RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585978.1

SMAD2-204, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 663 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-204ENST00000585978 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.82■■■□□ 2.85
SMAD2-204ENST00000585978 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.98■■■□□ 2.23
SMAD2-204ENST00000585978 ABCC9O60706 1549 aa28.06■■■□□ 2.08
SMAD2-204ENST00000585978 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SMAD2-204ENST00000585978 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.28■■□□□ 1.96
SMAD2-204ENST00000585978 NACADO15069 1562 aa27.12■■□□□ 1.93
SMAD2-204ENST00000585978 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.1■■□□□ 1.93
SMAD2-204ENST00000585978 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.06■■□□□ 1.92
SMAD2-204ENST00000585978 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.03■■□□□ 1.92
SMAD2-204ENST00000585978 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.63■■□□□ 1.85
SMAD2-204ENST00000585978 SCRIBQ14160 1630 aa26.59■■□□□ 1.85
SMAD2-204ENST00000585978 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.34■■□□□ 1.81
SMAD2-204ENST00000585978 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
SMAD2-204ENST00000585978 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
SMAD2-204ENST00000585978 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.61■■□□□ 1.69
SMAD2-204ENST00000585978 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SMAD2-204ENST00000585978 SMARCA4P51532 1647 aa25.42■■□□□ 1.66
SMAD2-204ENST00000585978 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.42■■□□□ 1.66
SMAD2-204ENST00000585978 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.39■■□□□ 1.66
SMAD2-204ENST00000585978 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SMAD2-204ENST00000585978 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.37■■□□□ 1.65
SMAD2-204ENST00000585978 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SMAD2-204ENST00000585978 WIZO95785 1651 aa25.15■■□□□ 1.62
SMAD2-204ENST00000585978 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.15■■□□□ 1.62
SMAD2-204ENST00000585978 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.1■■□□□ 1.61
SMAD2-204ENST00000585978 SMARCA2P51531 1590 aa25.08■■□□□ 1.61
SMAD2-204ENST00000585978 NCAPD3P42695 1498 aa25.02■■□□□ 1.6
SMAD2-204ENST00000585978 HMGXB3Q12766 1538 aa24.95■■□□□ 1.58
SMAD2-204ENST00000585978 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SMAD2-204ENST00000585978 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SMAD2-204ENST00000585978 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SMAD2-204ENST00000585978 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.55■■□□□ 1.52
SMAD2-204ENST00000585978 NESP48681 1621 aa24.44■■□□□ 1.5
SMAD2-204ENST00000585978 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.32■■□□□ 1.48
SMAD2-204ENST00000585978 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.3■■□□□ 1.48
SMAD2-204ENST00000585978 CFTRP13569 1480 aa24.27■■□□□ 1.48
SMAD2-204ENST00000585978 PRDM2Q13029 1718 aa24.2■■□□□ 1.46
SMAD2-204ENST00000585978 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.17■■□□□ 1.46
SMAD2-204ENST00000585978 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.09■■□□□ 1.45
SMAD2-204ENST00000585978 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.08■■□□□ 1.45
SMAD2-204ENST00000585978 ERCC6Q03468 1493 aa24.07■■□□□ 1.44
SMAD2-204ENST00000585978 CEP164Q9UPV0 1460 aa24■■□□□ 1.43
SMAD2-204ENST00000585978 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SMAD2-204ENST00000585978 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.88■■□□□ 1.41
SMAD2-204ENST00000585978 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SMAD2-204ENST00000585978 ABCC8Q09428 1581 aa23.86■■□□□ 1.41
SMAD2-204ENST00000585978 WDR62O43379 1518 aa23.8■■□□□ 1.4
SMAD2-204ENST00000585978 CUX1P39880 1505 aa23.77■■□□□ 1.4
SMAD2-204ENST00000585978 TOPBP1Q92547 1522 aa23.76■■□□□ 1.39
SMAD2-204ENST00000585978 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.75■■□□□ 1.39
SMAD2-204ENST00000585978 SYNJ1O43426 1573 aa23.71■■□□□ 1.39
SMAD2-204ENST00000585978 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
SMAD2-204ENST00000585978 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.64■■□□□ 1.38
SMAD2-204ENST00000585978 CUX2O14529 1486 aa23.63■■□□□ 1.37
SMAD2-204ENST00000585978 TOP2BQ02880 1626 aa23.62■■□□□ 1.37
SMAD2-204ENST00000585978 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.61■■□□□ 1.37
SMAD2-204ENST00000585978 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SMAD2-204ENST00000585978 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.53■■□□□ 1.36
SMAD2-204ENST00000585978 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMAD2-204ENST00000585978 SOGA1O94964 1423 aa23.46■■□□□ 1.35
SMAD2-204ENST00000585978 IFT140Q96RY7 1462 aa23.44■■□□□ 1.34
SMAD2-204ENST00000585978 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.44■■□□□ 1.34
SMAD2-204ENST00000585978 WDR97A6NE52 1622 aa23.43■■□□□ 1.34
SMAD2-204ENST00000585978 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SMAD2-204ENST00000585978 TRIM41Q8WV44 630 aa23.39■■□□□ 1.33
SMAD2-204ENST00000585978 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.34■■□□□ 1.33
SMAD2-204ENST00000585978 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SMAD2-204ENST00000585978 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SMAD2-204ENST00000585978 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SMAD2-204ENST00000585978 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.27■■□□□ 1.32
SMAD2-204ENST00000585978 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.22■■□□□ 1.31
SMAD2-204ENST00000585978 PBRM1Q86U86 1689 aa23.22■■□□□ 1.31
SMAD2-204ENST00000585978 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.2■■□□□ 1.3
SMAD2-204ENST00000585978 KIF27Q86VH2 1401 aa23.14■■□□□ 1.29
SMAD2-204ENST00000585978 GRIN2BQ13224 1484 aa23.12■■□□□ 1.29
SMAD2-204ENST00000585978 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.11■■□□□ 1.29
SMAD2-204ENST00000585978 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.05■■□□□ 1.28
SMAD2-204ENST00000585978 IGF1RP08069 1367 aa23.02■■□□□ 1.28
SMAD2-204ENST00000585978 ADAMTS12P58397 1594 aa23.02■■□□□ 1.28
SMAD2-204ENST00000585978 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SMAD2-204ENST00000585978 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SMAD2-204ENST00000585978 CHD1O14646 1710 aa23■■□□□ 1.27
SMAD2-204ENST00000585978 CUL7Q14999 1698 aa22.94■■□□□ 1.26
SMAD2-204ENST00000585978 SYNJ2O15056 1496 aa22.92■■□□□ 1.26
SMAD2-204ENST00000585978 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.92■■□□□ 1.26
SMAD2-204ENST00000585978 EEA1Q15075 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAD2-204ENST00000585978 FBLN2P98095 1184 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAD2-204ENST00000585978 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.89■■□□□ 1.26
SMAD2-204ENST00000585978 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.88■■□□□ 1.25
SMAD2-204ENST00000585978 GRIN2AQ12879 1464 aa22.86■■□□□ 1.25
SMAD2-204ENST00000585978 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SMAD2-204ENST00000585978 PRXQ9BXM0 1461 aa22.84■■□□□ 1.25
SMAD2-204ENST00000585978 CEP170Q5SW79 1584 aa22.8■■□□□ 1.24
SMAD2-204ENST00000585978 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.79■■□□□ 1.24
SMAD2-204ENST00000585978 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.76■■□□□ 1.23
SMAD2-204ENST00000585978 KIF21BO75037 1637 aa22.75■■□□□ 1.23
SMAD2-204ENST00000585978 NUP160Q12769 1436 aa22.74■■□□□ 1.23
SMAD2-204ENST00000585978 OSCARQ8IYS5 282 aa22.71■■□□□ 1.23
SMAD2-204ENST00000585978 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.69■■□□□ 1.22
SMAD2-204ENST00000585978 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms