RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.12■■□□□ 1.93
LRRN1-201ENST00000319331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
LRRN1-201ENST00000319331 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRN1-201ENST00000319331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRN1-201ENST00000319331 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRN1-201ENST00000319331 HRCP23327 699 aa24.5■■□□□ 1.51
LRRN1-201ENST00000319331 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LRRN1-201ENST00000319331 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.24■■□□□ 1.47
LRRN1-201ENST00000319331 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.95■■□□□ 1.43
LRRN1-201ENST00000319331 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.91■■□□□ 1.42
LRRN1-201ENST00000319331 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
LRRN1-201ENST00000319331 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
LRRN1-201ENST00000319331 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LRRN1-201ENST00000319331 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LRRN1-201ENST00000319331 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRN1-201ENST00000319331 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM41Q8WV44 630 aa23.27■■□□□ 1.32
LRRN1-201ENST00000319331 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
LRRN1-201ENST00000319331 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LRRN1-201ENST00000319331 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
LRRN1-201ENST00000319331 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.04■■□□□ 1.28
LRRN1-201ENST00000319331 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRN1-201ENST00000319331 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LRRN1-201ENST00000319331 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRRN1-201ENST00000319331 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.78■■□□□ 1.24
LRRN1-201ENST00000319331 NEUROD1Q13562 356 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRN1-201ENST00000319331 MYT1Q01538 1121 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRN1-201ENST00000319331 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LRRN1-201ENST00000319331 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
LRRN1-201ENST00000319331 ABCC9O60706 1549 aa22.59■■□□□ 1.21
LRRN1-201ENST00000319331 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LRRN1-201ENST00000319331 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
LRRN1-201ENST00000319331 APLP2Q06481 763 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LRRN1-201ENST00000319331 BCANQ96GW7 911 aa22.06■■□□□ 1.12
LRRN1-201ENST00000319331 MIER1Q8N108 512 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRN1-201ENST00000319331 SCRIBQ14160 1630 aa21.98■■□□□ 1.11
LRRN1-201ENST00000319331 ITGAEP38570 1179 aa21.95■■□□□ 1.1
LRRN1-201ENST00000319331 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRN1-201ENST00000319331 NEFLP07196 543 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRN1-201ENST00000319331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LRRN1-201ENST00000319331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
LRRN1-201ENST00000319331 NACADO15069 1562 aa21.67■■□□□ 1.06
LRRN1-201ENST00000319331 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LRRN1-201ENST00000319331 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRN1-201ENST00000319331 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.56■■□□□ 1.04
LRRN1-201ENST00000319331 FKBP8Q14318 412 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRN1-201ENST00000319331 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRRN1-201ENST00000319331 CEP162Q5TB80 1403 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRN1-201ENST00000319331 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRN1-201ENST00000319331 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM52Q96A61 297 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRN1-201ENST00000319331 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LRRN1-201ENST00000319331 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRN1-201ENST00000319331 BCL11AQ9H165 835 aa21.34■■□□□ 1.01
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LRRN1-201ENST00000319331 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.29■■□□□ 1
LRRN1-201ENST00000319331 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
LRRN1-201ENST00000319331 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
LRRN1-201ENST00000319331 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.21■□□□□ 0.99
LRRN1-201ENST00000319331 SOGA1O94964 1423 aa21.2■□□□□ 0.98
LRRN1-201ENST00000319331 ANP32CO43423 234 aa21.18■□□□□ 0.98
LRRN1-201ENST00000319331 KCNH8Q96L42 1107 aa21.18■□□□□ 0.98
LRRN1-201ENST00000319331 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
LRRN1-201ENST00000319331 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.13■□□□□ 0.97
LRRN1-201ENST00000319331 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.12■□□□□ 0.97
LRRN1-201ENST00000319331 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.11■□□□□ 0.97
LRRN1-201ENST00000319331 CLIP1P30622 1438 aa21.09■□□□□ 0.97
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.07■□□□□ 0.96
LRRN1-201ENST00000319331 ABCC8Q09428 1581 aa21.04■□□□□ 0.96
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LRRN1-201ENST00000319331 NBR1Q14596 966 aa20.99■□□□□ 0.95
LRRN1-201ENST00000319331 P3H3Q8IVL6 736 aa20.98■□□□□ 0.95
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA3Q08378 1498 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRN1-201ENST00000319331 WIZO95785 1651 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRN1-201ENST00000319331 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRN1-201ENST00000319331 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRN1-201ENST00000319331 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
LRRN1-201ENST00000319331 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRN1-201ENST00000319331 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.86■□□□□ 0.93
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LRRN1-201ENST00000319331 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
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LRRN1-201ENST00000319331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.81■□□□□ 0.92
LRRN1-201ENST00000319331 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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LRRN1-201ENST00000319331 SMARCA4P51532 1647 aa20.73■□□□□ 0.91
LRRN1-201ENST00000319331 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
LRRN1-201ENST00000319331 TONSLQ96HA7 1378 aa20.69■□□□□ 0.9
LRRN1-201ENST00000319331 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.69■□□□□ 0.9
LRRN1-201ENST00000319331 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.68■□□□□ 0.9
LRRN1-201ENST00000319331 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.67■□□□□ 0.9
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
LRRN1-201ENST00000319331 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
LRRN1-201ENST00000319331 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LRRN1-201ENST00000319331 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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