RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.05■■■■■ 4.16
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SH3BP2-202ENST00000435136 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
SH3BP2-202ENST00000435136 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.14■■■■□ 3.06
SH3BP2-202ENST00000435136 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.07■■■■□ 3.04
SH3BP2-202ENST00000435136 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.84■■■■□ 3.01
SH3BP2-202ENST00000435136 NACADO15069 1562 aa33.81■■■■□ 3
SH3BP2-202ENST00000435136 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.64■■■□□ 2.98
SH3BP2-202ENST00000435136 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.59■■■□□ 2.97
SH3BP2-202ENST00000435136 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.15■■■□□ 2.91e-6■■□□□ 13.4
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SH3BP2-202ENST00000435136 SCRIBQ14160 1630 aa32.94■■■□□ 2.86
SH3BP2-202ENST00000435136 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.91■■■□□ 2.86
SH3BP2-202ENST00000435136 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.56■■■□□ 2.8
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SH3BP2-202ENST00000435136 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
SH3BP2-202ENST00000435136 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.89■■■□□ 2.7
SH3BP2-202ENST00000435136 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.76■■■□□ 2.67
SH3BP2-202ENST00000435136 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
SH3BP2-202ENST00000435136 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.68■■■□□ 2.66
SH3BP2-202ENST00000435136 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.64■■■□□ 2.66
SH3BP2-202ENST00000435136 WIZO95785 1651 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP2-202ENST00000435136 SMARCA4P51532 1647 aa31.45■■■□□ 2.63
SH3BP2-202ENST00000435136 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.34■■■□□ 2.61
SH3BP2-202ENST00000435136 NCAPD3P42695 1498 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP2-202ENST00000435136 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
SH3BP2-202ENST00000435136 SMARCA2P51531 1590 aa31.2■■■□□ 2.58
SH3BP2-202ENST00000435136 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP2-202ENST00000435136 HMGXB3Q12766 1538 aa31.04■■■□□ 2.56
SH3BP2-202ENST00000435136 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.84■■■□□ 2.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM41Q8WV44 630 aa30.74■■■□□ 2.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NESP48681 1621 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BP2-202ENST00000435136 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BP2-202ENST00000435136 ERCC6Q03468 1493 aa30.38■■■□□ 2.45
SH3BP2-202ENST00000435136 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.37■■■□□ 2.45
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.34■■■□□ 2.45
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCC8Q09428 1581 aa30.32■■■□□ 2.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP2-202ENST00000435136 CFTRP13569 1480 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP2-202ENST00000435136 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.13■■■□□ 2.41
SH3BP2-202ENST00000435136 EEA1Q15075 1411 aa30.1■■■□□ 2.41
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SH3BP2-202ENST00000435136 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP2-202ENST00000435136 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SYNJ1O43426 1573 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CUX2O14529 1486 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PRDM2Q13029 1718 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TOP2BQ02880 1626 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-202ENST00000435136 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP2-202ENST00000435136 SOGA1O94964 1423 aa29.86■■■□□ 2.37
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SH3BP2-202ENST00000435136 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.69■■■□□ 2.34
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SH3BP2-202ENST00000435136 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.65■■■□□ 2.34
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA3Q08378 1498 aa29.64■■■□□ 2.33
SH3BP2-202ENST00000435136 CUX1P39880 1505 aa29.61■■■□□ 2.33
SH3BP2-202ENST00000435136 TOPBP1Q92547 1522 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-202ENST00000435136 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.56■■■□□ 2.32
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SH3BP2-202ENST00000435136 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.51■■■□□ 2.31
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP162Q5TB80 1403 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP2-202ENST00000435136 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.46■■■□□ 2.31
SH3BP2-202ENST00000435136 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP2-202ENST00000435136 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF27Q86VH2 1401 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP2-202ENST00000435136 IFT140Q96RY7 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
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SH3BP2-202ENST00000435136 PRXQ9BXM0 1461 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP2-202ENST00000435136 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP2-202ENST00000435136 HRCP23327 699 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP2-202ENST00000435136 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP2-202ENST00000435136 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP2-202ENST00000435136 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SH3BP2-202ENST00000435136 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.16■■■□□ 2.26
SH3BP2-202ENST00000435136 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SH3BP2-202ENST00000435136 CLIP1P30622 1438 aa29.13■■■□□ 2.25
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SH3BP2-202ENST00000435136 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.01■■■□□ 2.23
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SH3BP2-202ENST00000435136 WDR97A6NE52 1622 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-202ENST00000435136 OSCARQ8IYS5 282 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-202ENST00000435136 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-202ENST00000435136 FBLN2P98095 1184 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-202ENST00000435136 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-202ENST00000435136 CUL7Q14999 1698 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-202ENST00000435136 GRIN2BQ13224 1484 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-202ENST00000435136 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.79■■■□□ 2.2
SH3BP2-202ENST00000435136 ARAP1Q96P48 1450 aa28.79■■■□□ 2.2
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