RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.78■■■■■ 5.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC9O60706 1549 aa42.81■■■■■ 4.44
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.79■■■■■ 4.44
SH3BP2-220ENST00000511663 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.58■■■■■ 4.09
SH3BP2-220ENST00000511663 NACADO15069 1562 aa40.52■■■■■ 4.08
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.07■■■■■ 4.01
SH3BP2-220ENST00000511663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.94■■■■□ 3.98
SH3BP2-220ENST00000511663 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.7■■■■□ 3.95
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
SH3BP2-220ENST00000511663 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.46■■■■□ 3.91
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.45■■■■□ 3.91
SH3BP2-220ENST00000511663 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.03■■■■□ 3.84
SH3BP2-220ENST00000511663 SCRIBQ14160 1630 aa39.03■■■■□ 3.84
SH3BP2-220ENST00000511663 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.63■■■■□ 3.77
SH3BP2-220ENST00000511663 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.57■■■■□ 3.76
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
SH3BP2-220ENST00000511663 NCAPD3P42695 1498 aa37.41■■■■□ 3.58
SH3BP2-220ENST00000511663 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.28■■■■□ 3.56
SH3BP2-220ENST00000511663 SMARCA4P51532 1647 aa37.22■■■■□ 3.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SMARCA2P51531 1590 aa37.21■■■■□ 3.55
SH3BP2-220ENST00000511663 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
SH3BP2-220ENST00000511663 HMGXB3Q12766 1538 aa37.08■■■■□ 3.53
SH3BP2-220ENST00000511663 ERCC6Q03468 1493 aa37.04■■■■□ 3.52
SH3BP2-220ENST00000511663 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CUX2O14529 1486 aa36.88■■■■□ 3.49
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.84■■■■□ 3.49
SH3BP2-220ENST00000511663 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.83■■■■□ 3.49
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.79■■■■□ 3.48
SH3BP2-220ENST00000511663 NESP48681 1621 aa36.74■■■■□ 3.47
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.53■■■■□ 3.44
SH3BP2-220ENST00000511663 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
SH3BP2-220ENST00000511663 WIZO95785 1651 aa36.35■■■■□ 3.41
SH3BP2-220ENST00000511663 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.32■■■■□ 3.4
SH3BP2-220ENST00000511663 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.23■■■■□ 3.39
SH3BP2-220ENST00000511663 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
SH3BP2-220ENST00000511663 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.02■■■■□ 3.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.92■■■■□ 3.34
SH3BP2-220ENST00000511663 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR62O43379 1518 aa35.88■■■■□ 3.33
SH3BP2-220ENST00000511663 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.87■■■■□ 3.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CFTRP13569 1480 aa35.86■■■■□ 3.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.54■■■■□ 3.28
SH3BP2-220ENST00000511663 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM2Q13029 1718 aa35.41■■■■□ 3.26
SH3BP2-220ENST00000511663 OSCARQ8IYS5 282 aa35.36■■■■□ 3.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM41Q8WV44 630 aa35.33■■■■□ 3.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
SH3BP2-220ENST00000511663 IFT140Q96RY7 1462 aa35.2■■■■□ 3.23
SH3BP2-220ENST00000511663 TOPBP1Q92547 1522 aa35.17■■■■□ 3.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SH3BP2-220ENST00000511663 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
SH3BP2-220ENST00000511663 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
SH3BP2-220ENST00000511663 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
SH3BP2-220ENST00000511663 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SOGA1O94964 1423 aa34.76■■■■□ 3.16
SH3BP2-220ENST00000511663 FBLN2P98095 1184 aa34.75■■■■□ 3.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.71■■■■□ 3.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.62■■■■□ 3.13
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF11O15085 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
SH3BP2-220ENST00000511663 CHD1O14646 1710 aa34.57■■■■□ 3.12
SH3BP2-220ENST00000511663 CUX1P39880 1505 aa34.55■■■■□ 3.12
SH3BP2-220ENST00000511663 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.51■■■■□ 3.12
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR97A6NE52 1622 aa34.5■■■■□ 3.11
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.44■■■■□ 3.1
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIN2BQ13224 1484 aa34.41■■■■□ 3.1
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
SH3BP2-220ENST00000511663 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.3■■■■□ 3.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNJ1O43426 1573 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNJ2O15056 1496 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ARAP1Q96P48 1450 aa34.24■■■■□ 3.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.23■■■■□ 3.07
SH3BP2-220ENST00000511663 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PBRM1Q86U86 1689 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.09■■■■□ 3.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TOP2BQ02880 1626 aa34.04■■■■□ 3.04
SH3BP2-220ENST00000511663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.01■■■■□ 3.03
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIN2AQ12879 1464 aa33.93■■■■□ 3.02
SH3BP2-220ENST00000511663 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.87■■■■□ 3.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS12P58397 1594 aa33.85■■■■□ 3.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.81■■■■□ 3
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP160Q12769 1436 aa33.79■■■■□ 3
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP170Q5SW79 1584 aa33.74■■■□□ 2.99
SH3BP2-220ENST00000511663 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.64■■■□□ 2.98
SH3BP2-220ENST00000511663 JPH4Q96JJ6 628 aa33.6■■■□□ 2.97
SH3BP2-220ENST00000511663 SHROOM2Q13796 1616 aa33.57■■■□□ 2.96
SH3BP2-220ENST00000511663 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF27Q86VH2 1401 aa33.5■■■□□ 2.95
SH3BP2-220ENST00000511663 IGF1RP08069 1367 aa33.45■■■□□ 2.94
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