RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.76■■■■□ 3.96
ACTB-201ENST00000331789 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.44■■■■□ 3.1
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
ACTB-201ENST00000331789 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.93■■■□□ 2.86
ACTB-201ENST00000331789 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.87■■■□□ 2.85
ACTB-201ENST00000331789 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.77■■■□□ 2.84
ACTB-201ENST00000331789 ABCC9O60706 1549 aa32.46■■■□□ 2.79
ACTB-201ENST00000331789 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.22■■■□□ 2.75
ACTB-201ENST00000331789 NACADO15069 1562 aa32.01■■■□□ 2.71
ACTB-201ENST00000331789 SCRIBQ14160 1630 aa31.87■■■□□ 2.69
ACTB-201ENST00000331789 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
ACTB-201ENST00000331789 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.68■■■□□ 2.66
ACTB-201ENST00000331789 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.19■■■□□ 2.58
ACTB-201ENST00000331789 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
ACTB-201ENST00000331789 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.97■■■□□ 2.55
ACTB-201ENST00000331789 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-201ENST00000331789 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.8■■■□□ 2.52
ACTB-201ENST00000331789 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.515e-26■□□□□ 10.8
ACTB-201ENST00000331789 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
ACTB-201ENST00000331789 WIZO95785 1651 aa30.6■■■□□ 2.49
ACTB-201ENST00000331789 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.53■■■□□ 2.48
ACTB-201ENST00000331789 SMARCA4P51532 1647 aa30.51■■■□□ 2.47
ACTB-201ENST00000331789 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ACTB-201ENST00000331789 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.04■■■□□ 2.4
ACTB-201ENST00000331789 SMARCA2P51531 1590 aa29.95■■■□□ 2.39
ACTB-201ENST00000331789 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.95■■■□□ 2.38
ACTB-201ENST00000331789 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.92■■■□□ 2.38
ACTB-201ENST00000331789 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
ACTB-201ENST00000331789 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ACTB-201ENST00000331789 TRIM41Q8WV44 630 aa29.77■■■□□ 2.36
ACTB-201ENST00000331789 NCAPD3P42695 1498 aa29.57■■■□□ 2.32
ACTB-201ENST00000331789 HMGXB3Q12766 1538 aa29.52■■■□□ 2.32
ACTB-201ENST00000331789 ABCC8Q09428 1581 aa29.47■■■□□ 2.31
ACTB-201ENST00000331789 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.47■■■□□ 2.31
ACTB-201ENST00000331789 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ACTB-201ENST00000331789 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTB-201ENST00000331789 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.263e-23■■□□□ 11.8
ACTB-201ENST00000331789 SYNJ1O43426 1573 aa29.07■■■□□ 2.24
ACTB-201ENST00000331789 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.02■■■□□ 2.24
ACTB-201ENST00000331789 CFTRP13569 1480 aa29.02■■■□□ 2.24
ACTB-201ENST00000331789 SOGA1O94964 1423 aa28.98■■■□□ 2.23
ACTB-201ENST00000331789 PRDM2Q13029 1718 aa28.9■■■□□ 2.22
ACTB-201ENST00000331789 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.9■■■□□ 2.22
ACTB-201ENST00000331789 TOP2BQ02880 1626 aa28.87■■■□□ 2.21
ACTB-201ENST00000331789 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.87■■■□□ 2.21
ACTB-201ENST00000331789 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.82■■■□□ 2.2
ACTB-201ENST00000331789 EEA1Q15075 1411 aa28.82■■■□□ 2.2
ACTB-201ENST00000331789 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.77■■■□□ 2.2
ACTB-201ENST00000331789 CUX1P39880 1505 aa28.76■■■□□ 2.19
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.66■■■□□ 2.18
ACTB-201ENST00000331789 NESP48681 1621 aa28.62■■■□□ 2.17
ACTB-201ENST00000331789 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.57■■■□□ 2.16
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA3Q08378 1498 aa28.51■■■□□ 2.15
ACTB-201ENST00000331789 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.49■■■□□ 2.15
ACTB-201ENST00000331789 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.49■■■□□ 2.15
ACTB-201ENST00000331789 KIF21BO75037 1637 aa28.49■■■□□ 2.15
ACTB-201ENST00000331789 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ACTB-201ENST00000331789 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.46■■■□□ 2.15
ACTB-201ENST00000331789 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.42■■■□□ 2.14
ACTB-201ENST00000331789 CEP162Q5TB80 1403 aa28.4■■■□□ 2.14
ACTB-201ENST00000331789 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.39■■■□□ 2.13
ACTB-201ENST00000331789 KIF27Q86VH2 1401 aa28.36■■■□□ 2.13
ACTB-201ENST00000331789 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.35■■■□□ 2.13
ACTB-201ENST00000331789 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.34■■■□□ 2.13
ACTB-201ENST00000331789 TOPBP1Q92547 1522 aa28.3■■■□□ 2.12
ACTB-201ENST00000331789 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.28■■■□□ 2.12
ACTB-201ENST00000331789 CUX2O14529 1486 aa28.27■■■□□ 2.12
ACTB-201ENST00000331789 PRXQ9BXM0 1461 aa28.27■■■□□ 2.12
ACTB-201ENST00000331789 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
ACTB-201ENST00000331789 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-201ENST00000331789 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ACTB-201ENST00000331789 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.21■■■□□ 2.11
ACTB-201ENST00000331789 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
ACTB-201ENST00000331789 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.17■■■□□ 2.1
ACTB-201ENST00000331789 IGF1RP08069 1367 aa28.14■■■□□ 2.09
ACTB-201ENST00000331789 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ACTB-201ENST00000331789 CLIP1P30622 1438 aa28.1■■■□□ 2.09
ACTB-201ENST00000331789 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-201ENST00000331789 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
ACTB-201ENST00000331789 WDR97A6NE52 1622 aa27.99■■■□□ 2.07
ACTB-201ENST00000331789 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.99■■■□□ 2.07
ACTB-201ENST00000331789 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-201ENST00000331789 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
ACTB-201ENST00000331789 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-201ENST00000331789 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
ACTB-201ENST00000331789 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.85■■■□□ 2.05
ACTB-201ENST00000331789 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
ACTB-201ENST00000331789 CUL7Q14999 1698 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-201ENST00000331789 HRCP23327 699 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-201ENST00000331789 ARAP1Q96P48 1450 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-201ENST00000331789 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.79■■■□□ 2.04
ACTB-201ENST00000331789 WDR62O43379 1518 aa27.75■■■□□ 2.03
ACTB-201ENST00000331789 ERCC6Q03468 1493 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTB-201ENST00000331789 PBRM1Q86U86 1689 aa27.64■■■□□ 2.02
ACTB-201ENST00000331789 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.013e-16■■■■■ 37.4
ACTB-201ENST00000331789 APLP2Q06481 763 aa27.63■■■□□ 2.01
ACTB-201ENST00000331789 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
ACTB-201ENST00000331789 IFT140Q96RY7 1462 aa27.61■■■□□ 2.01
ACTB-201ENST00000331789 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.6■■■□□ 2.01
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