RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.1■■■■■ 5.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.48■■■■■ 4.87
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCC9O60706 1549 aa44.75■■■■■ 4.76
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.05■■■■■ 4.48
SH3BP2-210ENST00000505941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.99■■■■■ 4.47
SH3BP2-210ENST00000505941 NACADO15069 1562 aa42.87■■■■■ 4.45
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.51■■■■■ 4.4
SH3BP2-210ENST00000505941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.25■■■■■ 4.35
SH3BP2-210ENST00000505941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
SH3BP2-210ENST00000505941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.85■■■■■ 4.29
SH3BP2-210ENST00000505941 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.54■■■■■ 4.24
SH3BP2-210ENST00000505941 SCRIBQ14160 1630 aa41.51■■■■■ 4.23
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
SH3BP2-210ENST00000505941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.2■■■■■ 4.19
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.43■■■■■ 4.06
SH3BP2-210ENST00000505941 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.26■■■■■ 4.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SMARCA4P51532 1647 aa39.66■■■■□ 3.94
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SH3BP2-210ENST00000505941 NCAPD3P42695 1498 aa39.56■■■■□ 3.92
SH3BP2-210ENST00000505941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.53■■■■□ 3.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SMARCA2P51531 1590 aa39.52■■■■□ 3.92
SH3BP2-210ENST00000505941 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.34■■■■□ 3.89
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGXB3Q12766 1538 aa39.3■■■■□ 3.88
SH3BP2-210ENST00000505941 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.25■■■■□ 3.87
SH3BP2-210ENST00000505941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
SH3BP2-210ENST00000505941 WIZO95785 1651 aa38.92■■■■□ 3.82
SH3BP2-210ENST00000505941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ERCC6Q03468 1493 aa38.68■■■■□ 3.78
SH3BP2-210ENST00000505941 NESP48681 1621 aa38.61■■■■□ 3.77
SH3BP2-210ENST00000505941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.55■■■■□ 3.76
SH3BP2-210ENST00000505941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
SH3BP2-210ENST00000505941 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.44■■■■□ 3.74
SH3BP2-210ENST00000505941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.39■■■■□ 3.74
SH3BP2-210ENST00000505941 CUX2O14529 1486 aa38.27■■■■□ 3.72
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.13■■■■□ 3.69
SH3BP2-210ENST00000505941 CFTRP13569 1480 aa38.11■■■■□ 3.69
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.09■■■■□ 3.69
SH3BP2-210ENST00000505941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
SH3BP2-210ENST00000505941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.97■■■■□ 3.67
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.96■■■■□ 3.67
SH3BP2-210ENST00000505941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
SH3BP2-210ENST00000505941 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.92■■■■□ 3.66
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDM2Q13029 1718 aa37.75■■■■□ 3.63
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR62O43379 1518 aa37.74■■■■□ 3.63
SH3BP2-210ENST00000505941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCC8Q09428 1581 aa37.42■■■■□ 3.58
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.37■■■■□ 3.57
SH3BP2-210ENST00000505941 TOPBP1Q92547 1522 aa37.31■■■■□ 3.56
SH3BP2-210ENST00000505941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.25■■■■□ 3.55
SH3BP2-210ENST00000505941 IFT140Q96RY7 1462 aa37.18■■■■□ 3.54
SH3BP2-210ENST00000505941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
SH3BP2-210ENST00000505941 SOGA1O94964 1423 aa36.93■■■■□ 3.5
SH3BP2-210ENST00000505941 CUX1P39880 1505 aa36.92■■■■□ 3.5
SH3BP2-210ENST00000505941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.88■■■■□ 3.49
SH3BP2-210ENST00000505941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.83■■■■□ 3.49
SH3BP2-210ENST00000505941 OSCARQ8IYS5 282 aa36.79■■■■□ 3.48
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SH3BP2-210ENST00000505941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.47
SH3BP2-210ENST00000505941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR97A6NE52 1622 aa36.63■■■■□ 3.45
SH3BP2-210ENST00000505941 TOP2BQ02880 1626 aa36.58■■■■□ 3.45
SH3BP2-210ENST00000505941 FBLN2P98095 1184 aa36.55■■■■□ 3.44
SH3BP2-210ENST00000505941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.55■■■■□ 3.44
SH3BP2-210ENST00000505941 SYNJ1O43426 1573 aa36.52■■■■□ 3.44
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.5■■■■□ 3.43
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIN2BQ13224 1484 aa36.48■■■■□ 3.43
SH3BP2-210ENST00000505941 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.46■■■■□ 3.43
SH3BP2-210ENST00000505941 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
SH3BP2-210ENST00000505941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.41■■■■□ 3.42
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
SH3BP2-210ENST00000505941 CHD1O14646 1710 aa36.35■■■■□ 3.41
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.3■■■■□ 3.4
SH3BP2-210ENST00000505941 PBRM1Q86U86 1689 aa36.3■■■■□ 3.4
SH3BP2-210ENST00000505941 SYNJ2O15056 1496 aa36.24■■■■□ 3.39
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM41Q8WV44 630 aa36.15■■■■□ 3.38
SH3BP2-210ENST00000505941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.08■■■■□ 3.37
SH3BP2-210ENST00000505941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.04■■■■□ 3.36
SH3BP2-210ENST00000505941 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-210ENST00000505941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-210ENST00000505941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF11O15085 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF27Q86VH2 1401 aa36.01■■■■□ 3.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAMTS12P58397 1594 aa35.99■■■■□ 3.35
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIN2AQ12879 1464 aa35.98■■■■□ 3.35
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SH3BP2-210ENST00000505941 NUP160Q12769 1436 aa35.79■■■■□ 3.32
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP170Q5SW79 1584 aa35.74■■■■□ 3.31
SH3BP2-210ENST00000505941 CUL7Q14999 1698 aa35.72■■■■□ 3.31
SH3BP2-210ENST00000505941 ARAP1Q96P48 1450 aa35.68■■■■□ 3.3
SH3BP2-210ENST00000505941 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.66■■■■□ 3.3
SH3BP2-210ENST00000505941 JPH4Q96JJ6 628 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP2-210ENST00000505941 SHROOM2Q13796 1616 aa35.5■■■■□ 3.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.49■■■■□ 3.27
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