RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354308.7

SYT5-201, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT5, Length 3,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-201ENST00000354308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.94■■■□□ 2.38
SYT5-201ENST00000354308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.92■■□□□ 1.9
SYT5-201ENST00000354308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.47■■□□□ 1.83
SYT5-201ENST00000354308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SYT5-201ENST00000354308 ABCC9O60706 1549 aa25.25■■□□□ 1.63
SYT5-201ENST00000354308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT5-201ENST00000354308 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SYT5-201ENST00000354308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SYT5-201ENST00000354308 HRCP23327 699 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT5-201ENST00000354308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
SYT5-201ENST00000354308 MYT1Q01538 1121 aa24.44■■□□□ 1.5
SYT5-201ENST00000354308 SCRIBQ14160 1630 aa24.44■■□□□ 1.5
SYT5-201ENST00000354308 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SYT5-201ENST00000354308 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.41■■□□□ 1.5
SYT5-201ENST00000354308 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT5-201ENST00000354308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT5-201ENST00000354308 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SYT5-201ENST00000354308 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.01■■□□□ 1.43
SYT5-201ENST00000354308 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.85■■□□□ 1.41
SYT5-201ENST00000354308 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.81■■□□□ 1.4
SYT5-201ENST00000354308 NACADO15069 1562 aa23.74■■□□□ 1.39
SYT5-201ENST00000354308 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SYT5-201ENST00000354308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SYT5-201ENST00000354308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.68■■□□□ 1.38
SYT5-201ENST00000354308 TRIM41Q8WV44 630 aa23.67■■□□□ 1.38
SYT5-201ENST00000354308 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.64■■□□□ 1.37
SYT5-201ENST00000354308 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.49■■□□□ 1.35
SYT5-201ENST00000354308 WIZO95785 1651 aa23.29■■□□□ 1.32
SYT5-201ENST00000354308 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYT5-201ENST00000354308 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYT5-201ENST00000354308 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYT5-201ENST00000354308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYT5-201ENST00000354308 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.2■■□□□ 1.3
SYT5-201ENST00000354308 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYT5-201ENST00000354308 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SYT5-201ENST00000354308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT5-201ENST00000354308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYT5-201ENST00000354308 NEUROD1Q13562 356 aa22.98■■□□□ 1.27
SYT5-201ENST00000354308 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.96■■□□□ 1.27
SYT5-201ENST00000354308 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SYT5-201ENST00000354308 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.88■■□□□ 1.25
SYT5-201ENST00000354308 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SYT5-201ENST00000354308 SMARCA4P51532 1647 aa22.86■■□□□ 1.25
SYT5-201ENST00000354308 ABCC8Q09428 1581 aa22.82■■□□□ 1.24
SYT5-201ENST00000354308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYT5-201ENST00000354308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.72■■□□□ 1.23
SYT5-201ENST00000354308 BCL11AQ9H165 835 aa22.66■■□□□ 1.22
SYT5-201ENST00000354308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.66■■□□□ 1.22
SYT5-201ENST00000354308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYT5-201ENST00000354308 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SYT5-201ENST00000354308 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYT5-201ENST00000354308 SOGA1O94964 1423 aa22.57■■□□□ 1.2
SYT5-201ENST00000354308 SMARCA2P51531 1590 aa22.54■■□□□ 1.2
SYT5-201ENST00000354308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.5■■□□□ 1.19
SYT5-201ENST00000354308 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.5■■□□□ 1.19
SYT5-201ENST00000354308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SYT5-201ENST00000354308 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
SYT5-201ENST00000354308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SYT5-201ENST00000354308 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SYT5-201ENST00000354308 P3H3Q8IVL6 736 aa22.25■■□□□ 1.15
SYT5-201ENST00000354308 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT5-201ENST00000354308 APLP2Q06481 763 aa22.17■■□□□ 1.14
SYT5-201ENST00000354308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT5-201ENST00000354308 NCAPD3P42695 1498 aa22.15■■□□□ 1.14
SYT5-201ENST00000354308 NESP48681 1621 aa22.14■■□□□ 1.13
SYT5-201ENST00000354308 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYT5-201ENST00000354308 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT5-201ENST00000354308 SYNJ1O43426 1573 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT5-201ENST00000354308 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYT5-201ENST00000354308 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.05■■□□□ 1.12
SYT5-201ENST00000354308 ITGAEP38570 1179 aa22.04■■□□□ 1.12
SYT5-201ENST00000354308 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.02■■□□□ 1.12
SYT5-201ENST00000354308 CEP162Q5TB80 1403 aa22.01■■□□□ 1.11
SYT5-201ENST00000354308 ARID3CA6NKF2 412 aa22■■□□□ 1.11
SYT5-201ENST00000354308 FBLN2P98095 1184 aa21.93■■□□□ 1.1
SYT5-201ENST00000354308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.91■■□□□ 1.1
SYT5-201ENST00000354308 CUX2O14529 1486 aa21.88■■□□□ 1.09
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SYT5-201ENST00000354308 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYT5-201ENST00000354308 CFTRP13569 1480 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT5-201ENST00000354308 BCANQ96GW7 911 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT5-201ENST00000354308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.84■■□□□ 1.09
SYT5-201ENST00000354308 HMGXB3Q12766 1538 aa21.83■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 CLIP1P30622 1438 aa21.82■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 EEA1Q15075 1411 aa21.82■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 GOLGA3Q08378 1498 aa21.82■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.82■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 CUX1P39880 1505 aa21.82■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.81■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 KIF27Q86VH2 1401 aa21.77■■□□□ 1.08
SYT5-201ENST00000354308 MIER1Q8N108 512 aa21.76■■□□□ 1.07
SYT5-201ENST00000354308 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.72■■□□□ 1.07
SYT5-201ENST00000354308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.71■■□□□ 1.07
SYT5-201ENST00000354308 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SYT5-201ENST00000354308 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.66■■□□□ 1.06
SYT5-201ENST00000354308 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.65■■□□□ 1.06
SYT5-201ENST00000354308 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYT5-201ENST00000354308 IGF1RP08069 1367 aa21.62■■□□□ 1.05
SYT5-201ENST00000354308 NEFLP07196 543 aa21.62■■□□□ 1.05
SYT5-201ENST00000354308 TOP2BQ02880 1626 aa21.61■■□□□ 1.05
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