Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC6Q16204 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC6Q16204 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC6Q16204 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC6Q16204 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC6Q16204 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC6Q16204 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC6Q16204 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC6Q16204 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC6Q16204 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC6Q16204 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC6Q16204 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC6Q16204 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC6Q16204 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC6Q16204 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC6Q16204 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC6Q16204 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC6Q16204 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC6Q16204 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC6Q16204 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC6Q16204 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC6Q16204 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC6Q16204 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC6Q16204 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC6Q16204 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC6Q16204 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC6Q16204 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC6Q16204 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC6Q16204 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC6Q16204 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC6Q16204 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC6Q16204 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC6Q16204 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC6Q16204 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC6Q16204 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC6Q16204 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC6Q16204 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC6Q16204 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC6Q16204 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC6Q16204 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC6Q16204 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC6Q16204 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC6Q16204 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC6Q16204 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC6Q16204 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC6Q16204 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC6Q16204 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC6Q16204 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC6Q16204 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC6Q16204 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC6Q16204 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC6Q16204 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC6Q16204 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC6Q16204 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC6Q16204 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC6Q16204 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC6Q16204 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC6Q16204 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC6Q16204 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC6Q16204 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC6Q16204 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC6Q16204 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC6Q16204 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC6Q16204 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC6Q16204 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC6Q16204 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC6Q16204 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC6Q16204 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC6Q16204 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC6Q16204 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC6Q16204 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC6Q16204 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC6Q16204 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC6Q16204 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC6Q16204 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC6Q16204 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC6Q16204 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC6Q16204 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC6Q16204 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC6Q16204 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC6Q16204 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC6Q16204 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC6Q16204 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC6Q16204 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC6Q16204 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC6Q16204 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC6Q16204 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC6Q16204 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC6Q16204 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC6Q16204 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC6Q16204 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC6Q16204 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC6Q16204 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC6Q16204 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC6Q16204 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC6Q16204 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
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