RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.94■■■■■ 5.58
ACTB-212ENST00000484841 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.79■■■■■ 4.76
ACTB-212ENST00000484841 ABCC9O60706 1549 aa44.57■■■■■ 4.73
ACTB-212ENST00000484841 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.57■■■■■ 4.41
ACTB-212ENST00000484841 NACADO15069 1562 aa42.3■■■■■ 4.36
ACTB-212ENST00000484841 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.24■■■■■ 4.35
ACTB-212ENST00000484841 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.71■■■■■ 4.27
ACTB-212ENST00000484841 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.58■■■■■ 4.25
ACTB-212ENST00000484841 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.5■■■■■ 4.23
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
ACTB-212ENST00000484841 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.25■■■■■ 4.19
ACTB-212ENST00000484841 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.17■■■■■ 4.18
ACTB-212ENST00000484841 SCRIBQ14160 1630 aa40.82■■■■■ 4.13
ACTB-212ENST00000484841 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.73■■■■■ 4.11
ACTB-212ENST00000484841 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.27■■■■■ 4.04
ACTB-212ENST00000484841 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
ACTB-212ENST00000484841 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.13■■■■■ 4.02
ACTB-212ENST00000484841 NCAPD3P42695 1498 aa38.98■■■■□ 3.83
ACTB-212ENST00000484841 SMARCA4P51532 1647 aa38.94■■■■□ 3.82
ACTB-212ENST00000484841 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.89■■■■□ 3.82
ACTB-212ENST00000484841 SMARCA2P51531 1590 aa38.87■■■■□ 3.81
ACTB-212ENST00000484841 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
ACTB-212ENST00000484841 HMGXB3Q12766 1538 aa38.73■■■■□ 3.79
ACTB-212ENST00000484841 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
ACTB-212ENST00000484841 ERCC6Q03468 1493 aa38.55■■■■□ 3.76
ACTB-212ENST00000484841 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.51■■■■□ 3.76
ACTB-212ENST00000484841 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.45■■■■□ 3.75
ACTB-212ENST00000484841 CUX2O14529 1486 aa38.35■■■■□ 3.73
ACTB-212ENST00000484841 NESP48681 1621 aa38.29■■■■□ 3.72
ACTB-212ENST00000484841 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.15■■■■□ 3.7
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.07■■■■□ 3.68
ACTB-212ENST00000484841 WIZO95785 1651 aa38.06■■■■□ 3.68
ACTB-212ENST00000484841 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.94■■■■□ 3.66
ACTB-212ENST00000484841 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.88■■■■□ 3.66
ACTB-212ENST00000484841 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
ACTB-212ENST00000484841 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.84■■■■□ 3.65
ACTB-212ENST00000484841 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
ACTB-212ENST00000484841 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
ACTB-212ENST00000484841 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.56■■■■□ 3.6
ACTB-212ENST00000484841 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.48■■■■□ 3.59
ACTB-212ENST00000484841 WDR62O43379 1518 aa37.43■■■■□ 3.58
ACTB-212ENST00000484841 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.42■■■■□ 3.58
ACTB-212ENST00000484841 CFTRP13569 1480 aa37.41■■■■□ 3.58
ACTB-212ENST00000484841 PRDM2Q13029 1718 aa37.19■■■■□ 3.54
ACTB-212ENST00000484841 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.14■■■■□ 3.54
ACTB-212ENST00000484841 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
ACTB-212ENST00000484841 ABCC8Q09428 1581 aa36.74■■■■□ 3.47
ACTB-212ENST00000484841 TOPBP1Q92547 1522 aa36.72■■■■□ 3.47
ACTB-212ENST00000484841 IFT140Q96RY7 1462 aa36.7■■■■□ 3.47
ACTB-212ENST00000484841 OSCARQ8IYS5 282 aa36.68■■■■□ 3.46
ACTB-212ENST00000484841 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.63■■■■□ 3.45
ACTB-212ENST00000484841 TRIM41Q8WV44 630 aa36.59■■■■□ 3.45
ACTB-212ENST00000484841 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
ACTB-212ENST00000484841 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
ACTB-212ENST00000484841 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
ACTB-212ENST00000484841 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
ACTB-212ENST00000484841 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
ACTB-212ENST00000484841 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.29■■■■□ 3.43e-16■■■■■ 41.8
ACTB-212ENST00000484841 SOGA1O94964 1423 aa36.24■■■■□ 3.39
ACTB-212ENST00000484841 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.2■■■■□ 3.39
ACTB-212ENST00000484841 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.17■■■■□ 3.38
ACTB-212ENST00000484841 CHD1O14646 1710 aa36.16■■■■□ 3.38
ACTB-212ENST00000484841 FBLN2P98095 1184 aa36.14■■■■□ 3.38
ACTB-212ENST00000484841 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.13■■■■□ 3.37
ACTB-212ENST00000484841 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.13■■■■□ 3.37
ACTB-212ENST00000484841 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.13■■■■□ 3.37
ACTB-212ENST00000484841 CUX1P39880 1505 aa36.13■■■■□ 3.37
ACTB-212ENST00000484841 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
ACTB-212ENST00000484841 WDR97A6NE52 1622 aa36.08■■■■□ 3.37
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF11O15085 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
ACTB-212ENST00000484841 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.94■■■■□ 3.34
ACTB-212ENST00000484841 GRIN2BQ13224 1484 aa35.89■■■■□ 3.34
ACTB-212ENST00000484841 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
ACTB-212ENST00000484841 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
ACTB-212ENST00000484841 PBRM1Q86U86 1689 aa35.81■■■■□ 3.32
ACTB-212ENST00000484841 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.8■■■■□ 3.32
ACTB-212ENST00000484841 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.8■■■■□ 3.32
ACTB-212ENST00000484841 SYNJ1O43426 1573 aa35.77■■■■□ 3.32
ACTB-212ENST00000484841 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.76■■■■□ 3.31
ACTB-212ENST00000484841 SYNJ2O15056 1496 aa35.74■■■■□ 3.31
ACTB-212ENST00000484841 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.313e-23■■□□□ 11.8
ACTB-212ENST00000484841 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.68■■■■□ 3.3
ACTB-212ENST00000484841 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.66■■■■□ 3.3
ACTB-212ENST00000484841 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.65■■■■□ 3.3
ACTB-212ENST00000484841 TOP2BQ02880 1626 aa35.65■■■■□ 3.3
ACTB-212ENST00000484841 ARAP1Q96P48 1450 aa35.64■■■■□ 3.3
ACTB-212ENST00000484841 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS12P58397 1594 aa35.42■■■■□ 3.26
ACTB-212ENST00000484841 GRIN2AQ12879 1464 aa35.41■■■■□ 3.26
ACTB-212ENST00000484841 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.34■■■■□ 3.25
ACTB-212ENST00000484841 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.34■■■■□ 3.25
ACTB-212ENST00000484841 CEP170Q5SW79 1584 aa35.25■■■■□ 3.23
ACTB-212ENST00000484841 NUP160Q12769 1436 aa35.24■■■■□ 3.23
ACTB-212ENST00000484841 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.09■■■■□ 3.21
ACTB-212ENST00000484841 SHROOM2Q13796 1616 aa35.08■■■■□ 3.21
ACTB-212ENST00000484841 KIF27Q86VH2 1401 aa35.01■■■■□ 3.2
ACTB-212ENST00000484841 JPH4Q96JJ6 628 aa34.96■■■■□ 3.19
ACTB-212ENST00000484841 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
ACTB-212ENST00000484841 CUL7Q14999 1698 aa34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms