RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.24■■■■■ 4.99
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.36■■■■■ 4.21
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC9O60706 1549 aa40.55■■■■■ 4.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.9■■■■□ 3.82
SH3BP2-218ENST00000511185 NACADO15069 1562 aa38.76■■■■□ 3.8
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.49■■■■□ 3.75
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.41■■■■□ 3.74
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.36■■■■□ 3.73
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.21■■■■□ 3.71
SH3BP2-218ENST00000511185 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.85■■■■□ 3.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SCRIBQ14160 1630 aa37.75■■■■□ 3.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.72■■■■□ 3.63
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.3■■■■□ 3.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.24■■■■□ 3.55
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.74■■■■□ 3.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.4■■■■□ 3.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCA4P51532 1647 aa36.05■■■■□ 3.36
SH3BP2-218ENST00000511185 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.76■■■■□ 3.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCA2P51531 1590 aa35.71■■■■□ 3.31
SH3BP2-218ENST00000511185 NCAPD3P42695 1498 aa35.7■■■■□ 3.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.7■■■■□ 3.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGXB3Q12766 1538 aa35.64■■■■□ 3.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.63■■■■□ 3.29
SH3BP2-218ENST00000511185 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
SH3BP2-218ENST00000511185 WIZO95785 1651 aa35.4■■■■□ 3.26
SH3BP2-218ENST00000511185 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
SH3BP2-218ENST00000511185 NESP48681 1621 aa35.08■■■■□ 3.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.91■■■■□ 3.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC6Q03468 1493 aa34.89■■■■□ 3.18
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.83■■■■□ 3.17
SH3BP2-218ENST00000511185 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.62■■■■□ 3.13
SH3BP2-218ENST00000511185 CUX2O14529 1486 aa34.59■■■■□ 3.13
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM2Q13029 1718 aa34.51■■■■□ 3.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.51■■■■□ 3.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CFTRP13569 1480 aa34.44■■■■□ 3.1
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.42■■■■□ 3.1
SH3BP2-218ENST00000511185 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.33■■■■□ 3.09
SH3BP2-218ENST00000511185 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR62O43379 1518 aa34.28■■■■□ 3.08
SH3BP2-218ENST00000511185 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
SH3BP2-218ENST00000511185 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.77■■■■□ 3
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.62■■■□□ 2.97
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC8Q09428 1581 aa33.61■■■□□ 2.97
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT140Q96RY7 1462 aa33.55■■■□□ 2.96
SH3BP2-218ENST00000511185 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SH3BP2-218ENST00000511185 CUX1P39880 1505 aa33.52■■■□□ 2.96
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
SH3BP2-218ENST00000511185 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
SH3BP2-218ENST00000511185 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.4■■■□□ 2.94
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.35■■■□□ 2.93
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR97A6NE52 1622 aa33.35■■■□□ 2.93
SH3BP2-218ENST00000511185 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.24■■■□□ 2.91
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNJ1O43426 1573 aa33.23■■■□□ 2.91
SH3BP2-218ENST00000511185 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.23■■■□□ 2.91
SH3BP2-218ENST00000511185 SOGA1O94964 1423 aa33.21■■■□□ 2.91
SH3BP2-218ENST00000511185 CHD1O14646 1710 aa33.2■■■□□ 2.91
SH3BP2-218ENST00000511185 TOP2BQ02880 1626 aa33.17■■■□□ 2.9
SH3BP2-218ENST00000511185 PBRM1Q86U86 1689 aa33.13■■■□□ 2.89
SH3BP2-218ENST00000511185 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.06■■■□□ 2.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.02■■■□□ 2.88
SH3BP2-218ENST00000511185 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.99■■■□□ 2.87
SH3BP2-218ENST00000511185 OSCARQ8IYS5 282 aa32.92■■■□□ 2.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIN2BQ13224 1484 aa32.9■■■□□ 2.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.89■■■□□ 2.86
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.8■■■□□ 2.84
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.8■■■□□ 2.84
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.8■■■□□ 2.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS12P58397 1594 aa32.76■■■□□ 2.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNJ2O15056 1496 aa32.74■■■□□ 2.83
SH3BP2-218ENST00000511185 FBLN2P98095 1184 aa32.73■■■□□ 2.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.69■■■□□ 2.82
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF11O15085 1522 aa32.68■■■□□ 2.82
SH3BP2-218ENST00000511185 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.61■■■□□ 2.81
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIN2AQ12879 1464 aa32.54■■■□□ 2.8
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP170Q5SW79 1584 aa32.51■■■□□ 2.79
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM41Q8WV44 630 aa32.51■■■□□ 2.79
SH3BP2-218ENST00000511185 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.46■■■□□ 2.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ARAP1Q96P48 1450 aa32.42■■■□□ 2.78
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP160Q12769 1436 aa32.39■■■□□ 2.78
SH3BP2-218ENST00000511185 CUL7Q14999 1698 aa32.38■■■□□ 2.77
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF27Q86VH2 1401 aa32.35■■■□□ 2.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SHROOM2Q13796 1616 aa32.31■■■□□ 2.76
SH3BP2-218ENST00000511185 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.3■■■□□ 2.76
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.29■■■□□ 2.76
SH3BP2-218ENST00000511185 IGF1RP08069 1367 aa32.23■■■□□ 2.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.16■■■□□ 2.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.04■■■□□ 2.72
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