RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592446.1

CNP-211, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-211ENST00000592446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.86■■■■■ 6.85
CNP-211ENST00000592446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.43■■■■■ 5.82
CNP-211ENST00000592446 ABCC9O60706 1549 aa51.12■■■■■ 5.77
CNP-211ENST00000592446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.8■■■■■ 5.4
CNP-211ENST00000592446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.77■■■■■ 5.4
CNP-211ENST00000592446 NACADO15069 1562 aa48.64■■■■■ 5.38
CNP-211ENST00000592446 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.21■■■■■ 5.31
CNP-211ENST00000592446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
CNP-211ENST00000592446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.81■■■■■ 5.24
CNP-211ENST00000592446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.8■■■■■ 5.24
CNP-211ENST00000592446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.56■■■■■ 5.2
CNP-211ENST00000592446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.44■■■■■ 5.18
CNP-211ENST00000592446 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.37■■■■■ 5.17
CNP-211ENST00000592446 SCRIBQ14160 1630 aa47.01■■■■■ 5.12
CNP-211ENST00000592446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.81■■■■■ 5.08
CNP-211ENST00000592446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
CNP-211ENST00000592446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.1■■■■■ 4.97
CNP-211ENST00000592446 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.99■■■■■ 4.95
CNP-211ENST00000592446 NCAPD3P42695 1498 aa45.02■■■■■ 4.8
CNP-211ENST00000592446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.95■■■■■ 4.79
CNP-211ENST00000592446 SMARCA4P51532 1647 aa44.9■■■■■ 4.78
CNP-211ENST00000592446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
CNP-211ENST00000592446 SMARCA2P51531 1590 aa44.77■■■■■ 4.76
CNP-211ENST00000592446 HMGXB3Q12766 1538 aa44.6■■■■■ 4.73
CNP-211ENST00000592446 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.6■■■■■ 4.73
CNP-211ENST00000592446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
CNP-211ENST00000592446 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.49■■■■■ 4.71
CNP-211ENST00000592446 ERCC6Q03468 1493 aa44.07■■■■■ 4.65
CNP-211ENST00000592446 NESP48681 1621 aa44.06■■■■■ 4.64
CNP-211ENST00000592446 WIZO95785 1651 aa43.97■■■■■ 4.63
CNP-211ENST00000592446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
CNP-211ENST00000592446 CUX2O14529 1486 aa43.76■■■■■ 4.6
CNP-211ENST00000592446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.75■■■■■ 4.59
CNP-211ENST00000592446 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.71■■■■■ 4.59
CNP-211ENST00000592446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.63■■■■■ 4.57
CNP-211ENST00000592446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
CNP-211ENST00000592446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
CNP-211ENST00000592446 CFTRP13569 1480 aa43.29■■■■■ 4.52
CNP-211ENST00000592446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.29■■■■■ 4.52
CNP-211ENST00000592446 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.22■■■■■ 4.51
CNP-211ENST00000592446 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.16■■■■■ 4.5
CNP-211ENST00000592446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.14■■■■■ 4.5
CNP-211ENST00000592446 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.13■■■■■ 4.49
CNP-211ENST00000592446 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.1■■■■■ 4.49
CNP-211ENST00000592446 WDR62O43379 1518 aa42.98■■■■■ 4.47
CNP-211ENST00000592446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
CNP-211ENST00000592446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
CNP-211ENST00000592446 PRDM2Q13029 1718 aa42.49■■■■■ 4.39
CNP-211ENST00000592446 TOPBP1Q92547 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
CNP-211ENST00000592446 ABCC8Q09428 1581 aa42.32■■■■■ 4.37
CNP-211ENST00000592446 IFT140Q96RY7 1462 aa42.24■■■■■ 4.35
CNP-211ENST00000592446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.2■■■■■ 4.35
CNP-211ENST00000592446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
CNP-211ENST00000592446 OSCARQ8IYS5 282 aa42.02■■■■■ 4.32
CNP-211ENST00000592446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
CNP-211ENST00000592446 SOGA1O94964 1423 aa41.88■■■■■ 4.3
CNP-211ENST00000592446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.291e-8■□□□□ 11.2
CNP-211ENST00000592446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.86■■■■■ 4.29
CNP-211ENST00000592446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CNP-211ENST00000592446 CUX1P39880 1505 aa41.85■■■■■ 4.29
CNP-211ENST00000592446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.8■■■■■ 4.28
CNP-211ENST00000592446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CNP-211ENST00000592446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
CNP-211ENST00000592446 TRIM41Q8WV44 630 aa41.56■■■■■ 4.24
CNP-211ENST00000592446 FBLN2P98095 1184 aa41.54■■■■■ 4.24
CNP-211ENST00000592446 WDR97A6NE52 1622 aa41.44■■■■■ 4.22
CNP-211ENST00000592446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
CNP-211ENST00000592446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.4■■■■■ 4.22
CNP-211ENST00000592446 GRIN2BQ13224 1484 aa41.39■■■■■ 4.22
CNP-211ENST00000592446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.37■■■■■ 4.21
CNP-211ENST00000592446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
CNP-211ENST00000592446 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.33■■■■■ 4.21
CNP-211ENST00000592446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
CNP-211ENST00000592446 TOP2BQ02880 1626 aa41.27■■■■■ 4.2
CNP-211ENST00000592446 SYNJ1O43426 1573 aa41.25■■■■■ 4.19
CNP-211ENST00000592446 CHD1O14646 1710 aa41.24■■■■■ 4.19
CNP-211ENST00000592446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.19■■■■■ 4.18
CNP-211ENST00000592446 ARHGEF11O15085 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
CNP-211ENST00000592446 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
CNP-211ENST00000592446 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.16■■■■■ 4.18
CNP-211ENST00000592446 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.16■■■■■ 4.18
CNP-211ENST00000592446 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.16■■■■■ 4.18
CNP-211ENST00000592446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.13■■■■■ 4.17
CNP-211ENST00000592446 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.01■■■■■ 4.16
CNP-211ENST00000592446 PBRM1Q86U86 1689 aa41■■■■■ 4.15
CNP-211ENST00000592446 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.96■■■■■ 4.15
CNP-211ENST00000592446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.85■■■■■ 4.13
CNP-211ENST00000592446 ARAP1Q96P48 1450 aa40.85■■■■■ 4.13
CNP-211ENST00000592446 GRIN2AQ12879 1464 aa40.83■■■■■ 4.13
CNP-211ENST00000592446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.82■■■■■ 4.12
CNP-211ENST00000592446 ADAMTS12P58397 1594 aa40.8■■■■■ 4.12
CNP-211ENST00000592446 NUP160Q12769 1436 aa40.71■■■■■ 4.11
CNP-211ENST00000592446 KIF27Q86VH2 1401 aa40.62■■■■■ 4.09
CNP-211ENST00000592446 CEP170Q5SW79 1584 aa40.61■■■■■ 4.09
CNP-211ENST00000592446 IGF1RP08069 1367 aa40.61■■■■■ 4.09
CNP-211ENST00000592446 JPH4Q96JJ6 628 aa40.41■■■■■ 4.06
CNP-211ENST00000592446 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.4■■■■■ 4.06
CNP-211ENST00000592446 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CNP-211ENST00000592446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.32■■■■■ 4.04
CNP-211ENST00000592446 SHROOM2Q13796 1616 aa40.31■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms