Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.87e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CAPN1-214ENST00000528165 2828 ntTSL 215.77■□□□□ 0.117e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.117e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.247e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.212e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-8■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 TMEM59-209ENST00000470395 480 ntTSL 27.33□□□□□ -1.242e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.732e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 EEF1A1-205ENST00000455918 701 ntTSL 224.48■■□□□ 1.511e-323■■□□□ 12
PABPC4Q13310 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-323■■□□□ 12
PABPC4Q13310 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-323■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-323■■□□□ 12
PABPC4Q13310 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 222.3■■□□□ 1.163e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 14e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.854e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.934e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.964e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.964e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 521.47■■□□□ 1.032e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.51e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.824e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RPL32-205ENST00000434963 439 ntTSL 510.26□□□□□ -0.777e-85■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 CAPNS1-210ENST00000590211 403 ntTSL 55.51□□□□□ -1.533e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.214e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TFE3-204ENST00000493583 3279 ntTSL 215.12■□□□□ 0.014e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.942e-11■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.157e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CYSTM1-202ENST00000504227 588 ntTSL 516.07■□□□□ 0.167e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CYSTM1-204ENST00000509789 813 ntTSL 416.07■□□□□ 0.167e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CYSTM1-203ENST00000509589 665 ntTSL 312.68□□□□□ -0.387e-8■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 STXBP2-215ENST00000599558 385 ntTSL 219.1■□□□□ 0.655e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.247e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 212.38□□□□□ -0.437e-8■■□□□ 12
PABPC4Q13310 COPS6-208ENST00000474823 752 ntTSL 212.45□□□□□ -0.426e-7■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-8■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 55.46□□□□□ -1.544e-16■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.364e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-10■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.492e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RPL12-204ENST00000497825 864 ntTSL 221.44■■□□□ 1.022e-10■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-10■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-10■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.158e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.498e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 514.94□□□□□ -0.022e-23■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 240.22■■■■■ 4.032e-15■■□□□ 12
PABPC4Q13310 UQCRH-202ENST00000460947 621 ntTSL 210.2□□□□□ -0.784e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RACK1-207ENST00000503170 461 ntTSL 420.42■□□□□ 0.861e-82■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 219.49■□□□□ 0.719e-9■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CARHSP1-214ENST00000569572 578 ntTSL 317.21■□□□□ 0.359e-9■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.412e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.92e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 ARL2-205ENST00000531533 281 ntTSL 216.23■□□□□ 0.193e-12■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 RAB1A-205ENST00000494188 771 ntTSL 227.29■■□□□ 1.963e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.623e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.843e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-8■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 EIF3G-211ENST00000590940 762 ntTSL 313.48□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.322e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 MOGS-206ENST00000462189 2400 ntTSL 214.52□□□□□ -0.092e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.642e-14■■□□□ 11.9
PABPC4Q13310 HSDL1-208ENST00000619773 3059 nt9.13□□□□□ -0.952e-14■■□□□ 11.9
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