RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457025.5

CCDC18-AS1-222, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 413 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 FOXD1Q16676 465 aa20.78■□□□□ 0.92
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.71■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ABCC9O60706 1549 aa19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ADRA2BP18089 450 aa19.63■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.51■□□□□ 0.71
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.37■□□□□ 0.69
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 NACADO15069 1562 aa19.32■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 MSH5O43196 834 aa19.27■□□□□ 0.68
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SCRIBQ14160 1630 aa18.79■□□□□ 0.6
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.77■□□□□ 0.59
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.57■□□□□ 0.56
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.56■□□□□ 0.56
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 POTEDQ86YR6 584 aa18.29■□□□□ 0.52
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.2■□□□□ 0.5
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.07■□□□□ 0.48
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SMARCA4P51532 1647 aa18.06■□□□□ 0.48
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.94■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.91■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SMARCA2P51531 1590 aa17.91■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 NCAPD3P42695 1498 aa17.87■□□□□ 0.45
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.83■□□□□ 0.44
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 WIZO95785 1651 aa17.83■□□□□ 0.44
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.82■□□□□ 0.44
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 HMGXB3Q12766 1538 aa17.77■□□□□ 0.44
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.67■□□□□ 0.42
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.55■□□□□ 0.4
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.42■□□□□ 0.38
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.37■□□□□ 0.37
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CFTRP13569 1480 aa17.35■□□□□ 0.37
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.25■□□□□ 0.35
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CCDC18-AS1-222ENST00000457025 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 NESP48681 1621 aa17.18■□□□□ 0.34
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.17■□□□□ 0.34
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.12■□□□□ 0.33
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 PRDM2Q13029 1718 aa17.07■□□□□ 0.32
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.05■□□□□ 0.32
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 KCNA4P22459 653 aa16.98■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ABCC8Q09428 1581 aa16.98■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 TRIM41Q8WV44 630 aa16.97■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ERCC6Q03468 1493 aa16.96■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.93■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CUX1P39880 1505 aa16.92■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.91■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 TOP2BQ02880 1626 aa16.9■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.9■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.89■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 TOPBP1Q92547 1522 aa16.89■□□□□ 0.29
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SYNJ1O43426 1573 aa16.89■□□□□ 0.29
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 WDR62O43379 1518 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 SOGA1O94964 1423 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 EEA1Q15075 1411 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CUX2O14529 1486 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 IFT140Q96RY7 1462 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.68■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 KIF27Q86VH2 1401 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 WDR97A6NE52 1622 aa16.59■□□□□ 0.25
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.58■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.57■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 IGF1RP08069 1367 aa16.55■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.54■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.52■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 RNF39Q9H2S5 420 aa16.51■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.5■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-222ENST00000457025 GRIN2BQ13224 1484 aa16.49■□□□□ 0.23
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