RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520376.1

FBXW11-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 11, humanhuman

TSL 2

Gene FBXW11, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11-208ENST00000520376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.49■■■■■ 7.11
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FBXW11-208ENST00000520376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.04■■■■■ 5.6
FBXW11-208ENST00000520376 NACADO15069 1562 aa49.91■■■■■ 5.58
FBXW11-208ENST00000520376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.57■■■■■ 5.53
FBXW11-208ENST00000520376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.57■■■■■ 5.53
FBXW11-208ENST00000520376 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.52■■■■■ 5.52
FBXW11-208ENST00000520376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.24■■■■■ 5.47
FBXW11-208ENST00000520376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.08■■■■■ 5.45
FBXW11-208ENST00000520376 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.54■■■■■ 5.36
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FBXW11-208ENST00000520376 SCRIBQ14160 1630 aa48.43■■■■■ 5.34
FBXW11-208ENST00000520376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.02■■■■■ 5.28
FBXW11-208ENST00000520376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.81■■■■■ 5.24
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FBXW11-208ENST00000520376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.15■■■■■ 5.14
FBXW11-208ENST00000520376 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.78■■■■■ 5.08
FBXW11-208ENST00000520376 SMARCA4P51532 1647 aa46.29■■■■■ 5
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FBXW11-208ENST00000520376 SMARCA2P51531 1590 aa45.98■■■■■ 4.95
FBXW11-208ENST00000520376 NCAPD3P42695 1498 aa45.96■■■■■ 4.95
FBXW11-208ENST00000520376 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.85■■■■■ 4.93
FBXW11-208ENST00000520376 HMGXB3Q12766 1538 aa45.85■■■■■ 4.93
FBXW11-208ENST00000520376 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.83■■■■■ 4.93
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FBXW11-208ENST00000520376 ERCC6Q03468 1493 aa44.89■■■■■ 4.78
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FBXW11-208ENST00000520376 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.58■■■■■ 4.73
FBXW11-208ENST00000520376 CUX2O14529 1486 aa44.51■■■■■ 4.72
FBXW11-208ENST00000520376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.49■■■■■ 4.71
FBXW11-208ENST00000520376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
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FBXW11-208ENST00000520376 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.27■■■■■ 4.68
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FBXW11-208ENST00000520376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.15■■■■■ 4.66
FBXW11-208ENST00000520376 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.15■■■■■ 4.66
FBXW11-208ENST00000520376 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.13■■■■■ 4.65
FBXW11-208ENST00000520376 WDR62O43379 1518 aa44.04■■■■■ 4.64
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FBXW11-208ENST00000520376 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.42■■■■■ 4.54
FBXW11-208ENST00000520376 ABCC8Q09428 1581 aa43.37■■■■■ 4.53
FBXW11-208ENST00000520376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.22■■■■■ 4.51
FBXW11-208ENST00000520376 IFT140Q96RY7 1462 aa43.2■■■■■ 4.51
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FBXW11-208ENST00000520376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.93■■■■■ 4.46
FBXW11-208ENST00000520376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.83■■■■■ 4.45
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FBXW11-208ENST00000520376 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
FBXW11-208ENST00000520376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.71■■■■■ 4.43
FBXW11-208ENST00000520376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.7■■■■■ 4.43
FBXW11-208ENST00000520376 TOP2BQ02880 1626 aa42.66■■■■■ 4.42
FBXW11-208ENST00000520376 SYNJ1O43426 1573 aa42.65■■■■■ 4.42
FBXW11-208ENST00000520376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.63■■■■■ 4.41
FBXW11-208ENST00000520376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
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FBXW11-208ENST00000520376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.49■■■■■ 4.39
FBXW11-208ENST00000520376 PBRM1Q86U86 1689 aa42.47■■■■■ 4.39
FBXW11-208ENST00000520376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.45■■■■■ 4.39
FBXW11-208ENST00000520376 OSCARQ8IYS5 282 aa42.44■■■■■ 4.38
FBXW11-208ENST00000520376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.38■■■■■ 4.38
FBXW11-208ENST00000520376 GRIN2BQ13224 1484 aa42.37■■■■■ 4.37
FBXW11-208ENST00000520376 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.34■■■■■ 4.37
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FBXW11-208ENST00000520376 SYNJ2O15056 1496 aa42.14■■■■■ 4.34
FBXW11-208ENST00000520376 ADAMTS12P58397 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
FBXW11-208ENST00000520376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
FBXW11-208ENST00000520376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
FBXW11-208ENST00000520376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
FBXW11-208ENST00000520376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42■■■■■ 4.31
FBXW11-208ENST00000520376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
FBXW11-208ENST00000520376 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.97■■■■■ 4.31
FBXW11-208ENST00000520376 ARHGEF11O15085 1522 aa41.96■■■■■ 4.31
FBXW11-208ENST00000520376 GRIN2AQ12879 1464 aa41.85■■■■■ 4.29
FBXW11-208ENST00000520376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.83■■■■■ 4.29
FBXW11-208ENST00000520376 TRIM41Q8WV44 630 aa41.75■■■■■ 4.27
FBXW11-208ENST00000520376 KIF27Q86VH2 1401 aa41.73■■■■■ 4.27
FBXW11-208ENST00000520376 CEP170Q5SW79 1584 aa41.71■■■■■ 4.27
FBXW11-208ENST00000520376 CUL7Q14999 1698 aa41.67■■■■■ 4.26
FBXW11-208ENST00000520376 NUP160Q12769 1436 aa41.66■■■■■ 4.26
FBXW11-208ENST00000520376 ARAP1Q96P48 1450 aa41.6■■■■■ 4.25
FBXW11-208ENST00000520376 IGF1RP08069 1367 aa41.52■■■■■ 4.24
FBXW11-208ENST00000520376 SHROOM2Q13796 1616 aa41.48■■■■■ 4.23
FBXW11-208ENST00000520376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.46■■■■■ 4.23
FBXW11-208ENST00000520376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.39■■■■■ 4.22
FBXW11-208ENST00000520376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.35■■■■■ 4.21
FBXW11-208ENST00000520376 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.3■■■■■ 4.2
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