Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 418.33■□□□□ 0.521e-109■■■■■ 374.3
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DKC1O60832 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.111e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.131e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-109■■■■■ 374.3
DKC1O60832 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.8□□□□□ -2.281e-323■■■■■ 343.2
DKC1O60832 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 227.43■■□□□ 1.987e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.87e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 59.95□□□□□ -0.827e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.187e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.31□□□□□ -2.367e-71■■■■■ 267.5
DKC1O60832 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-206ENST00000561633 603 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.181e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 215.62■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.041e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-205ENST00000568363 786 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SNHG20-201ENST00000366365 1028 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.671e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.351e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)4.24□□□□□ -1.731e-323■■■■■ 261.6
DKC1O60832 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.825e-67■■■■■ 246.3
DKC1O60832 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.93□□□□□ -1.625e-67■■■■■ 246.3
DKC1O60832 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 SRGAP2B-206ENST00000621582 486 ntTSL 55.29□□□□□ -1.562e-278■■■■■ 237
DKC1O60832 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 230.9
DKC1O60832 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-12■■■■■ 223.1
DKC1O60832 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.641e-323■■■■■ 207.8
DKC1O60832 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.191e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.621e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.64□□□□□ -2.311e-323■■■■■ 205.3
DKC1O60832 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.841e-108■■■■■ 204
DKC1O60832 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 212.46□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 511.13□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.72□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.57□□□□□ -1.21e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.581e-323■■■■■ 203.1
DKC1O60832 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.86□□□□□ -0.992e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.492e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.692e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.47□□□□□ -1.852e-85■■■■■ 200.3
DKC1O60832 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.011e-323■■■■■ 192.5
DKC1O60832 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.623e-42■■■■■ 186.7
DKC1O60832 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.491e-323■■■■■ 184.1
DKC1O60832 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.711e-242■■■■■ 180.2
DKC1O60832 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.581e-242■■■■■ 180.2
DKC1O60832 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-242■■■■■ 180.2
DKC1O60832 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 216.16■□□□□ 0.185e-20■■■■■ 176
DKC1O60832 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 214.05□□□□□ -0.165e-20■■■■■ 176
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DKC1O60832 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 175.1
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DKC1O60832 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-67■■■■■ 174.2
DKC1O60832 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-323■■■■■ 170.7
DKC1O60832 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.47□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 170.7
DKC1O60832 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 54.39□□□□□ -1.711e-323■■■■■ 170.7
DKC1O60832 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.621e-323■■■■■ 170.4
DKC1O60832 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 31.77□□□□□ -2.134e-7■■■■■ 169.4
DKC1O60832 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 211.27□□□□□ -0.61e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.07□□□□□ -1.281e-323■■■■■ 168.8
DKC1O60832 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.79□□□□□ -2.121e-323■■■■■ 168.4
DKC1O60832 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.541e-323■■■■■ 165.7
DKC1O60832 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 33.95□□□□□ -1.781e-323■■■■■ 162.4
DKC1O60832 C14orf159-221ENST00000521334 909 ntTSL 321.53■■□□□ 1.046e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-225ENST00000522837 558 ntTSL 414.24□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-218ENST00000521064 544 ntTSL 414.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-232ENST00000523894 862 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-214ENST00000519950 1060 ntTSL 313.51□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 313.27□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-215ENST00000519994 1148 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 412.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-212ENST00000518871 484 ntTSL 411.42□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-233ENST00000524232 550 ntTSL 28.67□□□□□ -1.026e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.16e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-231ENST00000523879 650 ntTSL 57.35□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-209ENST00000518649 555 ntTSL 46.57□□□□□ -1.366e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 C14orf159-220ENST00000521081 622 ntTSL 26.49□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 158.2
DKC1O60832 SH3BP2-229ENST00000515802 2247 ntTSL 216.41■□□□□ 0.227e-34■■■■■ 150.2
DKC1O60832 SH3BP2-217ENST00000510204 3617 ntTSL 212.48□□□□□ -0.417e-34■■■■■ 150.2
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