Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 TCF4-255ENST00000626595 833 ntTSL 58.12□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-221ENST00000563888 570 ntTSL 47.68□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.25e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-234ENST00000566514 969 ntTSL 36.94□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-271ENST00000630319 737 ntTSL 56.92□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-269ENST00000630224 501 ntTSL 56.68□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-237ENST00000568147 550 ntTSL 46.66□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-213ENST00000562543 598 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.475e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-220ENST00000563824 897 ntTSL 45.66□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-257ENST00000627136 624 ntTSL 55.55□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-223ENST00000564343 568 ntTSL 45.55□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-280ENST00000636751 8283 ntTSL 55.43□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 TCF4-217ENST00000562847 597 ntTSL 34.37□□□□□ -1.715e-7■■■■■ 29.7
MATR3P43243 PPARG-208ENST00000397023 2002 ntTSL 510.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PPARG-213ENST00000477039 1705 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-208ENST00000587269 1042 ntTSL 332.35■■■□□ 2.774e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.874e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-211ENST00000589877 527 ntTSL 318.29■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-207ENST00000586514 828 ntTSL 517.41■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-202ENST00000414914 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.15■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-203ENST00000430798 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.25■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-204ENST00000585978 663 ntTSL 315.05■□□□□ -04e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SMAD2-210ENST00000587421 575 ntTSL 414.93□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-212ENST00000496617 538 ntTSL 512.53□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-204ENST00000415150 448 ntTSL 311.92□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-222ENST00000457025 413 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-207ENST00000427669 383 ntTSL 310.95□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-206ENST00000424517 270 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-202ENST00000413606 770 ntTSL 39.32□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-209ENST00000489405 1475 ntTSL 58.7□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC8.23□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-208ENST00000429859 418 ntTSL 57.82□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-213ENST00000442860 358 ntTSL 57.66□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-216ENST00000447577 431 ntTSL 56.57□□□□□ -1.364e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-204ENST00000438949 873 ntTSL 36.26□□□□□ -1.414e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.444e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-215ENST00000446528 489 ntTSL 55.52□□□□□ -1.534e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 GLCCI1-207ENST00000474269 691 ntTSL 55.41□□□□□ -1.544e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-221ENST00000455474 299 ntTSL 34.89□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC18-AS1-203ENST00000414430 427 ntTSL 34.24□□□□□ -1.734e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.442e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 422.78■■□□□ 1.242e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 419.96■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PRRC2B-204ENST00000422467 535 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 48.72□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 48.43□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-232ENST00000521395 540 ntTSL 48.37□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 48.29□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 48.28□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 58.14□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.242e-8■■■■■ 29.6
MATR3P43243 ELL2-204ENST00000508694 743 ntTSL 53.34□□□□□ -1.871e-10■■■■■ 29.6
MATR3P43243 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)21.78■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.739e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-207ENST00000512465 4663 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-208ENST00000513350 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.02□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-209ENST00000513898 4202 ntTSL 1 (best)10.16□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 29.6
MATR3P43243 CCDC136-215ENST00000528772 565 ntTSL 413.26□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 29.5
MATR3P43243 NEDD4L-232ENST00000591579 144 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 29.4
MATR3P43243 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 29.4
MATR3P43243 NEDD4L-231ENST00000590694 165 ntTSL 55.12□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 29.4
MATR3P43243 NEDD4L-212ENST00000585594 220 ntTSL 1 (best)2.01□□□□□ -2.094e-7■■■■■ 29.4
MATR3P43243 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.029e-9■■■■■ 29.4
MATR3P43243 ZNF680-203ENST00000470847 564 ntTSL 43.93□□□□□ -1.789e-9■■■■■ 29.4
MATR3P43243 ZNF680-205ENST00000476563 769 ntTSL 33.64□□□□□ -1.839e-9■■■■■ 29.4
MATR3P43243 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.939e-9■■■■■ 29.4
MATR3P43243 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 29.4
MATR3P43243 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 29.4
MATR3P43243 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 29.4
MATR3P43243 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 29.4
MATR3P43243 TMEM164-206ENST00000464177 761 ntTSL 514.22□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 29.3
MATR3P43243 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 29.3
MATR3P43243 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 29.3
MATR3P43243 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 29.3
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