RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.9■■■■□ 3.66
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SH3BP2-228ENST00000515737 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP2-228ENST00000515737 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.26■■■□□ 2.6
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC9O60706 1549 aa31.16■■■□□ 2.58
SH3BP2-228ENST00000515737 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.15■■■□□ 2.58
SH3BP2-228ENST00000515737 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.83■■■□□ 2.53
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SH3BP2-228ENST00000515737 SCRIBQ14160 1630 aa30.39■■■□□ 2.46
SH3BP2-228ENST00000515737 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.38■■■□□ 2.45
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SH3BP2-228ENST00000515737 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.311e-6■■□□□ 13.4
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SH3BP2-228ENST00000515737 WIZO95785 1651 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP2-228ENST00000515737 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.78■■■□□ 2.2
SH3BP2-228ENST00000515737 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SH3BP2-228ENST00000515737 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP2-228ENST00000515737 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.62■■■□□ 2.17
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SH3BP2-228ENST00000515737 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-228ENST00000515737 SMARCA2P51531 1590 aa28.56■■■□□ 2.16
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SH3BP2-228ENST00000515737 NCAPD3P42695 1498 aa28.32■■■□□ 2.12
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SH3BP2-228ENST00000515737 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.15■■■□□ 2.1
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SH3BP2-228ENST00000515737 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.76■■■□□ 2.03
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SH3BP2-228ENST00000515737 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-228ENST00000515737 NESP48681 1621 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-228ENST00000515737 CUX1P39880 1505 aa27.39■■□□□ 1.97
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SH3BP2-228ENST00000515737 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.33■■□□□ 1.97
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SH3BP2-228ENST00000515737 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.88■■□□□ 1.89
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SH3BP2-228ENST00000515737 CEP162Q5TB80 1403 aa26.86■■□□□ 1.89
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SH3BP2-228ENST00000515737 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.79■■□□□ 1.88
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SH3BP2-228ENST00000515737 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.57■■□□□ 1.84
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SH3BP2-228ENST00000515737 IFT140Q96RY7 1462 aa26.46■■□□□ 1.83
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SH3BP2-228ENST00000515737 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-228ENST00000515737 PBRM1Q86U86 1689 aa26.36■■□□□ 1.81
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SH3BP2-228ENST00000515737 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-228ENST00000515737 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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