RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477194.5

FHL3-203, Transcript of four and a half LIM domains 3, humanhuman

TSL 2

Gene FHL3, Length 1,091 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3-203ENST00000477194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa82.08■■■■■ 10.73
FHL3-203ENST00000477194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa73.19■■■■■ 9.31
FHL3-203ENST00000477194 ABCC9O60706 1549 aa72.07■■■■■ 9.13
FHL3-203ENST00000477194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa69.13■■■■■ 8.66
FHL3-203ENST00000477194 NACADO15069 1562 aa68.96■■■■■ 8.63
FHL3-203ENST00000477194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa68.78■■■■■ 8.6
FHL3-203ENST00000477194 MYO15BQ96JP2 1530 aa68.42■■■■■ 8.54
FHL3-203ENST00000477194 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP68.23■■■■■ 8.51
FHL3-203ENST00000477194 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa67.92■■■■■ 8.46
FHL3-203ENST00000477194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa67.59■■■■■ 8.41
FHL3-203ENST00000477194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP67.29■■■■■ 8.36
FHL3-203ENST00000477194 BICRAQ9NZM4 1560 aa67.09■■■■■ 8.33
FHL3-203ENST00000477194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa66.72■■■■■ 8.27
FHL3-203ENST00000477194 SCRIBQ14160 1630 aa66.66■■■■■ 8.26
FHL3-203ENST00000477194 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa66.33■■■■■ 8.21
FHL3-203ENST00000477194 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP65.33■■■■■ 8.05
FHL3-203ENST00000477194 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa65.2■■■■■ 8.03
FHL3-203ENST00000477194 CECR2Q9BXF3 1484 aa64.84■■■■■ 7.97
FHL3-203ENST00000477194 SMARCA4P51532 1647 aa63.77■■■■■ 7.8
FHL3-203ENST00000477194 NCAPD3P42695 1498 aa63.66■■■■■ 7.78
FHL3-203ENST00000477194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP63.64■■■■■ 7.78
FHL3-203ENST00000477194 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa63.59■■■■■ 7.77
FHL3-203ENST00000477194 SMARCA2P51531 1590 aa63.47■■■■■ 7.75
FHL3-203ENST00000477194 HMGXB3Q12766 1538 aa63.25■■■■■ 7.72
FHL3-203ENST00000477194 MROH2BQ7Z745 1585 aa63.22■■■■■ 7.71
FHL3-203ENST00000477194 PEG3Q9GZU2 1588 aa63.2■■■■■ 7.71
FHL3-203ENST00000477194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP62.99■■■■■ 7.67
FHL3-203ENST00000477194 WIZO95785 1651 aa62.52■■■■■ 7.6
FHL3-203ENST00000477194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP62.35■■■■■ 7.57
FHL3-203ENST00000477194 NESP48681 1621 aa62.23■■■■■ 7.55
FHL3-203ENST00000477194 ERCC6Q03468 1493 aa62.14■■■■■ 7.54
FHL3-203ENST00000477194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa62.03■■■■■ 7.52
FHL3-203ENST00000477194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP61.81■■■■■ 7.49
FHL3-203ENST00000477194 CADPSQ9ULU8 1353 aa61.77■■■■■ 7.48
FHL3-203ENST00000477194 CUX2O14529 1486 aa61.73■■■■■ 7.47
FHL3-203ENST00000477194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa61.64■■■■■ 7.46
FHL3-203ENST00000477194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa61.47■■■■■ 7.43
FHL3-203ENST00000477194 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP61.38■■■■■ 7.42
FHL3-203ENST00000477194 CFTRP13569 1480 aa61.29■■■■■ 7.4
FHL3-203ENST00000477194 CCDC88BA6NC98 1476 aa61.13■■■■■ 7.38
FHL3-203ENST00000477194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa61.01■■■■■ 7.36
FHL3-203ENST00000477194 MRC2Q9UBG0 1479 aa60.99■■■■■ 7.35
FHL3-203ENST00000477194 CEP164Q9UPV0 1460 aa60.97■■■■■ 7.35
FHL3-203ENST00000477194 WDR62O43379 1518 aa60.82■■■■■ 7.33
FHL3-203ENST00000477194 PRDM2Q13029 1718 aa60.76■■■■■ 7.32
FHL3-203ENST00000477194 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa60.53■■■■■ 7.28
FHL3-203ENST00000477194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP60.44■■■■■ 7.27
FHL3-203ENST00000477194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP60.35■■■■■ 7.25
FHL3-203ENST00000477194 ABCC8Q09428 1581 aa60.01■■■■■ 7.2
FHL3-203ENST00000477194 TOPBP1Q92547 1522 aa59.99■■■■■ 7.19
FHL3-203ENST00000477194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa59.86■■■■■ 7.17
FHL3-203ENST00000477194 IFT140Q96RY7 1462 aa59.74■■■■■ 7.15
FHL3-203ENST00000477194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP59.5■■■■■ 7.12
FHL3-203ENST00000477194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP59.44■■■■■ 7.11
FHL3-203ENST00000477194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP59.4■■■■■ 7.1
FHL3-203ENST00000477194 CUX1P39880 1505 aa59.34■■■■■ 7.09
FHL3-203ENST00000477194 SOGA1O94964 1423 aa59.22■■■■■ 7.07
FHL3-203ENST00000477194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP59.21■■■■■ 7.07
FHL3-203ENST00000477194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa59.2■■■■■ 7.07
FHL3-203ENST00000477194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa59.19■■■■■ 7.07
FHL3-203ENST00000477194 OSCARQ8IYS5 282 aa59.14■■■■■ 7.06
FHL3-203ENST00000477194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP59.13■■■■■ 7.067e-8■■■□□ 15.8
FHL3-203ENST00000477194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP58.94■■■■■ 7.03
FHL3-203ENST00000477194 WDR97A6NE52 1622 aa58.89■■■■■ 7.02
FHL3-203ENST00000477194 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP58.77■■■■■ 7
FHL3-203ENST00000477194 TOP2BQ02880 1626 aa58.7■■■■■ 6.99
FHL3-203ENST00000477194 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa58.7■■■■■ 6.99
FHL3-203ENST00000477194 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa58.64■■■■■ 6.98
FHL3-203ENST00000477194 SYNJ1O43426 1573 aa58.63■■■■■ 6.98
FHL3-203ENST00000477194 CHD1O14646 1710 aa58.59■■■■■ 6.97
FHL3-203ENST00000477194 GRIN2BQ13224 1484 aa58.57■■■■■ 6.97
FHL3-203ENST00000477194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa58.51■■■■■ 6.96
FHL3-203ENST00000477194 FBLN2P98095 1184 aa58.51■■■■■ 6.96
FHL3-203ENST00000477194 GAPVD1Q14C86 1478 aa58.5■■■■■ 6.96
FHL3-203ENST00000477194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP58.47■■■■■ 6.95
FHL3-203ENST00000477194 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa58.42■■■■■ 6.94
FHL3-203ENST00000477194 PBRM1Q86U86 1689 aa58.38■■■■■ 6.94
FHL3-203ENST00000477194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP58.3■■■■■ 6.92
FHL3-203ENST00000477194 SYNJ2O15056 1496 aa58.25■■■■■ 6.92
FHL3-203ENST00000477194 TRIM41Q8WV44 630 aa58.2■■■■■ 6.91
FHL3-203ENST00000477194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa58.17■■■■■ 6.9
FHL3-203ENST00000477194 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa58.17■■■■■ 6.9
FHL3-203ENST00000477194 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa58.17■■■■■ 6.9
FHL3-203ENST00000477194 ARHGEF11O15085 1522 aa58.1■■■■■ 6.89
FHL3-203ENST00000477194 CLASP1Q7Z460 1538 aa57.96■■■■■ 6.87
FHL3-203ENST00000477194 ERICH3Q5RHP9 1530 aa57.93■■■■■ 6.86
FHL3-203ENST00000477194 ADAMTS12P58397 1594 aa57.87■■■■■ 6.86
FHL3-203ENST00000477194 FHAD1B1AJZ9 1412 aa57.82■■■■■ 6.85
FHL3-203ENST00000477194 GRIN2AQ12879 1464 aa57.8■■■■■ 6.84
FHL3-203ENST00000477194 CYB5RLQ6IPT4 315 aa57.65■■■■■ 6.82
FHL3-203ENST00000477194 ARAP1Q96P48 1450 aa57.6■■■■■ 6.81
FHL3-203ENST00000477194 NUP160Q12769 1436 aa57.59■■■■■ 6.81
FHL3-203ENST00000477194 KIF27Q86VH2 1401 aa57.59■■■■■ 6.81
FHL3-203ENST00000477194 CEP170Q5SW79 1584 aa57.52■■■■■ 6.8
FHL3-203ENST00000477194 IGF1RP08069 1367 aa57.48■■■■■ 6.79
FHL3-203ENST00000477194 CUL7Q14999 1698 aa57.28■■■■■ 6.76
FHL3-203ENST00000477194 SHROOM2Q13796 1616 aa57.21■■■■■ 6.75
FHL3-203ENST00000477194 ERCC6L2Q5T890 1561 aa57.1■■■■■ 6.73
FHL3-203ENST00000477194 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa57.1■■■■■ 6.73
FHL3-203ENST00000477194 JPH4Q96JJ6 628 aa57.06■■■■■ 6.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms