RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562441.5

INO80E-205, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 1,412 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-205ENST00000562441 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.54■■■■■ 4.56
INO80E-205ENST00000562441 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.6■■■■□ 3.77
INO80E-205ENST00000562441 ABCC9O60706 1549 aa37.34■■■■□ 3.57
INO80E-205ENST00000562441 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
INO80E-205ENST00000562441 NACADO15069 1562 aa36.13■■■■□ 3.37
INO80E-205ENST00000562441 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.08■■■■□ 3.37
INO80E-205ENST00000562441 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.05■■■■□ 3.36
INO80E-205ENST00000562441 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.05■■■■□ 3.36
INO80E-205ENST00000562441 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.03■■■■□ 3.36
INO80E-205ENST00000562441 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.44■■■■□ 3.26
INO80E-205ENST00000562441 SCRIBQ14160 1630 aa35.24■■■■□ 3.23
INO80E-205ENST00000562441 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.09■■■■□ 3.21
INO80E-205ENST00000562441 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.181e-6■■■□□ 19
INO80E-205ENST00000562441 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.64■■■■□ 3.14
INO80E-205ENST00000562441 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
INO80E-205ENST00000562441 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.95■■■■□ 3.02
INO80E-205ENST00000562441 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.9■■■■□ 3.02
INO80E-205ENST00000562441 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.84■■■■□ 3.01
INO80E-205ENST00000562441 SMARCA4P51532 1647 aa33.75■■■□□ 2.99
INO80E-205ENST00000562441 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
INO80E-205ENST00000562441 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.59■■■□□ 2.97
INO80E-205ENST00000562441 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.42■■■□□ 2.94
INO80E-205ENST00000562441 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.42■■■□□ 2.94
INO80E-205ENST00000562441 SMARCA2P51531 1590 aa33.38■■■□□ 2.93
INO80E-205ENST00000562441 NCAPD3P42695 1498 aa33.33■■■□□ 2.93
INO80E-205ENST00000562441 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
INO80E-205ENST00000562441 WIZO95785 1651 aa33.28■■■□□ 2.92
INO80E-205ENST00000562441 HMGXB3Q12766 1538 aa33.24■■■□□ 2.91
INO80E-205ENST00000562441 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
INO80E-205ENST00000562441 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
INO80E-205ENST00000562441 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
INO80E-205ENST00000562441 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.49■■■□□ 2.79
INO80E-205ENST00000562441 NESP48681 1621 aa32.48■■■□□ 2.79
INO80E-205ENST00000562441 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.41■■■□□ 2.78
INO80E-205ENST00000562441 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.34■■■□□ 2.77
INO80E-205ENST00000562441 CFTRP13569 1480 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80E-205ENST00000562441 PRDM2Q13029 1718 aa32.17■■■□□ 2.74
INO80E-205ENST00000562441 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.15■■■□□ 2.74
INO80E-205ENST00000562441 ERCC6Q03468 1493 aa32.1■■■□□ 2.73
INO80E-205ENST00000562441 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.09■■■□□ 2.73
INO80E-205ENST00000562441 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32■■■□□ 2.71
INO80E-205ENST00000562441 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
INO80E-205ENST00000562441 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.93■■■□□ 2.7
INO80E-205ENST00000562441 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.81■■■□□ 2.68
INO80E-205ENST00000562441 WDR62O43379 1518 aa31.75■■■□□ 2.67
INO80E-205ENST00000562441 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
INO80E-205ENST00000562441 CUX2O14529 1486 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80E-205ENST00000562441 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.57■■■□□ 2.64
INO80E-205ENST00000562441 TOPBP1Q92547 1522 aa31.56■■■□□ 2.64
INO80E-205ENST00000562441 CUX1P39880 1505 aa31.5■■■□□ 2.63
INO80E-205ENST00000562441 ABCC8Q09428 1581 aa31.49■■■□□ 2.63
INO80E-205ENST00000562441 SYNJ1O43426 1573 aa31.36■■■□□ 2.61
INO80E-205ENST00000562441 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
INO80E-205ENST00000562441 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.34■■■□□ 2.61
INO80E-205ENST00000562441 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
INO80E-205ENST00000562441 TOP2BQ02880 1626 aa31.32■■■□□ 2.6
INO80E-205ENST00000562441 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.3■■■□□ 2.6
INO80E-205ENST00000562441 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
INO80E-205ENST00000562441 IFT140Q96RY7 1462 aa31.22■■■□□ 2.59
INO80E-205ENST00000562441 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.18■■■□□ 2.58
INO80E-205ENST00000562441 WDR97A6NE52 1622 aa31.13■■■□□ 2.57
INO80E-205ENST00000562441 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
INO80E-205ENST00000562441 SOGA1O94964 1423 aa31.12■■■□□ 2.57
INO80E-205ENST00000562441 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
INO80E-205ENST00000562441 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.01■■■□□ 2.55
INO80E-205ENST00000562441 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.541e-7■■■■■ 40.7
INO80E-205ENST00000562441 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.92■■■□□ 2.54
INO80E-205ENST00000562441 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
INO80E-205ENST00000562441 PBRM1Q86U86 1689 aa30.83■■■□□ 2.53
INO80E-205ENST00000562441 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.81■■■□□ 2.52
INO80E-205ENST00000562441 TRIM41Q8WV44 630 aa30.76■■■□□ 2.51
INO80E-205ENST00000562441 GRIN2BQ13224 1484 aa30.74■■■□□ 2.51
INO80E-205ENST00000562441 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.7■■■□□ 2.5
INO80E-205ENST00000562441 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.69■■■□□ 2.5
INO80E-205ENST00000562441 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.49
INO80E-205ENST00000562441 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80E-205ENST00000562441 KIF27Q86VH2 1401 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80E-205ENST00000562441 CHD1O14646 1710 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80E-205ENST00000562441 ADAMTS12P58397 1594 aa30.59■■■□□ 2.49
INO80E-205ENST00000562441 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.57■■■□□ 2.48
INO80E-205ENST00000562441 SYNJ2O15056 1496 aa30.52■■■□□ 2.48
INO80E-205ENST00000562441 IGF1RP08069 1367 aa30.49■■■□□ 2.47
INO80E-205ENST00000562441 CUL7Q14999 1698 aa30.45■■■□□ 2.47
INO80E-205ENST00000562441 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.45■■■□□ 2.46
INO80E-205ENST00000562441 GRIN2AQ12879 1464 aa30.39■■■□□ 2.46
INO80E-205ENST00000562441 FBLN2P98095 1184 aa30.38■■■□□ 2.45
INO80E-205ENST00000562441 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
INO80E-205ENST00000562441 OSCARQ8IYS5 282 aa30.3■■■□□ 2.44
INO80E-205ENST00000562441 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.28■■■□□ 2.44
INO80E-205ENST00000562441 EEA1Q15075 1411 aa30.28■■■□□ 2.44
INO80E-205ENST00000562441 CEP170Q5SW79 1584 aa30.28■■■□□ 2.44
INO80E-205ENST00000562441 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.26■■■□□ 2.43
INO80E-205ENST00000562441 NUP160Q12769 1436 aa30.24■■■□□ 2.43
INO80E-205ENST00000562441 PRXQ9BXM0 1461 aa30.21■■■□□ 2.43
INO80E-205ENST00000562441 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.2■■■□□ 2.42
INO80E-205ENST00000562441 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.18■■■□□ 2.42
INO80E-205ENST00000562441 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.15■■■□□ 2.42
INO80E-205ENST00000562441 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
INO80E-205ENST00000562441 KIF21BO75037 1637 aa30.05■■■□□ 2.4
INO80E-205ENST00000562441 SHROOM2Q13796 1616 aa30.03■■■□□ 2.4
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