Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.625e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.014e-23■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 TMEM38A-202ENST00000595452 798 ntTSL 212.78□□□□□ -0.365e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-203ENST00000437042 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 TMEM38A-203ENST00000599479 410 ntTSL 311.29□□□□□ -0.65e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-201ENST00000330688 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.765e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 ADGRG2-204ENST00000357544 4678 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.85e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.35e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-207ENST00000480001 1191 ntTSL 36.87□□□□□ -1.315e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-202ENST00000383772 1273 ntTSL 55.4□□□□□ -1.545e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-206ENST00000479097 1235 ntTSL 35.21□□□□□ -1.585e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 RARB-205ENST00000462272 1258 ntTSL 34.8□□□□□ -1.645e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.845e-12■■■■■ 117.9
SDAD1Q9NVU7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.51e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.741e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.991e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.081e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 33.55□□□□□ -1.841e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 32.56□□□□□ -21e-13■■■■■ 115.5
SDAD1Q9NVU7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.125e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.55e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.455e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.325e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.295e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.025e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-11■■■■■ 108.1
SDAD1Q9NVU7 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 58.55□□□□□ -1.043e-12■■■■■ 104.8
SDAD1Q9NVU7 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.41□□□□□ -1.863e-12■■■■■ 104.8
SDAD1Q9NVU7 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 52.78□□□□□ -1.963e-12■■■■■ 104.8
SDAD1Q9NVU7 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 52.44□□□□□ -2.023e-12■■■■■ 104.8
SDAD1Q9NVU7 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.163e-12■■■■■ 104.8
SDAD1Q9NVU7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.565e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.485e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.265e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 SEMA5B-209ENST00000475244 4733 ntTSL 514.72□□□□□ -0.055e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 SEMA5B-203ENST00000393583 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.37□□□□□ -0.115e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.795e-10■■■■■ 98.2
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-208ENST00000460477 574 ntTSL 215.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 95.4
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-206ENST00000448817 571 ntTSL 411.29□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 95.1
SDAD1Q9NVU7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.754e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 MGAT4A-205ENST00000460768 426 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-210ENST00000495736 2000 ntTSL 213.61□□□□□ -0.234e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 CPA5-207ENST00000479492 390 ntTSL 311.4□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.064e-9■■■■■ 88.4
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.444e-7■■■■■ 81.8
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.034e-7■■■■■ 81.8
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 81.8
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 81.8
SDAD1Q9NVU7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 81.8
SDAD1Q9NVU7 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 518.36■□□□□ 0.531e-12■■■■■ 79.3
SDAD1Q9NVU7 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)16.32■□□□□ 0.21e-12■■■■■ 79.3
SDAD1Q9NVU7 RSF1-208ENST00000530604 520 ntTSL 216.11■□□□□ 0.171e-12■■■■■ 79.3
SDAD1Q9NVU7 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 215.29■□□□□ 0.041e-12■■■■■ 79.3
SDAD1Q9NVU7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.99□□□□□ -1.611e-12■■■■■ 79.3
SDAD1Q9NVU7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.214e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.744e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.684e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-211ENST00000567987 1926 ntTSL 1 (best)18.37■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.354e-15■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-205ENST00000562441 1412 ntTSL 216.71■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MAP3K20-205ENST00000468408 585 ntTSL 316.1■□□□□ 0.174e-15■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.164e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-203ENST00000540562 3064 ntTSL 214.68□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-208ENST00000567065 883 ntTSL 313.89□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-213ENST00000569957 4469 ntTSL 213.55□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MAP3K20-206ENST00000476618 4010 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.764e-15■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 38.97□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.974e-15■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-15■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 RBFOX3-207ENST00000582139 154 ntTSL 37.38□□□□□ -1.234e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MED14-206ENST00000482034 520 ntTSL 46.83□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 MED14-208ENST00000495865 525 ntTSL 1 (best)3.81□□□□□ -1.84e-8■■■■■ 78.6
SDAD1Q9NVU7 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-21■■■■■ 77
SDAD1Q9NVU7 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.335e-21■■■■■ 77
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-207ENST00000555882 789 ntTSL 325.05■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 TMEM259-210ENST00000592618 1877 ntTSL 524.41■■□□□ 1.54e-7■■■■■ 68.8
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 98.2 ms