RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.62	■■■■□ 3.77
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABCC9	O60706	1549 aa		35.47	■■■■□ 3.27
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.65	■■■■□ 3.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PRKCZ-222	ENST00000496325	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.93	■■■□□ 2.86
PRKCZ-222	ENST00000496325	NACAD	O15069	1562 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRKCZ-222	ENST00000496325	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PRKCZ-222	ENST00000496325	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKCZ-222	ENST00000496325	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PRKCZ-222	ENST00000496325	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRKCZ-222	ENST00000496325	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PRKCZ-222	ENST00000496325	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PRKCZ-222	ENST00000496325	CUX2	O14529	1486 aa		30.73	■■■□□ 2.51
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.58	■■■□□ 2.49
PRKCZ-222	ENST00000496325	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.4	■■■□□ 2.46
PRKCZ-222	ENST00000496325	NES	P48681	1621 aa		30.31	■■■□□ 2.44
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.25	■■■□□ 2.43
PRKCZ-222	ENST00000496325	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PRKCZ-222	ENST00000496325	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.07	■■■□□ 2.4
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PRKCZ-222	ENST00000496325	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PRKCZ-222	ENST00000496325	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
PRKCZ-222	ENST00000496325	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PRKCZ-222	ENST00000496325	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PRKCZ-222	ENST00000496325	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PRKCZ-222	ENST00000496325	WIZ	O95785	1651 aa		29.53	■■■□□ 2.32
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR62	O43379	1518 aa		29.46	■■■□□ 2.31
PRKCZ-222	ENST00000496325	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PRKCZ-222	ENST00000496325	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
PRKCZ-222	ENST00000496325	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRKCZ-222	ENST00000496325	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCZ-222	ENST00000496325	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PRKCZ-222	ENST00000496325	CFTR	P13569	1480 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHD1	O14646	1710 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-222	ENST00000496325	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBLN2	P98095	1184 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SOGA1	O94964	1423 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	CUX1	P39880	1505 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.7	■■■□□ 2.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.54	■■■□□ 2
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.51	■■■□□ 2
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUP160	Q12769	1436 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PRKCZ-222	ENST00000496325	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PRKCZ-222	ENST00000496325	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PRKCZ-222	ENST00000496325	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		27.22	■■□□□ 1.95

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