Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1V6

DDX59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX59Q5T1V6 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 415.58■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 414.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 413.61□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 46.93□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF76-205ENST00000469195 1373 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF76-201ENST00000229405 4651 ntTSL 29.69□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-231ENST00000600648 433 ntTSL 519.28■□□□□ 0.689e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.359e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.079e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.469e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.159e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 55.17□□□□□ -1.589e-9■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CYP2W1-203ENST00000415893 890 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-14■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 219.72■□□□□ 0.758e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 317.61■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF219-205ENST00000553980 576 ntTSL 417.18■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.288e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-210ENST00000636180 3019 ntTSL 516.65■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-203ENST00000430397 1844 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 KIF2A-209ENST00000512541 549 ntTSL 416.28■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-211ENST00000636241 2010 ntTSL 516.25■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-215ENST00000636661 4378 ntTSL 515.88■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-213ENST00000636492 1395 ntTSL 515.77■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-220ENST00000637538 1545 ntTSL 515.71■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-222ENST00000638134 2118 ntTSL 515.7■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GPT-201ENST00000354769 583 ntTSL 215.68■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GPT-206ENST00000531330 560 ntTSL 415.04■□□□□ -08e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 BCL9L-203ENST00000527266 696 ntTSL 315.01□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-213ENST00000472155 2646 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-216ENST00000496466 2339 ntTSL 214.36□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-215ENST00000494942 2325 ntTSL 214.32□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 WWOX-213ENST00000566662 571 ntTSL 414.25□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 514.18□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 33
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DDX59Q5T1V6 ZNF219-211ENST00000556174 546 ntTSL 414.07□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF219-206ENST00000554478 545 ntTSL 413.7□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-214ENST00000475591 2542 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-214ENST00000636658 733 ntTSL 512.07□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 ZNF219-209ENST00000555697 654 ntTSL 211.84□□□□□ -0.518e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-207ENST00000475279 938 ntTSL 511.39□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-208ENST00000574554 1314 ntTSL 211.36□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.11□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 210.99□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-201ENST00000301328 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-215ENST00000576419 705 ntTSL 310.34□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 510.23□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-221ENST00000637909 2910 ntTSL 510.13□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-219ENST00000637392 4615 ntTSL 510.04□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 AL121832.3-201ENST00000616512 3700 ntBASIC9.41□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-204ENST00000571073 2311 ntTSL 28.96□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 48.93□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 28.68□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-214ENST00000576239 2737 ntTSL 28.05□□□□□ -1.128e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 CLCN2-212ENST00000636419 287 ntTSL 57.94□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 GLOD4-213ENST00000575851 1063 ntTSL 37.64□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 DOCK1-204ENST00000484400 779 ntTSL 37.5□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 33
DDX59Q5T1V6 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 33
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