RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-207ENST00000503393 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-207ENST00000503393 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-207ENST00000503393 MYT1Q01538 1121 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-207ENST00000503393 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-207ENST00000503393 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-207ENST00000503393 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-207ENST00000503393 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-207ENST00000503393 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-207ENST00000503393 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-207ENST00000503393 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-207ENST00000503393 APLP2Q06481 763 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP2-207ENST00000503393 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-207ENST00000503393 NEFLP07196 543 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-207ENST00000503393 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM41Q8WV44 630 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-207ENST00000503393 HRCP23327 699 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-207ENST00000503393 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-207ENST00000503393 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-207ENST00000503393 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-207ENST00000503393 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-207ENST00000503393 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-207ENST00000503393 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-207ENST00000503393 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-207ENST00000503393 ITGAEP38570 1179 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-207ENST00000503393 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-207ENST00000503393 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-207ENST00000503393 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-207ENST00000503393 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-207ENST00000503393 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-207ENST00000503393 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-207ENST00000503393 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BCANQ96GW7 911 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-207ENST00000503393 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-207ENST00000503393 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-207ENST00000503393 ANP32CO43423 234 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-207ENST00000503393 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-207ENST00000503393 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-207ENST00000503393 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-207ENST00000503393 NEUROD1Q13562 356 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-207ENST00000503393 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM52Q96A61 297 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-207ENST00000503393 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-207ENST00000503393 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-207ENST00000503393 FKBP8Q14318 412 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-207ENST00000503393 NBR1Q14596 966 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-207ENST00000503393 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-207ENST00000503393 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-207ENST00000503393 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-207ENST00000503393 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-207ENST00000503393 NEFMP07197 916 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-207ENST00000503393 BCL11AQ9H165 835 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-207ENST00000503393 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-207ENST00000503393 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC24A1O60721 1099 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-207ENST00000503393 TONSLQ96HA7 1378 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP2-207ENST00000503393 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP2-207ENST00000503393 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM9BQ8IZU0 186 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-207ENST00000503393 ARXQ96QS3 562 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-207ENST00000503393 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP2-207ENST00000503393 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-207ENST00000503393 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-207ENST00000503393 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-207ENST00000503393 MIER1Q8N108 512 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-207ENST00000503393 TMC1Q8TDI8 760 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-207ENST00000503393 P3H3Q8IVL6 736 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-207ENST00000503393 BECN1Q14457 450 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-207ENST00000503393 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-207ENST00000503393 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-207ENST00000503393 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 13.4
SH3BP2-207ENST00000503393 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-207ENST00000503393 FBLN2P98095 1184 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-207ENST00000503393 MRS2Q9HD23 443 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-207ENST00000503393 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-207ENST00000503393 ABCC9O60706 1549 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-207ENST00000503393 ARID3CA6NKF2 412 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-207ENST00000503393 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-207ENST00000503393 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP2-207ENST00000503393 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP2-207ENST00000503393 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-207ENST00000503393 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-207ENST00000503393 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms