RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.95■■■■■ 5.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.11■■■■■ 4.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC9O60706 1549 aa40.06■■■■■ 4
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.7■■■■□ 3.95
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.63■■■■□ 3.94
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.41■■■■□ 3.9
PACSIN3-201ENST00000298838 NACADO15069 1562 aa39.28■■■■□ 3.88
PACSIN3-201ENST00000298838 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.05■■■■□ 3.84
PACSIN3-201ENST00000298838 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.71■■■■□ 3.79
PACSIN3-201ENST00000298838 SCRIBQ14160 1630 aa38.57■■■■□ 3.77
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.23■■■■□ 3.71
PACSIN3-201ENST00000298838 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.82■■■■□ 3.64
PACSIN3-201ENST00000298838 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.64■■■■□ 3.629e-7■□□□□ 8.3
PACSIN3-201ENST00000298838 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.24■■■■□ 3.55
PACSIN3-201ENST00000298838 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PACSIN3-201ENST00000298838 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH2BQ7Z745 1585 aa37■■■■□ 3.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCA4P51532 1647 aa36.98■■■■□ 3.51
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
PACSIN3-201ENST00000298838 WIZO95785 1651 aa36.69■■■■□ 3.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.57■■■■□ 3.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCA2P51531 1590 aa36.47■■■■□ 3.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.44■■■■□ 3.42
PACSIN3-201ENST00000298838 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.3■■■■□ 3.4
PACSIN3-201ENST00000298838 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
PACSIN3-201ENST00000298838 NCAPD3P42695 1498 aa36.21■■■■□ 3.39
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGXB3Q12766 1538 aa36.18■■■■□ 3.38
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.9■■■■□ 3.34
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.62■■■■□ 3.29
PACSIN3-201ENST00000298838 CFTRP13569 1480 aa35.29■■■■□ 3.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.24■■■■□ 3.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.23■■■■□ 3.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDM2Q13029 1718 aa35.18■■■■□ 3.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.1■■■■□ 3.21
PACSIN3-201ENST00000298838 NESP48681 1621 aa35.03■■■■□ 3.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC8Q09428 1581 aa35.01■■■■□ 3.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM41Q8WV44 630 aa34.9■■■■□ 3.18
PACSIN3-201ENST00000298838 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.86■■■■□ 3.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.81■■■■□ 3.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNJ1O43426 1573 aa34.74■■■■□ 3.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.71■■■■□ 3.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.68■■■■□ 3.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TOP2BQ02880 1626 aa34.67■■■■□ 3.14
PACSIN3-201ENST00000298838 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.65■■■■□ 3.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CUX1P39880 1505 aa34.64■■■■□ 3.14
PACSIN3-201ENST00000298838 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.5■■■■□ 3.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ERCC6Q03468 1493 aa34.45■■■■□ 3.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TOPBP1Q92547 1522 aa34.44■■■■□ 3.1
PACSIN3-201ENST00000298838 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
PACSIN3-201ENST00000298838 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.39■■■■□ 3.1
PACSIN3-201ENST00000298838 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.34■■■■□ 3.09
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR62O43379 1518 aa34.25■■■■□ 3.07
PACSIN3-201ENST00000298838 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SOGA1O94964 1423 aa34.24■■■■□ 3.07
PACSIN3-201ENST00000298838 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
PACSIN3-201ENST00000298838 EEA1Q15075 1411 aa34.19■■■■□ 3.06
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
PACSIN3-201ENST00000298838 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.12■■■■□ 3.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.08■■■■□ 3.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF27Q86VH2 1401 aa34.04■■■■□ 3.04
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.04■■■■□ 3.04
PACSIN3-201ENST00000298838 CUX2O14529 1486 aa34.03■■■■□ 3.04
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR97A6NE52 1622 aa34.01■■■■□ 3.03
PACSIN3-201ENST00000298838 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PACSIN3-201ENST00000298838 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.95■■■■□ 3.03
PACSIN3-201ENST00000298838 IFT140Q96RY7 1462 aa33.91■■■■□ 3.02
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.83■■■■□ 3.01
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.82■■■■□ 3
PACSIN3-201ENST00000298838 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF21BO75037 1637 aa33.77■■■■□ 3
PACSIN3-201ENST00000298838 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.74■■■□□ 2.99
PACSIN3-201ENST00000298838 IGF1RP08069 1367 aa33.72■■■□□ 2.99
PACSIN3-201ENST00000298838 PRXQ9BXM0 1461 aa33.69■■■□□ 2.98
PACSIN3-201ENST00000298838 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.68■■■□□ 2.98
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA3Q08378 1498 aa33.67■■■□□ 2.98
PACSIN3-201ENST00000298838 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.66■■■□□ 2.98
PACSIN3-201ENST00000298838 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.64■■■□□ 2.989e-7■■■■□ 19.7
PACSIN3-201ENST00000298838 PBRM1Q86U86 1689 aa33.63■■■□□ 2.97
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
PACSIN3-201ENST00000298838 CUL7Q14999 1698 aa33.62■■■□□ 2.97
PACSIN3-201ENST00000298838 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.6■■■□□ 2.97
PACSIN3-201ENST00000298838 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.56■■■□□ 2.96
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIN2BQ13224 1484 aa33.56■■■□□ 2.96
PACSIN3-201ENST00000298838 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
PACSIN3-201ENST00000298838 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.45■■■□□ 2.94
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS12P58397 1594 aa33.41■■■□□ 2.94
PACSIN3-201ENST00000298838 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.38■■■□□ 2.93
PACSIN3-201ENST00000298838 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.37■■■□□ 2.93
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP162Q5TB80 1403 aa33.25■■■□□ 2.91
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNJ2O15056 1496 aa33.2■■■□□ 2.91
PACSIN3-201ENST00000298838 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.18■■■□□ 2.9
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIN2AQ12879 1464 aa33.15■■■□□ 2.9
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
PACSIN3-201ENST00000298838 CLIP1P30622 1438 aa33.09■■■□□ 2.89
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