RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.51■■■■■ 6.48
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SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.97■■■■■ 5.11
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SH3BP2-221ENST00000511747 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.38■■■■■ 4.85
SH3BP2-221ENST00000511747 HRCP23327 699 aa44.6■■■■■ 4.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
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SH3BP2-221ENST00000511747 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
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SH3BP2-221ENST00000511747 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.63■■■■■ 4.25
SH3BP2-221ENST00000511747 EEA1Q15075 1411 aa41.6■■■■■ 4.25
SH3BP2-221ENST00000511747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.53■■■■■ 4.24
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SH3BP2-221ENST00000511747 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.38■■■■■ 4.22
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA3Q08378 1498 aa41.3■■■■■ 4.2
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
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SH3BP2-221ENST00000511747 SYNJ1O43426 1573 aa41.09■■■■■ 4.17
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.05■■■■■ 4.16
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SH3BP2-221ENST00000511747 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.71■■■■■ 4.11
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SH3BP2-221ENST00000511747 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.31■■■■■ 4.04
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SH3BP2-221ENST00000511747 TIAM1Q13009 1591 aa39.35■■■■□ 3.89
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SH3BP2-221ENST00000511747 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.19■■■■□ 3.86
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