENST00000342790 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.83■■■■■ 4.29
ZDHHC3-203ENST00000342790 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.75■■■■■ 4.27
ZDHHC3-203ENST00000342790 ARAP1Q96P48 1450 aa41.61■■■■■ 4.25
ZDHHC3-203ENST00000342790 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.58■■■■■ 4.25
ZDHHC3-203ENST00000342790 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.57■■■■■ 4.25
ZDHHC3-203ENST00000342790 SHROOM2Q13796 1616 aa41.53■■■■■ 4.24
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