RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.78■■■■■ 5.72
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.89■■■■■ 4.78
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCC9O60706 1549 aa43.36■■■■■ 4.53
PACSIN3-209ENST00000532457 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.27■■■■■ 4.36
PACSIN3-209ENST00000532457 NACADO15069 1562 aa42.09■■■■■ 4.33
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.07■■■■■ 4.32
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
PACSIN3-209ENST00000532457 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42■■■■■ 4.31
PACSIN3-209ENST00000532457 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.11■■■■■ 4.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SCRIBQ14160 1630 aa40.99■■■■■ 4.15
PACSIN3-209ENST00000532457 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.98■■■■■ 4.15
PACSIN3-209ENST00000532457 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.63■■■■■ 4.09
PACSIN3-209ENST00000532457 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.099e-7■□□□□ 8.3
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
PACSIN3-209ENST00000532457 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.45■■■■□ 3.91
PACSIN3-209ENST00000532457 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
PACSIN3-209ENST00000532457 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SMARCA4P51532 1647 aa39.27■■■■□ 3.88
PACSIN3-209ENST00000532457 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.25■■■■□ 3.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.23■■■■□ 3.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
PACSIN3-209ENST00000532457 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.13■■■■□ 3.85
PACSIN3-209ENST00000532457 SMARCA2P51531 1590 aa38.94■■■■□ 3.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.92■■■■□ 3.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.89■■■■□ 3.82
PACSIN3-209ENST00000532457 NCAPD3P42695 1498 aa38.82■■■■□ 3.81
PACSIN3-209ENST00000532457 WIZO95785 1651 aa38.77■■■■□ 3.8
PACSIN3-209ENST00000532457 HMGXB3Q12766 1538 aa38.69■■■■□ 3.78
PACSIN3-209ENST00000532457 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
PACSIN3-209ENST00000532457 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.99■■■■□ 3.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.74■■■■□ 3.63
PACSIN3-209ENST00000532457 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.73■■■■□ 3.63
PACSIN3-209ENST00000532457 NESP48681 1621 aa37.66■■■■□ 3.62
PACSIN3-209ENST00000532457 CFTRP13569 1480 aa37.62■■■■□ 3.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.52■■■■□ 3.6
PACSIN3-209ENST00000532457 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.49■■■■□ 3.59
PACSIN3-209ENST00000532457 ERCC6Q03468 1493 aa37.39■■■■□ 3.58
PACSIN3-209ENST00000532457 PRDM2Q13029 1718 aa37.37■■■■□ 3.57
PACSIN3-209ENST00000532457 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.3■■■■□ 3.56
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.25■■■■□ 3.55
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.21■■■■□ 3.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCC8Q09428 1581 aa37.05■■■■□ 3.52
PACSIN3-209ENST00000532457 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.01■■■■□ 3.52
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM41Q8WV44 630 aa36.99■■■■□ 3.51
PACSIN3-209ENST00000532457 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR62O43379 1518 aa36.86■■■■□ 3.49
PACSIN3-209ENST00000532457 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PACSIN3-209ENST00000532457 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.81■■■■□ 3.48
PACSIN3-209ENST00000532457 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.77■■■■□ 3.48
PACSIN3-209ENST00000532457 CUX2O14529 1486 aa36.77■■■■□ 3.48
PACSIN3-209ENST00000532457 TOPBP1Q92547 1522 aa36.75■■■■□ 3.47
PACSIN3-209ENST00000532457 SYNJ1O43426 1573 aa36.7■■■■□ 3.47
PACSIN3-209ENST00000532457 CUX1P39880 1505 aa36.66■■■■□ 3.46
PACSIN3-209ENST00000532457 TOP2BQ02880 1626 aa36.53■■■■□ 3.44
PACSIN3-209ENST00000532457 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.51■■■■□ 3.44
PACSIN3-209ENST00000532457 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
PACSIN3-209ENST00000532457 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.47■■■■□ 3.43
PACSIN3-209ENST00000532457 IFT140Q96RY7 1462 aa36.41■■■■□ 3.42
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
PACSIN3-209ENST00000532457 SOGA1O94964 1423 aa36.37■■■■□ 3.41
PACSIN3-209ENST00000532457 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.29■■■■□ 3.4
PACSIN3-209ENST00000532457 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
PACSIN3-209ENST00000532457 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.26■■■■□ 3.39
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.17■■■■□ 3.38
PACSIN3-209ENST00000532457 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.15■■■■□ 3.38
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR97A6NE52 1622 aa36.1■■■■□ 3.37
PACSIN3-209ENST00000532457 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PACSIN3-209ENST00000532457 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.369e-7■■■■□ 19.7
PACSIN3-209ENST00000532457 EEA1Q15075 1411 aa36.01■■■■□ 3.35
PACSIN3-209ENST00000532457 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36■■■■□ 3.35
PACSIN3-209ENST00000532457 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.96■■■■□ 3.35
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.94■■■■□ 3.34
PACSIN3-209ENST00000532457 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.92■■■■□ 3.34
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF27Q86VH2 1401 aa35.91■■■■□ 3.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GRIN2BQ13224 1484 aa35.88■■■■□ 3.33
PACSIN3-209ENST00000532457 PBRM1Q86U86 1689 aa35.81■■■■□ 3.32
PACSIN3-209ENST00000532457 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.76■■■■□ 3.31
PACSIN3-209ENST00000532457 IGF1RP08069 1367 aa35.73■■■■□ 3.31
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PACSIN3-209ENST00000532457 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.71■■■■□ 3.31
PACSIN3-209ENST00000532457 PRXQ9BXM0 1461 aa35.61■■■■□ 3.29
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF21BO75037 1637 aa35.59■■■■□ 3.29
PACSIN3-209ENST00000532457 SYNJ2O15056 1496 aa35.58■■■■□ 3.29
PACSIN3-209ENST00000532457 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.57■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 FBLN2P98095 1184 aa35.57■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.56■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMTS12P58397 1594 aa35.55■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 CUL7Q14999 1698 aa35.55■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA3Q08378 1498 aa35.53■■■■□ 3.28
PACSIN3-209ENST00000532457 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.49■■■■□ 3.27
PACSIN3-209ENST00000532457 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CHD1O14646 1710 aa35.45■■■■□ 3.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.41■■■■□ 3.26
PACSIN3-209ENST00000532457 OSCARQ8IYS5 282 aa35.4■■■■□ 3.26
PACSIN3-209ENST00000532457 GRIN2AQ12879 1464 aa35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms