RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.29■■■■□ 3.24
ACTB-207ENST00000462494 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.12■■■□□ 2.41
ACTB-207ENST00000462494 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.01■■■□□ 2.39
ACTB-207ENST00000462494 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
ACTB-207ENST00000462494 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ACTB-207ENST00000462494 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.41■■■□□ 2.3
ACTB-207ENST00000462494 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.91■■■□□ 2.22
ACTB-207ENST00000462494 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.6■■■□□ 2.17
ACTB-207ENST00000462494 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.45■■■□□ 2.14
ACTB-207ENST00000462494 SCRIBQ14160 1630 aa28.18■■■□□ 2.1
ACTB-207ENST00000462494 ABCC9O60706 1549 aa28.12■■■□□ 2.09
ACTB-207ENST00000462494 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ACTB-207ENST00000462494 NACADO15069 1562 aa27.79■■■□□ 2.04
ACTB-207ENST00000462494 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.79■■■□□ 2.04
ACTB-207ENST00000462494 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.68■■■□□ 2.02
ACTB-207ENST00000462494 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.6■■■□□ 2.01
ACTB-207ENST00000462494 HRCP23327 699 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-207ENST00000462494 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.54■■■□□ 2
ACTB-207ENST00000462494 TRIM41Q8WV44 630 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-207ENST00000462494 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
ACTB-207ENST00000462494 WIZO95785 1651 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTB-207ENST00000462494 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ACTB-207ENST00000462494 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ACTB-207ENST00000462494 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
ACTB-207ENST00000462494 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-207ENST00000462494 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ACTB-207ENST00000462494 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTB-207ENST00000462494 SMARCA4P51532 1647 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-207ENST00000462494 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ACTB-207ENST00000462494 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ACTB-207ENST00000462494 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-207ENST00000462494 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.875e-26■□□□□ 10.8
ACTB-207ENST00000462494 SMARCA2P51531 1590 aa26.7■■□□□ 1.86
ACTB-207ENST00000462494 ABCC8Q09428 1581 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-207ENST00000462494 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTB-207ENST00000462494 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ACTB-207ENST00000462494 SOGA1O94964 1423 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTB-207ENST00000462494 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTB-207ENST00000462494 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-207ENST00000462494 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTB-207ENST00000462494 CEP162Q5TB80 1403 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-207ENST00000462494 EEA1Q15075 1411 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-207ENST00000462494 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.793e-23■■□□□ 11.8
ACTB-207ENST00000462494 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-207ENST00000462494 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ACTB-207ENST00000462494 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-207ENST00000462494 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ACTB-207ENST00000462494 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ACTB-207ENST00000462494 SYNJ1O43426 1573 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-207ENST00000462494 GOLGA3Q08378 1498 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-207ENST00000462494 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
ACTB-207ENST00000462494 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-207ENST00000462494 KIF21BO75037 1637 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-207ENST00000462494 CLIP1P30622 1438 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-207ENST00000462494 TOP2BQ02880 1626 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-207ENST00000462494 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-207ENST00000462494 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ACTB-207ENST00000462494 NCAPD3P42695 1498 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-207ENST00000462494 HMGXB3Q12766 1538 aa25.69■■□□□ 1.7
ACTB-207ENST00000462494 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-207ENST00000462494 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.65■■□□□ 1.7
ACTB-207ENST00000462494 APLP2Q06481 763 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
ACTB-207ENST00000462494 CUX1P39880 1505 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-207ENST00000462494 CFTRP13569 1480 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-207ENST00000462494 PRXQ9BXM0 1461 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-207ENST00000462494 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-207ENST00000462494 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ACTB-207ENST00000462494 KIF27Q86VH2 1401 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-207ENST00000462494 ARAP1Q96P48 1450 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-207ENST00000462494 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
ACTB-207ENST00000462494 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ACTB-207ENST00000462494 PRDM2Q13029 1718 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-207ENST00000462494 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ACTB-207ENST00000462494 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-207ENST00000462494 CUX2O14529 1486 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-207ENST00000462494 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-207ENST00000462494 IGF1RP08069 1367 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-207ENST00000462494 NEUROD1Q13562 356 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-207ENST00000462494 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTB-207ENST00000462494 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-207ENST00000462494 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ACTB-207ENST00000462494 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-207ENST00000462494 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ACTB-207ENST00000462494 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-207ENST00000462494 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ACTB-207ENST00000462494 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-207ENST00000462494 ITGAEP38570 1179 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-207ENST00000462494 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-207ENST00000462494 MIER1Q8N108 512 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-207ENST00000462494 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTB-207ENST00000462494 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-207ENST00000462494 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-207ENST00000462494 P3H3Q8IVL6 736 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-207ENST00000462494 TIAM1Q13009 1591 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-207ENST00000462494 NESP48681 1621 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-207ENST00000462494 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-207ENST00000462494 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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