RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPNS1-210ENST00000590211 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CAPNS1-210ENST00000590211 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CAPNS1-210ENST00000590211 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CAPNS1-210ENST00000590211 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.43□□□□□ -0.42
CAPNS1-210ENST00000590211 ADRA2BP18089 450 aa11.74□□□□□ -0.53
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXD1Q16676 465 aa11.68□□□□□ -0.54
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.67□□□□□ -0.54
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNA4P22459 653 aa11.4□□□□□ -0.58
CAPNS1-210ENST00000590211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.05□□□□□ -0.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.88□□□□□ -0.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.6□□□□□ -0.71
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB22O15209 634 aa10.56□□□□□ -0.72
CAPNS1-210ENST00000590211 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CAPNS1-210ENST00000590211 MSH5O43196 834 aa10.46□□□□□ -0.73
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.45□□□□□ -0.74
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC4A2P04920 1241 aa10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC24A1O60721 1099 aa9.87□□□□□ -0.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP8Q14318 412 aa9.7□□□□□ -0.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CAPNS1-210ENST00000590211 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PROM2Q8N271 834 aa9.26□□□□□ -0.93
CAPNS1-210ENST00000590211 APLP2Q06481 763 aa9.22□□□□□ -0.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-210ENST00000590211 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO3Q9UK99 471 aa9.16□□□□□ -0.94
CAPNS1-210ENST00000590211 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-210ENST00000590211 POLA2Q14181 598 aa9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF39Q9H2S5 420 aa9.09□□□□□ -0.95
CAPNS1-210ENST00000590211 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CAPNS1-210ENST00000590211 FBLN2P98095 1184 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCB2Q00722 1185 aa9.02□□□□□ -0.97
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN15O75808 1086 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-210ENST00000590211 PKD2Q13563 968 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-210ENST00000590211 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCB7O75027 752 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-210ENST00000590211 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-210ENST00000590211 DSG3P32926 999 aa8.83□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 BCANQ96GW7 911 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.81□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 SPOCK2Q92563 424 aa8.79□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CAPNS1-210ENST00000590211 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 OSCARQ8IYS5 282 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.77□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 SPDYE6P0CI01 402 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEDQ86YR6 584 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL34Q8N239 644 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-210ENST00000590211 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-210ENST00000590211 RGL2O15211 777 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-210ENST00000590211 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-210ENST00000590211 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-210ENST00000590211 MIER1Q8N108 512 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-210ENST00000590211 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-210ENST00000590211 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP44Q96MT7 982 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-210ENST00000590211 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-210ENST00000590211 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 NUBP1P53384 320 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM41Q8WV44 630 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHG5O94827 1062 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-210ENST00000590211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.44□□□□□ -1.06
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