RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf3-211ENST00000463372 SMARCA4P51532 1647 aa27.77■■■□□ 2.04
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C9orf3-211ENST00000463372 ARAP1Q96P48 1450 aa27.12■■□□□ 1.93
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C9orf3-211ENST00000463372 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.19■■□□□ 1.78
C9orf3-211ENST00000463372 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.18■■□□□ 1.78
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C9orf3-211ENST00000463372 DIP2BQ9P265 1576 aa25.68■■□□□ 1.7
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C9orf3-211ENST00000463372 SHROOM2Q13796 1616 aa25.65■■□□□ 1.7
C9orf3-211ENST00000463372 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
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C9orf3-211ENST00000463372 MAPKBP1O60336 1514 aa25.61■■□□□ 1.69
C9orf3-211ENST00000463372 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.56■■□□□ 1.68
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