RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.97■■■■■ 6.87
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C9orf3-215ENST00000478473 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.62■■■■■ 4.73
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C9orf3-215ENST00000478473 ERCC6Q03468 1493 aa43.93■■■■■ 4.62
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C9orf3-215ENST00000478473 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.12■■■■■ 4.49
C9orf3-215ENST00000478473 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.1■■■■■ 4.49
C9orf3-215ENST00000478473 WDR62O43379 1518 aa43.07■■■■■ 4.49
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.01■■■■■ 4.48
C9orf3-215ENST00000478473 PRDM2Q13029 1718 aa42.86■■■■■ 4.45
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C9orf3-215ENST00000478473 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
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C9orf3-215ENST00000478473 SHROOM2Q13796 1616 aa40.49■■■■■ 4.07
C9orf3-215ENST00000478473 CUL7Q14999 1698 aa40.41■■■■■ 4.06
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C9orf3-215ENST00000478473 JPH4Q96JJ6 628 aa40.27■■■■■ 4.04
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