Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.695e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 NR1H4-201ENST00000188403 1630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.925e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 NR1H4-207ENST00000549996 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.085e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 NR1H4-209ENST00000551379 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.25e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.435e-6■■■■□ 19.6
SRSF7Q16629 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 19.5
SRSF7Q16629 BCAR1-212ENST00000563038 2692 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 19.4
SRSF7Q16629 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 19.4
SRSF7Q16629 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 411.26□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 19.4
SRSF7Q16629 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.374e-9■■■■□ 19.4
SRSF7Q16629 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-9■■■■□ 19.4
SRSF7Q16629 PMM2-212ENST00000566604 986 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-211ENST00000566540 1557 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-203ENST00000562318 931 ntTSL 212.09□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-207ENST00000565221 793 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-218ENST00000570134 573 ntTSL 58.91□□□□□ -0.981e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-205ENST00000564030 1036 ntTSL 28.2□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-204ENST00000562448 583 ntTSL 28.02□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-210ENST00000566196 531 ntTSL 47.73□□□□□ -1.171e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-213ENST00000566983 907 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-217ENST00000570076 1002 ntTSL 26.88□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-209ENST00000565896 514 ntTSL 46.87□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-215ENST00000568602 550 ntTSL 56.22□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 PMM2-206ENST00000564069 567 ntTSL 45.81□□□□□ -1.481e-6■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.587e-11■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.587e-11■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.167e-11■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.097e-11■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.817e-11■■■■□ 19.3
SRSF7Q16629 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-7■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-15■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.642e-15■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.122e-15■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 315.83■□□□□ 0.129e-16■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.329e-16■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.49e-16■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 48.51□□□□□ -1.059e-16■■■□□ 19.2
SRSF7Q16629 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.033e-10■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 214□□□□□ -0.173e-10■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.097e-7■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.567e-7■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 215.82■□□□□ 0.121e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 215.82■□□□□ 0.121e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 215.79■□□□□ 0.126e-8■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 01e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.131e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-211ENST00000526023 477 ntTSL 513.83□□□□□ -0.21e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 313.75□□□□□ -0.211e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 313.67□□□□□ -0.221e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 313.24□□□□□ -0.291e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 312.71□□□□□ -0.371e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 CDC42SE1-205ENST00000491825 837 ntTSL 212.16□□□□□ -0.461e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 411.76□□□□□ -0.531e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 411.76□□□□□ -0.531e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.571e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-213ENST00000468928 900 ntTSL 311.26□□□□□ -0.611e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 510.43□□□□□ -0.741e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 59.85□□□□□ -0.831e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.961e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 PRPF4B-209ENST00000494674 1727 ntTSL 59.02□□□□□ -0.961e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 58.95□□□□□ -0.981e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 DNAJB6-216ENST00000487480 5173 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.991e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 27.63□□□□□ -1.196e-8■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.21e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.311e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 56.86□□□□□ -1.311e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.391e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 SUZ12-203ENST00000578106 1367 ntTSL 26.34□□□□□ -1.391e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.431e-5■■■□□ 19.1
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