RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.26■■■□□ 2.91
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C9orf3-212ENST00000468164 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.28■■■□□ 2.12
C9orf3-212ENST00000468164 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.13■■■□□ 2.09
C9orf3-212ENST00000468164 NACADO15069 1562 aa28.08■■■□□ 2.09
C9orf3-212ENST00000468164 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.81■■■□□ 2.04
C9orf3-212ENST00000468164 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.66■■■□□ 2.02
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C9orf3-212ENST00000468164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.41■■□□□ 1.98
C9orf3-212ENST00000468164 SCRIBQ14160 1630 aa27.27■■□□□ 1.96
C9orf3-212ENST00000468164 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf3-212ENST00000468164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.79■■□□□ 1.88
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C9orf3-212ENST00000468164 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.62■■□□□ 1.85
C9orf3-212ENST00000468164 SMARCA4P51532 1647 aa25.97■■□□□ 1.75
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C9orf3-212ENST00000468164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.85■■□□□ 1.73
C9orf3-212ENST00000468164 SMARCA2P51531 1590 aa25.83■■□□□ 1.73
C9orf3-212ENST00000468164 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
C9orf3-212ENST00000468164 HMGXB3Q12766 1538 aa25.74■■□□□ 1.71
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C9orf3-212ENST00000468164 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.66■■□□□ 1.7
C9orf3-212ENST00000468164 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.62■■□□□ 1.69
C9orf3-212ENST00000468164 ERCC6Q03468 1493 aa25.59■■□□□ 1.69
C9orf3-212ENST00000468164 NESP48681 1621 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-212ENST00000468164 WIZO95785 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
C9orf3-212ENST00000468164 CUX2O14529 1486 aa25.36■■□□□ 1.65
C9orf3-212ENST00000468164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf3-212ENST00000468164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.3■■□□□ 1.64
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C9orf3-212ENST00000468164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf3-212ENST00000468164 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf3-212ENST00000468164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-212ENST00000468164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-212ENST00000468164 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf3-212ENST00000468164 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf3-212ENST00000468164 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.89■■□□□ 1.57
C9orf3-212ENST00000468164 PRDM2Q13029 1718 aa24.88■■□□□ 1.57
C9orf3-212ENST00000468164 WDR62O43379 1518 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf3-212ENST00000468164 CFTRP13569 1480 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf3-212ENST00000468164 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-212ENST00000468164 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
C9orf3-212ENST00000468164 TOPBP1Q92547 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
C9orf3-212ENST00000468164 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.39■■□□□ 1.5
C9orf3-212ENST00000468164 IFT140Q96RY7 1462 aa24.36■■□□□ 1.49
C9orf3-212ENST00000468164 ABCC8Q09428 1581 aa24.36■■□□□ 1.49
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
C9orf3-212ENST00000468164 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
C9orf3-212ENST00000468164 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
C9orf3-212ENST00000468164 OSCARQ8IYS5 282 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf3-212ENST00000468164 TRIM41Q8WV44 630 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf3-212ENST00000468164 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
C9orf3-212ENST00000468164 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-212ENST00000468164 CHD1O14646 1710 aa24.15■■□□□ 1.46
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C9orf3-212ENST00000468164 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.13■■□□□ 1.45
C9orf3-212ENST00000468164 CUX1P39880 1505 aa24.1■■□□□ 1.45
C9orf3-212ENST00000468164 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.1■■□□□ 1.45
C9orf3-212ENST00000468164 SOGA1O94964 1423 aa24.09■■□□□ 1.45
C9orf3-212ENST00000468164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
C9orf3-212ENST00000468164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.02■■□□□ 1.44
C9orf3-212ENST00000468164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.02■■□□□ 1.44
C9orf3-212ENST00000468164 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.02■■□□□ 1.44
C9orf3-212ENST00000468164 FBLN2P98095 1184 aa24.01■■□□□ 1.43
C9orf3-212ENST00000468164 WDR97A6NE52 1622 aa23.98■■□□□ 1.43
C9orf3-212ENST00000468164 PBRM1Q86U86 1689 aa23.94■■□□□ 1.42
C9orf3-212ENST00000468164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.92■■□□□ 1.42
C9orf3-212ENST00000468164 ARHGEF11O15085 1522 aa23.91■■□□□ 1.42
C9orf3-212ENST00000468164 GRIN2BQ13224 1484 aa23.84■■□□□ 1.41
C9orf3-212ENST00000468164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.82■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.81■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 SYNJ1O43426 1573 aa23.8■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.8■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 TOP2BQ02880 1626 aa23.79■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.78■■□□□ 1.4
C9orf3-212ENST00000468164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
C9orf3-212ENST00000468164 SYNJ2O15056 1496 aa23.74■■□□□ 1.39
C9orf3-212ENST00000468164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.73■■□□□ 1.39
C9orf3-212ENST00000468164 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.71■■□□□ 1.39
C9orf3-212ENST00000468164 ARAP1Q96P48 1450 aa23.67■■□□□ 1.38
C9orf3-212ENST00000468164 ADAMTS12P58397 1594 aa23.61■■□□□ 1.37
C9orf3-212ENST00000468164 GRIN2AQ12879 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
C9orf3-212ENST00000468164 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf3-212ENST00000468164 CEP170Q5SW79 1584 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf3-212ENST00000468164 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-212ENST00000468164 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-212ENST00000468164 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.42■■□□□ 1.34
C9orf3-212ENST00000468164 NUP160Q12769 1436 aa23.41■■□□□ 1.34
C9orf3-212ENST00000468164 SHROOM2Q13796 1616 aa23.36■■□□□ 1.33
C9orf3-212ENST00000468164 KIF27Q86VH2 1401 aa23.3■■□□□ 1.32
C9orf3-212ENST00000468164 CUL7Q14999 1698 aa23.29■■□□□ 1.32
C9orf3-212ENST00000468164 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.28■■□□□ 1.32
C9orf3-212ENST00000468164 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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