RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427669.5

CCDC18-AS1-207, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 383 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.48■■□□□ 1.35
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.37■□□□□ 0.69
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.19■□□□□ 0.66
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SCRIBQ14160 1630 aa18.79■□□□□ 0.6
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.94■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.91■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SMARCA2P51531 1590 aa17.91■□□□□ 0.46
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NCAPD3P42695 1498 aa17.87■□□□□ 0.45
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 WIZO95785 1651 aa17.83■□□□□ 0.44
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.82■□□□□ 0.44
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 HMGXB3Q12766 1538 aa17.77■□□□□ 0.44
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.67■□□□□ 0.42
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CFTRP13569 1480 aa17.35■□□□□ 0.37
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.25■□□□□ 0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NESP48681 1621 aa17.18■□□□□ 0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.17■□□□□ 0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.12■□□□□ 0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.09■□□□□ 0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PRDM2Q13029 1718 aa17.07■□□□□ 0.32
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.05■□□□□ 0.32
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ABCC8Q09428 1581 aa16.98■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 TRIM41Q8WV44 630 aa16.97■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ERCC6Q03468 1493 aa16.96■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.93■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CUX1P39880 1505 aa16.92■□□□□ 0.3
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SYNJ1O43426 1573 aa16.89■□□□□ 0.29
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 WDR62O43379 1518 aa16.85■□□□□ 0.29
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SOGA1O94964 1423 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 EEA1Q15075 1411 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CUX2O14529 1486 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 IFT140Q96RY7 1462 aa16.7■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.68■□□□□ 0.26
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 KIF27Q86VH2 1401 aa16.66■□□□□ 0.26
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 WDR97A6NE52 1622 aa16.59■□□□□ 0.25
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.58■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.57■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 IGF1RP08069 1367 aa16.55■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.54■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.52■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.5■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 GRIN2BQ13224 1484 aa16.49■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PRXQ9BXM0 1461 aa16.47■□□□□ 0.23
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.45■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.4■□□□□ 0.22
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 KIF21BO75037 1637 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.39■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CUL7Q14999 1698 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 GOLGA3Q08378 1498 aa16.38■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.36■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PBRM1Q86U86 1689 aa16.34■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ADAMTS12P58397 1594 aa16.34■□□□□ 0.21
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.33■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SYNJ2O15056 1496 aa16.32■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.3■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 GRIN2AQ12879 1464 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.22■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FBLN2P98095 1184 aa16.21■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NUP160Q12769 1436 aa16.2■□□□□ 0.18
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.17■□□□□ 0.18
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