Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 511□□□□□ -0.654e-10■■■■■ 48.1
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DKC1O60832 QRICH2-202ENST00000447564 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.08■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 48
DKC1O60832 CDKN1A-206ENST00000462537 553 ntTSL 320.79■□□□□ 0.928e-30■■■■■ 47.9
DKC1O60832 CDKN1A-205ENST00000459970 604 ntTSL 520.26■□□□□ 0.838e-30■■■■■ 47.9
DKC1O60832 CDKN1A-207ENST00000478800 616 ntTSL 219.09■□□□□ 0.658e-30■■■■■ 47.9
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DKC1O60832 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.548e-30■■■■■ 47.9
DKC1O60832 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.398e-30■■■■■ 47.9
DKC1O60832 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.258e-30■■■■■ 47.9
DKC1O60832 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.167e-7■■■■■ 47.9
DKC1O60832 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.158e-30■■■■■ 47.9
DKC1O60832 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 47.9
DKC1O60832 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 47.9
DKC1O60832 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.188e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-210ENST00000505941 917 ntTSL 223.74■■□□□ 1.398e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.298e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-220ENST00000511663 966 ntTSL 521.65■■□□□ 1.068e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-218ENST00000511185 1071 ntTSL 220.9■□□□□ 0.948e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.868e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 218.63■□□□□ 0.578e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 516.45■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-213ENST00000508385 876 ntTSL 316.27■□□□□ 0.28e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-227ENST00000515183 566 ntTSL 416.15■□□□□ 0.188e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-222ENST00000512014 688 ntTSL 314.22□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 217.4■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 47.8
DKC1O60832 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 47.6
DKC1O60832 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 47.6
DKC1O60832 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 47.6
DKC1O60832 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 47.6
DKC1O60832 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 222.05■■□□□ 1.121e-323■■■■■ 47.3
DKC1O60832 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.271e-323■■■■■ 47.3
DKC1O60832 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 229.25■■■□□ 2.272e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.242e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 227.18■■□□□ 1.942e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 524.86■■□□□ 1.572e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.512e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 323.68■■□□□ 1.382e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 323.64■■□□□ 1.372e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 523.55■■□□□ 1.362e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.162e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 12e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SH3TC1-217ENST00000509119 509 ntTSL 321.04■□□□□ 0.962e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 DDN-AS1-204ENST00000552933 1324 ntTSL 321.03■□□□□ 0.962e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.812e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.792e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.676e-20■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SH3TC1-203ENST00000457650 617 ntTSL 518.87■□□□□ 0.612e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.616e-20■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-211ENST00000496333 501 ntTSL 318.34■□□□□ 0.532e-10■■■■■ 47.2
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DKC1O60832 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SH3TC1-207ENST00000503284 560 ntTSL 418.29■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 47.2
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DKC1O60832 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 47.2
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DKC1O60832 SH3TC1-206ENST00000502669 3484 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.152e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.136e-20■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 AP001631.1-201ENST00000433840 1052 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 511.23□□□□□ -0.616e-20■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 BMF-210ENST00000561360 735 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SLC25A44-204ENST00000469537 6952 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.262e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-208ENST00000483904 711 ntTSL 35.98□□□□□ -1.452e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.632e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.672e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.712e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 FBXW11-206ENST00000518752 310 ntTSL 52.67□□□□□ -1.982e-10■■■■■ 47.2
DKC1O60832 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 47.1
DKC1O60832 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC8.38□□□□□ -1.071e-323■■■■■ 47.1
DKC1O60832 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 47
DKC1O60832 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 47
DKC1O60832 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-13■■■■■ 46.9
DKC1O60832 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-13■■■■■ 46.9
DKC1O60832 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-13■■■■■ 46.9
DKC1O60832 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-13■■■■■ 46.9
DKC1O60832 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.852e-13■■■■■ 46.9
DKC1O60832 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35.21□□□□□ -1.582e-13■■■■■ 46.9
DKC1O60832 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 314.19□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 531.63■■■□□ 2.652e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 328.42■■■□□ 2.142e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-210ENST00000447379 716 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-16■■■■■ 46.8
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