RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33■■■□□ 2.87
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NEDD4L-232ENST00000591579 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.4■■■□□ 2.14
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.28■■■□□ 2.12
NEDD4L-232ENST00000591579 NACADO15069 1562 aa28.12■■■□□ 2.09
NEDD4L-232ENST00000591579 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.03■■■□□ 2.08
NEDD4L-232ENST00000591579 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
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NEDD4L-232ENST00000591579 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.62■■■□□ 2.01
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NEDD4L-232ENST00000591579 SCRIBQ14160 1630 aa27.12■■□□□ 1.93
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NEDD4L-232ENST00000591579 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.03■■□□□ 1.92
NEDD4L-232ENST00000591579 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD4L-232ENST00000591579 NCAPD3P42695 1498 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD4L-232ENST00000591579 ERCC6Q03468 1493 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CUX2O14529 1486 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.89■■□□□ 1.73
NEDD4L-232ENST00000591579 SMARCA2P51531 1590 aa25.79■■□□□ 1.72
NEDD4L-232ENST00000591579 SMARCA4P51532 1647 aa25.79■■□□□ 1.72
NEDD4L-232ENST00000591579 HMGXB3Q12766 1538 aa25.77■■□□□ 1.72
NEDD4L-232ENST00000591579 NESP48681 1621 aa25.68■■□□□ 1.7
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NEDD4L-232ENST00000591579 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.5■■□□□ 1.67
NEDD4L-232ENST00000591579 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.44■■□□□ 1.66
NEDD4L-232ENST00000591579 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
NEDD4L-232ENST00000591579 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.42■■□□□ 1.66
NEDD4L-232ENST00000591579 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD4L-232ENST00000591579 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD4L-232ENST00000591579 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.13■■□□□ 1.61
NEDD4L-232ENST00000591579 WIZO95785 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
NEDD4L-232ENST00000591579 WDR62O43379 1518 aa25.05■■□□□ 1.6
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NEDD4L-232ENST00000591579 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.99■■□□□ 1.59
NEDD4L-232ENST00000591579 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.94■■□□□ 1.58
NEDD4L-232ENST00000591579 CFTRP13569 1480 aa24.85■■□□□ 1.57
NEDD4L-232ENST00000591579 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
NEDD4L-232ENST00000591579 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NEDD4L-232ENST00000591579 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NEDD4L-232ENST00000591579 OSCARQ8IYS5 282 aa24.68■■□□□ 1.54
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.51■■□□□ 1.51
NEDD4L-232ENST00000591579 IFT140Q96RY7 1462 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
NEDD4L-232ENST00000591579 PRDM2Q13029 1718 aa24.49■■□□□ 1.51
NEDD4L-232ENST00000591579 TOPBP1Q92547 1522 aa24.42■■□□□ 1.5
NEDD4L-232ENST00000591579 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD4L-232ENST00000591579 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD4L-232ENST00000591579 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD4L-232ENST00000591579 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCC8Q09428 1581 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD4L-232ENST00000591579 ARHGEF11O15085 1522 aa24.31■■□□□ 1.48
NEDD4L-232ENST00000591579 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.31■■□□□ 1.48
NEDD4L-232ENST00000591579 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
NEDD4L-232ENST00000591579 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NEDD4L-232ENST00000591579 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NEDD4L-232ENST00000591579 FBLN2P98095 1184 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD4L-232ENST00000591579 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD4L-232ENST00000591579 CHD1O14646 1710 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD4L-232ENST00000591579 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.09■■□□□ 1.45
NEDD4L-232ENST00000591579 ARAP1Q96P48 1450 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD4L-232ENST00000591579 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NEDD4L-232ENST00000591579 SOGA1O94964 1423 aa24.05■■□□□ 1.44
NEDD4L-232ENST00000591579 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24■■□□□ 1.43
NEDD4L-232ENST00000591579 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24■■□□□ 1.43
NEDD4L-232ENST00000591579 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
NEDD4L-232ENST00000591579 CUX1P39880 1505 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD4L-232ENST00000591579 WDR97A6NE52 1622 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD4L-232ENST00000591579 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
NEDD4L-232ENST00000591579 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
NEDD4L-232ENST00000591579 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
NEDD4L-232ENST00000591579 GRIN2BQ13224 1484 aa23.87■■□□□ 1.41
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NEDD4L-232ENST00000591579 SYNJ2O15056 1496 aa23.82■■□□□ 1.4
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NEDD4L-232ENST00000591579 PBRM1Q86U86 1689 aa23.71■■□□□ 1.39
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.68■■□□□ 1.38
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.66■■□□□ 1.38
NEDD4L-232ENST00000591579 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NEDD4L-232ENST00000591579 GRIN2AQ12879 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
NEDD4L-232ENST00000591579 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
NEDD4L-232ENST00000591579 ADAMTS12P58397 1594 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD4L-232ENST00000591579 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD4L-232ENST00000591579 CEP170Q5SW79 1584 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD4L-232ENST00000591579 NUP160Q12769 1436 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD4L-232ENST00000591579 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NEDD4L-232ENST00000591579 TOP2BQ02880 1626 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD4L-232ENST00000591579 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD4L-232ENST00000591579 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD4L-232ENST00000591579 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD4L-232ENST00000591579 SHROOM2Q13796 1616 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD4L-232ENST00000591579 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NEDD4L-232ENST00000591579 JPH4Q96JJ6 628 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD4L-232ENST00000591579 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.21■■□□□ 1.31
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