Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)26.69■■□□□ 1.862e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 526.35■■□□□ 1.812e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 224.72■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 421.28■■□□□ 12e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 420.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 519.99■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 419.97■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 314.89□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.845e-18■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 525.83■■□□□ 1.735e-18■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 423.08■■□□□ 1.295e-18■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.645e-18■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-18■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.135e-18■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 512.96□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.216e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.216e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.446e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.556e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 527.37■■□□□ 1.971e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-204ENST00000453046 572 ntTSL 423.33■■□□□ 1.331e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-209ENST00000504627 602 ntTSL 523.33■■□□□ 1.331e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-212ENST00000508284 578 ntTSL 423.33■■□□□ 1.331e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-205ENST00000464493 532 ntTSL 418.28■□□□□ 0.521e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-207ENST00000481335 562 ntTSL 415.85■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 SQSTM1-203ENST00000422245 628 ntTSL 415.14■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 13.4
FKBP4Q02790 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 330.29■■■□□ 2.443e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 C9orf3-213ENST00000471978 478 ntTSL 229.47■■■□□ 2.313e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 C9orf3-211ENST00000463372 919 ntTSL 318.83■□□□□ 0.63e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 C9orf3-206ENST00000428313 2288 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.413e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 C9orf3-212ENST00000468164 849 ntTSL 517.48■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.173e-6■■□□□ 13.3
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.742e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.312e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 22e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 226.73■■□□□ 1.872e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 224.27■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 NR5A1-201ENST00000373587 768 ntTSL 323.71■■□□□ 1.392e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 523.49■■□□□ 1.352e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 MBD3-210ENST00000592361 907 ntTSL 522.27■■□□□ 1.162e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 VAV2-204ENST00000472905 506 ntTSL 321.29■■□□□ 12e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 DGKQ-204ENST00000510286 473 ntTSL 320.88■□□□□ 0.932e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 HNRNPUL1-211ENST00000597725 573 ntTSL 413.22□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.434e-6■■□□□ 13.2
FKBP4Q02790 NEU4-210ENST00000428592 505 ntTSL 423.31■■□□□ 1.323e-6■■□□□ 13.1
FKBP4Q02790 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-6■■□□□ 13.1
FKBP4Q02790 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.555e-6■■□□□ 13.1
FKBP4Q02790 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.935e-6■■□□□ 13.1
FKBP4Q02790 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 228.73■■■□□ 2.197e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.77e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.377e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.257e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 512.01□□□□□ -0.497e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.684e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 C20orf204-202ENST00000431158 2954 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.714e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 C20orf204-203ENST00000444463 4303 ntTSL 1 (best)18.61■□□□□ 0.574e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 ABCC3-212ENST00000513511 1042 ntTSL 518.01■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 ABCC3-203ENST00000502426 5326 ntTSL 214.6□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 ABCC3-207ENST00000505699 5271 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 MXD4-203ENST00000513372 4228 ntTSL 216.41■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.363e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-207ENST00000537275 1508 ntTSL 1 (best)29.78■■■□□ 2.363e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)29.78■■■□□ 2.363e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.353e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.983e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.943e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.863e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-211ENST00000545998 1584 ntTSL 1 (best)25.63■■□□□ 1.693e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 518.76■□□□□ 0.591e-7■■□□□ 13
FKBP4Q02790 SMG1P3-205ENST00000522480 4262 ntBASIC13.01□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 13
FKBP4Q02790 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 325.11■■□□□ 1.613e-6■■□□□ 12.9
FKBP4Q02790 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.233e-6■■□□□ 12.9
FKBP4Q02790 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.923e-6■■□□□ 12.9
FKBP4Q02790 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 217.11■□□□□ 0.333e-6■■□□□ 12.9
FKBP4Q02790 PACSIN3-209ENST00000532457 1845 ntTSL 526.63■■□□□ 1.855e-7■■□□□ 12.9
FKBP4Q02790 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.615e-7■■□□□ 12.9
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 91.6 ms