RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444973.5

NEK6-209, Transcript of NIMA related kinase 6, humanhuman

TSL 5

Gene NEK6, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6-209ENST00000444973 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.02■■■■■ 8.96
NEK6-209ENST00000444973 ABCC9O60706 1549 aa63.84■■■■■ 7.81
NEK6-209ENST00000444973 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.69■■■■■ 7.79
NEK6-209ENST00000444973 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.67■■■■■ 7.3
NEK6-209ENST00000444973 NACADO15069 1562 aa60.23■■■■■ 7.23
NEK6-209ENST00000444973 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.04■■■■■ 7.2
NEK6-209ENST00000444973 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.92■■■■■ 7.18
NEK6-209ENST00000444973 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.46■■■■■ 7.11
NEK6-209ENST00000444973 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.34■■■■■ 7.09
NEK6-209ENST00000444973 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.32■■■■■ 7.09
NEK6-209ENST00000444973 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.94■■■■■ 7.03
NEK6-209ENST00000444973 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.86■■■■■ 7.01
NEK6-209ENST00000444973 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.59■■■■■ 6.97
NEK6-209ENST00000444973 SCRIBQ14160 1630 aa58.15■■■■■ 6.9
NEK6-209ENST00000444973 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.04■■■■■ 6.88
NEK6-209ENST00000444973 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.63■■■■■ 6.82
NEK6-209ENST00000444973 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.49■■■■■ 6.79
NEK6-209ENST00000444973 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.48■■■■■ 6.79
NEK6-209ENST00000444973 NCAPD3P42695 1498 aa55.62■■■■■ 6.49
NEK6-209ENST00000444973 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.48■■■■■ 6.47
NEK6-209ENST00000444973 SMARCA4P51532 1647 aa55.42■■■■■ 6.46
NEK6-209ENST00000444973 SMARCA2P51531 1590 aa55.29■■■■■ 6.44
NEK6-209ENST00000444973 HMGXB3Q12766 1538 aa55.21■■■■■ 6.43
NEK6-209ENST00000444973 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.11■■■■■ 6.41
NEK6-209ENST00000444973 ERCC6Q03468 1493 aa55.11■■■■■ 6.41
NEK6-209ENST00000444973 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.98■■■■■ 6.39
NEK6-209ENST00000444973 CUX2O14529 1486 aa54.95■■■■■ 6.39
NEK6-209ENST00000444973 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.95■■■■■ 6.39
NEK6-209ENST00000444973 NESP48681 1621 aa54.84■■■■■ 6.37
NEK6-209ENST00000444973 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.83■■■■■ 6.37
NEK6-209ENST00000444973 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.76■■■■■ 6.36
NEK6-209ENST00000444973 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.36■■■■■ 6.29
NEK6-209ENST00000444973 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.25■■■■■ 6.27
NEK6-209ENST00000444973 WIZO95785 1651 aa54.11■■■■■ 6.25
NEK6-209ENST00000444973 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.09■■■■■ 6.25
NEK6-209ENST00000444973 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.06■■■■■ 6.24
NEK6-209ENST00000444973 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.95■■■■■ 6.23
NEK6-209ENST00000444973 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.64■■■■■ 6.18
NEK6-209ENST00000444973 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.61■■■■■ 6.17
NEK6-209ENST00000444973 WDR62O43379 1518 aa53.49■■■■■ 6.15
NEK6-209ENST00000444973 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.41■■■■■ 6.14
NEK6-209ENST00000444973 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
NEK6-209ENST00000444973 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.36■■■■■ 6.13
NEK6-209ENST00000444973 CFTRP13569 1480 aa53.33■■■■■ 6.13
NEK6-209ENST00000444973 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.94■■■■■ 6.07
NEK6-209ENST00000444973 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.8■■■■■ 6.04
NEK6-209ENST00000444973 PRDM2Q13029 1718 aa52.74■■■■■ 6.03
NEK6-209ENST00000444973 TRIM41Q8WV44 630 aa52.65■■■■■ 6.02
NEK6-209ENST00000444973 OSCARQ8IYS5 282 aa52.46■■■■■ 5.99
NEK6-209ENST00000444973 TOPBP1Q92547 1522 aa52.35■■■■■ 5.97
NEK6-209ENST00000444973 IFT140Q96RY7 1462 aa52.33■■■■■ 5.97
NEK6-209ENST00000444973 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.31■■■■■ 5.96
NEK6-209ENST00000444973 ABCC8Q09428 1581 aa52.15■■■■■ 5.94
NEK6-209ENST00000444973 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.13■■■■■ 5.94
NEK6-209ENST00000444973 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.99■■■■■ 5.91
NEK6-209ENST00000444973 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.87■■■■■ 5.89
NEK6-209ENST00000444973 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.82■■■■■ 5.892e-7■□□□□ 10.1
NEK6-209ENST00000444973 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.81■■■■■ 5.88
NEK6-209ENST00000444973 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.81■■■■■ 5.88
NEK6-209ENST00000444973 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.81■■■■■ 5.88
NEK6-209ENST00000444973 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.81■■■■■ 5.88
NEK6-209ENST00000444973 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.67■■■■■ 5.86
NEK6-209ENST00000444973 ARHGEF11O15085 1522 aa51.64■■■■■ 5.86
NEK6-209ENST00000444973 CHD1O14646 1710 aa51.61■■■■■ 5.85
NEK6-209ENST00000444973 SOGA1O94964 1423 aa51.56■■■■■ 5.85
NEK6-209ENST00000444973 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.52■■■■■ 5.84
NEK6-209ENST00000444973 FBLN2P98095 1184 aa51.51■■■■■ 5.84
NEK6-209ENST00000444973 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.5■■■■■ 5.84
NEK6-209ENST00000444973 CUX1P39880 1505 aa51.45■■■■■ 5.83
NEK6-209ENST00000444973 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.3■■■■■ 5.8
NEK6-209ENST00000444973 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.29■■■■■ 5.8
NEK6-209ENST00000444973 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.28■■■■■ 5.8
NEK6-209ENST00000444973 WDR97A6NE52 1622 aa51.26■■■■■ 5.8
NEK6-209ENST00000444973 ARAP1Q96P48 1450 aa51.16■■■■■ 5.78
NEK6-209ENST00000444973 GRIN2BQ13224 1484 aa51.11■■■■■ 5.77
NEK6-209ENST00000444973 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.1■■■■■ 5.77
NEK6-209ENST00000444973 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.09■■■■■ 5.77
NEK6-209ENST00000444973 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.01■■■■■ 5.76
NEK6-209ENST00000444973 SYNJ1O43426 1573 aa50.95■■■■■ 5.75
NEK6-209ENST00000444973 SYNJ2O15056 1496 aa50.95■■■■■ 5.75
NEK6-209ENST00000444973 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.95■■■■■ 5.75
NEK6-209ENST00000444973 PBRM1Q86U86 1689 aa50.92■■■■■ 5.74
NEK6-209ENST00000444973 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.87■■■■■ 5.73
NEK6-209ENST00000444973 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.81■■■■■ 5.72
NEK6-209ENST00000444973 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.74■■■■■ 5.71
NEK6-209ENST00000444973 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.67■■■■■ 5.7
NEK6-209ENST00000444973 TOP2BQ02880 1626 aa50.58■■■■■ 5.69
NEK6-209ENST00000444973 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.58■■■■■ 5.69
NEK6-209ENST00000444973 GRIN2AQ12879 1464 aa50.47■■■■■ 5.67
NEK6-209ENST00000444973 ADAMTS12P58397 1594 aa50.45■■■■■ 5.67
NEK6-209ENST00000444973 CEP170Q5SW79 1584 aa50.31■■■■■ 5.64
NEK6-209ENST00000444973 NUP160Q12769 1436 aa50.29■■■■■ 5.64
NEK6-209ENST00000444973 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.28■■■■■ 5.64
NEK6-209ENST00000444973 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.27■■■■■ 5.64
NEK6-209ENST00000444973 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.21■■■■■ 5.63
NEK6-209ENST00000444973 SHROOM2Q13796 1616 aa50.06■■■■■ 5.6
NEK6-209ENST00000444973 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.84■■■■■ 5.57
NEK6-209ENST00000444973 JPH4Q96JJ6 628 aa49.78■■■■■ 5.56
NEK6-209ENST00000444973 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.74■■■■■ 5.55
NEK6-209ENST00000444973 KIF27Q86VH2 1401 aa49.6■■■■■ 5.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms