Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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