RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		72.68	■■■■■ 9.23
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		64.97	■■■■■ 7.99
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCC9	O60706	1549 aa		64.63	■■■■■ 7.94
SMAD2-208	ENST00000587269	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		61.73	■■■■■ 7.47
SMAD2-208	ENST00000587269	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		61.53	■■■■■ 7.44
SMAD2-208	ENST00000587269	NACAD	O15069	1562 aa		61.39	■■■■■ 7.42
SMAD2-208	ENST00000587269	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		60.61	■■■■■ 7.29
SMAD2-208	ENST00000587269	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	60.33	■■■■■ 7.25
SMAD2-208	ENST00000587269	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	60.28	■■■■■ 7.24
SMAD2-208	ENST00000587269	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		60.15	■■■■■ 7.22
SMAD2-208	ENST00000587269	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		60.11	■■■■■ 7.21
SMAD2-208	ENST00000587269	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		60.02	■■■■■ 7.2
SMAD2-208	ENST00000587269	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		59.72	■■■■■ 7.15
SMAD2-208	ENST00000587269	SCRIB	Q14160	1630 aa		59.3	■■■■■ 7.08
SMAD2-208	ENST00000587269	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		59.08	■■■■■ 7.05
SMAD2-208	ENST00000587269	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		58.34	■■■■■ 6.93
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	58.32	■■■■■ 6.93
SMAD2-208	ENST00000587269	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		58.17	■■■■■ 6.9
SMAD2-208	ENST00000587269	NCAPD3	P42695	1498 aa		56.64	■■■■■ 6.66
SMAD2-208	ENST00000587269	SMARCA4	P51532	1647 aa		56.57	■■■■■ 6.65
SMAD2-208	ENST00000587269	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		56.54	■■■■■ 6.64
SMAD2-208	ENST00000587269	SMARCA2	P51531	1590 aa		56.46	■■■■■ 6.63
SMAD2-208	ENST00000587269	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	56.43	■■■■■ 6.62
SMAD2-208	ENST00000587269	HMGXB3	Q12766	1538 aa		56.23	■■■■■ 6.59
SMAD2-208	ENST00000587269	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	56.1	■■■■■ 6.57
SMAD2-208	ENST00000587269	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		55.98	■■■■■ 6.55
SMAD2-208	ENST00000587269	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		55.95	■■■■■ 6.55
SMAD2-208	ENST00000587269	ERCC6	Q03468	1493 aa		55.88	■■■■■ 6.54
SMAD2-208	ENST00000587269	NES	P48681	1621 aa		55.58	■■■■■ 6.49
SMAD2-208	ENST00000587269	CUX2	O14529	1486 aa		55.49	■■■■■ 6.47
SMAD2-208	ENST00000587269	WIZ	O95785	1651 aa		55.35	■■■■■ 6.45
SMAD2-208	ENST00000587269	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		55.31	■■■■■ 6.44
SMAD2-208	ENST00000587269	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		55.1	■■■■■ 6.41
SMAD2-208	ENST00000587269	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	55.04	■■■■■ 6.4
SMAD2-208	ENST00000587269	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		55.02	■■■■■ 6.4
SMAD2-208	ENST00000587269	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		54.97	■■■■■ 6.39
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		54.86	■■■■■ 6.37
SMAD2-208	ENST00000587269	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	54.84	■■■■■ 6.37
SMAD2-208	ENST00000587269	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	54.7	■■■■■ 6.35
SMAD2-208	ENST00000587269	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		54.49	■■■■■ 6.31
SMAD2-208	ENST00000587269	CFTR	P13569	1480 aa		54.42	■■■■■ 6.3
SMAD2-208	ENST00000587269	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		54.41	■■■■■ 6.3
SMAD2-208	ENST00000587269	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		54.38	■■■■■ 6.3
SMAD2-208	ENST00000587269	WDR62	O43379	1518 aa		54.26	■■■■■ 6.28
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		54.11	■■■■■ 6.25
SMAD2-208	ENST00000587269	PRDM2	Q13029	1718 aa		53.87	■■■■■ 6.21
SMAD2-208	ENST00000587269	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	53.81	■■■■■ 6.2
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCC8	Q09428	1581 aa		53.39	■■■■■ 6.14
SMAD2-208	ENST00000587269	TOPBP1	Q92547	1522 aa		53.36	■■■■■ 6.13
SMAD2-208	ENST00000587269	IFT140	Q96RY7	1462 aa		53.3	■■■■■ 6.12
SMAD2-208	ENST00000587269	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	53.24	■■■■■ 6.11
SMAD2-208	ENST00000587269	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		53.22	■■■■■ 6.11
SMAD2-208	ENST00000587269	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		53.21	■■■■■ 6.11
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	53.08	■■■■■ 6.09
SMAD2-208	ENST00000587269	TRIM41	Q8WV44	630 aa		52.92	■■■■■ 6.06
SMAD2-208	ENST00000587269	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	52.83	■■■■■ 6.05
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	52.8	■■■■■ 6.04
SMAD2-208	ENST00000587269	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	52.77	■■■■■ 6.04
SMAD2-208	ENST00000587269	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	52.75	■■■■■ 6.03
SMAD2-208	ENST00000587269	SOGA1	O94964	1423 aa		52.73	■■■■■ 6.03
SMAD2-208	ENST00000587269	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		52.66	■■■■■ 6.02
SMAD2-208	ENST00000587269	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		52.6	■■■■■ 6.01
SMAD2-208	ENST00000587269	CUX1	P39880	1505 aa		52.57	■■■■■ 6.01
SMAD2-208	ENST00000587269	FBLN2	P98095	1184 aa		52.54	■■■■■ 6
SMAD2-208	ENST00000587269	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	52.54	■■■■■ 6
SMAD2-208	ENST00000587269	WDR97	A6NE52	1622 aa		52.34	■■■■■ 5.97
SMAD2-208	ENST00000587269	CHD1	O14646	1710 aa		52.33	■■■■■ 5.97
SMAD2-208	ENST00000587269	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		52.25	■■■■■ 5.95
SMAD2-208	ENST00000587269	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		52.25	■■■■■ 5.95
SMAD2-208	ENST00000587269	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		52.25	■■■■■ 5.95
SMAD2-208	ENST00000587269	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		52.2	■■■■■ 5.95
SMAD2-208	ENST00000587269	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	52.2	■■■■■ 5.95
SMAD2-208	ENST00000587269	GRIN2B	Q13224	1484 aa		52.18	■■■■■ 5.94
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGEF11	O15085	1522 aa		52.15	■■■■■ 5.94
SMAD2-208	ENST00000587269	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	52.1	■■■■■ 5.93
SMAD2-208	ENST00000587269	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		52.06	■■■■■ 5.92
SMAD2-208	ENST00000587269	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	52.02	■■■■■ 5.92
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		52.01	■■■■■ 5.92
SMAD2-208	ENST00000587269	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		51.94	■■■■■ 5.91
SMAD2-208	ENST00000587269	SYNJ2	O15056	1496 aa		51.92	■■■■■ 5.9
SMAD2-208	ENST00000587269	PBRM1	Q86U86	1689 aa		51.91	■■■■■ 5.9
SMAD2-208	ENST00000587269	TOP2B	Q02880	1626 aa		51.88	■■■■■ 5.9
SMAD2-208	ENST00000587269	SYNJ1	O43426	1573 aa		51.87	■■■■■ 5.89
SMAD2-208	ENST00000587269	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		51.85	■■■■■ 5.89
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		51.82	■■■■■ 5.89
SMAD2-208	ENST00000587269	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		51.69	■■■■■ 5.86
SMAD2-208	ENST00000587269	ARAP1	Q96P48	1450 aa		51.64	■■■■■ 5.86
SMAD2-208	ENST00000587269	GRIN2A	Q12879	1464 aa		51.45	■■■■■ 5.83
SMAD2-208	ENST00000587269	ADAMTS12	P58397	1594 aa		51.42	■■■■■ 5.82
SMAD2-208	ENST00000587269	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		51.42	■■■■■ 5.82
SMAD2-208	ENST00000587269	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		51.39	■■■■■ 5.82
SMAD2-208	ENST00000587269	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	51.32	■■■■■ 5.81
SMAD2-208	ENST00000587269	NUP160	Q12769	1436 aa		51.21	■■■■■ 5.79
SMAD2-208	ENST00000587269	CEP170	Q5SW79	1584 aa		51.17	■■■■■ 5.78
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF27	Q86VH2	1401 aa		51.04	■■■■■ 5.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		50.92	■■■■■ 5.74
SMAD2-208	ENST00000587269	JPH4	Q96JJ6	628 aa		50.89	■■■■■ 5.74
SMAD2-208	ENST00000587269	IGF1R	P08069	1367 aa		50.88	■■■■■ 5.74
SMAD2-208	ENST00000587269	SHROOM2	Q13796	1616 aa		50.87	■■■■■ 5.73
SMAD2-208	ENST00000587269	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	50.8	■■■■■ 5.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms