Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 STON2-205ENST00000555284 2362 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 NUP188-204ENST00000467044 584 ntTSL 212.66□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 34.5
FMR1Q06787 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 415.21■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 34.4
FMR1Q06787 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 34.4
FMR1Q06787 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 34.4
FMR1Q06787 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 41.83□□□□□ -2.125e-7■■■■■ 34.4
FMR1Q06787 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC9.12□□□□□ -0.951e-323■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -11e-323■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.081e-323■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 MALAT1-216ENST00000620465 333 ntTSL 26.13□□□□□ -1.431e-323■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.658e-8■■■■■ 34.3
FMR1Q06787 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 58.28□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 34.2
FMR1Q06787 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 34.2
FMR1Q06787 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 34.2
FMR1Q06787 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 34.2
FMR1Q06787 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 34.2
FMR1Q06787 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 34.2
FMR1Q06787 NUP188-207ENST00000487952 568 ntTSL 216.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 PHF20L1-211ENST00000460236 3393 ntTSL 56.46□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 321.93■■□□□ 1.19e-20■■■■■ 34.1
FMR1Q06787 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 534.33■■■■□ 3.091e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 524.04■■□□□ 1.441e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.361e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NCOA1-211ENST00000496333 501 ntTSL 321.94■■□□□ 1.11e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NCOA1-207ENST00000469850 537 ntTSL 521.94■■□□□ 1.11e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 321.44■■□□□ 1.021e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 MRPS25-204ENST00000447299 723 ntTSL 321.3■■□□□ 11e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 520.35■□□□□ 0.851e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 PPARGC1B-206ENST00000461780 566 ntTSL 420.27■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 34
FMR1Q06787 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.541e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 MRPS25-202ENST00000420267 590 ntTSL 416.45■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 KIF13A-210ENST00000506044 810 ntTSL 414.44□□□□□ -0.11e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.92□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 CHST11-204ENST00000549016 573 ntTSL 413.7□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt13.51□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 310.13□□□□□ -0.791e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 210.09□□□□□ -0.791e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 59.75□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.051e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 KIF13A-206ENST00000502297 4009 ntTSL 58.5□□□□□ -1.051e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 KIF13A-212ENST00000514714 602 ntTSL 48.01□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 27.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 37.43□□□□□ -1.221e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 IKZF1-215ENST00000492119 584 ntTSL 36.06□□□□□ -1.441e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.471e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 NPM1-207ENST00000521260 510 ntTSL 25.36□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 34
FMR1Q06787 EHMT2-206ENST00000461880 1825 ntTSL 516.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 33.9
FMR1Q06787 EHMT2-205ENST00000436026 894 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 33.9
FMR1Q06787 EHMT2-210ENST00000478491 1517 ntTSL 514.67□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 33.9
FMR1Q06787 EHMT2-212ENST00000494816 3036 ntTSL 512.31□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 33.9
FMR1Q06787 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 AC025165.3-203ENST00000546504 373 ntAPPRIS P1 TSL 218.44■□□□□ 0.545e-9■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 AC025165.3-202ENST00000553083 332 ntTSL 214.01□□□□□ -0.175e-9■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 CLTC-211ENST00000579815 609 ntTSL 57.54□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.027e-9■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 33.8
FMR1Q06787 MCM3AP-206ENST00000481113 570 ntTSL 215.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 224.05■■□□□ 1.448e-9■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.398e-9■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 TMEM135-203ENST00000525018 753 ntTSL 510.1□□□□□ -0.798e-9■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.068e-9■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.18e-9■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 27.95□□□□□ -1.148e-9■■■■■ 33.7
FMR1Q06787 ESYT1-207ENST00000550878 646 ntTSL 515□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 33.6
FMR1Q06787 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 411.37□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 33.6
FMR1Q06787 CNP-207ENST00000587679 581 ntTSL 429.78■■■□□ 2.365e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-211ENST00000592446 587 ntTSL 429.78■■■□□ 2.365e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.35e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-203ENST00000441615 622 ntTSL 321.56■■□□□ 1.045e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-208ENST00000589772 516 ntTSL 416.62■□□□□ 0.255e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.175e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 CNP-206ENST00000585452 689 ntTSL 212.05□□□□□ -0.485e-9■■■■■ 33.5
FMR1Q06787 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.277e-18■■■■■ 33.5
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 59.9 ms