RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567065.5

INO80E-208, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-208ENST00000567065 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.22■■■■□ 3.55
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INO80E-208ENST00000567065 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.98■■■□□ 2.71
INO80E-208ENST00000567065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.78■■■□□ 2.68
INO80E-208ENST00000567065 NACADO15069 1562 aa31.73■■■□□ 2.67
INO80E-208ENST00000567065 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.4■■■□□ 2.62
INO80E-208ENST00000567065 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.34■■■□□ 2.61
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INO80E-208ENST00000567065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.45■■■□□ 2.47
INO80E-208ENST00000567065 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
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INO80E-208ENST00000567065 CUX2O14529 1486 aa29.12■■■□□ 2.25
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INO80E-208ENST00000567065 SMARCA2P51531 1590 aa29.06■■■□□ 2.24
INO80E-208ENST00000567065 HMGXB3Q12766 1538 aa29.06■■■□□ 2.24
INO80E-208ENST00000567065 ERCC6Q03468 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
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INO80E-208ENST00000567065 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.85■■■□□ 2.21
INO80E-208ENST00000567065 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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INO80E-208ENST00000567065 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80E-208ENST00000567065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.67■■■□□ 2.18
INO80E-208ENST00000567065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.57■■■□□ 2.16
INO80E-208ENST00000567065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.44■■■□□ 2.14
INO80E-208ENST00000567065 WIZO95785 1651 aa28.34■■■□□ 2.13
INO80E-208ENST00000567065 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.34■■■□□ 2.13
INO80E-208ENST00000567065 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.23■■■□□ 2.11
INO80E-208ENST00000567065 WDR62O43379 1518 aa28.22■■■□□ 2.11
INO80E-208ENST00000567065 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.08■■■□□ 2.09
INO80E-208ENST00000567065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.02■■■□□ 2.08
INO80E-208ENST00000567065 CFTRP13569 1480 aa28.01■■■□□ 2.07
INO80E-208ENST00000567065 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
INO80E-208ENST00000567065 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
INO80E-208ENST00000567065 TRIM41Q8WV44 630 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80E-208ENST00000567065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
INO80E-208ENST00000567065 PRDM2Q13029 1718 aa27.84■■■□□ 2.05
INO80E-208ENST00000567065 OSCARQ8IYS5 282 aa27.69■■■□□ 2.02
INO80E-208ENST00000567065 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.62■■■□□ 2.01
INO80E-208ENST00000567065 IFT140Q96RY7 1462 aa27.53■■■□□ 2
INO80E-208ENST00000567065 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.51■■■□□ 2
INO80E-208ENST00000567065 TOPBP1Q92547 1522 aa27.5■■□□□ 1.99
INO80E-208ENST00000567065 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.46■■□□□ 1.99
INO80E-208ENST00000567065 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.46■■□□□ 1.99
INO80E-208ENST00000567065 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.46■■□□□ 1.99
INO80E-208ENST00000567065 ABCC8Q09428 1581 aa27.42■■□□□ 1.98
INO80E-208ENST00000567065 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
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INO80E-208ENST00000567065 ARHGEF11O15085 1522 aa27.31■■□□□ 1.96
INO80E-208ENST00000567065 CHD1O14646 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
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INO80E-208ENST00000567065 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.05■■□□□ 1.92
INO80E-208ENST00000567065 WDR97A6NE52 1622 aa27.03■■□□□ 1.92
INO80E-208ENST00000567065 SOGA1O94964 1423 aa27.03■■□□□ 1.92
INO80E-208ENST00000567065 ARAP1Q96P48 1450 aa27.03■■□□□ 1.92
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INO80E-208ENST00000567065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.98■■□□□ 1.91
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INO80E-208ENST00000567065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.94■■□□□ 1.9
INO80E-208ENST00000567065 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.92■■□□□ 1.9
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INO80E-208ENST00000567065 SYNJ1O43426 1573 aa26.84■■□□□ 1.89
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INO80E-208ENST00000567065 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
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INO80E-208ENST00000567065 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
INO80E-208ENST00000567065 SYNJ2O15056 1496 aa26.79■■□□□ 1.88
INO80E-208ENST00000567065 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
INO80E-208ENST00000567065 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.71■■□□□ 1.87
INO80E-208ENST00000567065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.71■■□□□ 1.87
INO80E-208ENST00000567065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.69■■□□□ 1.86
INO80E-208ENST00000567065 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 GRIN2AQ12879 1464 aa26.5■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 ADAMTS12P58397 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 TOP2BQ02880 1626 aa26.48■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.47■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 CEP170Q5SW79 1584 aa26.46■■□□□ 1.83
INO80E-208ENST00000567065 NUP160Q12769 1436 aa26.44■■□□□ 1.82
INO80E-208ENST00000567065 SHROOM2Q13796 1616 aa26.41■■□□□ 1.82
INO80E-208ENST00000567065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.37■■□□□ 1.81
INO80E-208ENST00000567065 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.35■■□□□ 1.81
INO80E-208ENST00000567065 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.21■■□□□ 1.79
INO80E-208ENST00000567065 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
INO80E-208ENST00000567065 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.78
INO80E-208ENST00000567065 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
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