Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 BRAF-202ENST00000469930 1058 ntTSL 220.18■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 519.32■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 APPL2-205ENST00000547439 3196 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PDE4A-206ENST00000589073 1703 ntTSL 519.13■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 518.87■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-232ENST00000610893 578 ntTSL 418.43■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-239ENST00000622565 756 ntTSL 417.97■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-212ENST00000595118 2446 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-231ENST00000602251 671 ntTSL 217.06■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 216.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 HSF2BP-202ENST00000443485 989 ntTSL 516.52■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SMOX-206ENST00000457205 1669 ntTSL 516.19■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-235ENST00000617753 580 ntTSL 415.74■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-207ENST00000593463 573 ntTSL 415.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-230ENST00000601464 477 ntTSL 515.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-236ENST00000618486 567 ntTSL 415.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-214ENST00000595665 576 ntTSL 415.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-218ENST00000597816 692 ntTSL 315.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-226ENST00000599724 910 ntTSL 514.78□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 MTA3-211ENST00000467925 1672 ntTSL 514.68□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SMOX-209ENST00000486998 702 ntTSL 214.42□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-233ENST00000612121 755 ntTSL 314.33□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-210ENST00000594448 573 ntTSL 514.19□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-234ENST00000612845 527 ntTSL 414.19□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-237ENST00000622107 590 ntTSL 414.1□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-228ENST00000600499 580 ntTSL 213.99□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-202ENST00000243562 3140 ntTSL 213.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 COL9A2-207ENST00000482722 2887 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.24e-22■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 ITGB4-208ENST00000582629 458 ntTSL 313.29□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 ITGB4-204ENST00000578318 688 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 313.2□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PDE4A-207ENST00000590407 1770 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-216ENST00000597071 670 ntTSL 212.17□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-203ENST00000396098 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LTBP4-215ENST00000596351 512 ntTSL 211.13□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 RGS3-227ENST00000496113 641 ntTSL 411.12□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 RGS3-203ENST00000343817 3689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.823e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 STEAP3-203ENST00000393110 4262 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 BCAS3-216ENST00000588168 545 ntTSL 59.37□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KIAA0319L-205ENST00000440579 2171 ntTSL 29.36□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.939e-65■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AC079779.2-202ENST00000427831 392 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SMOX-211ENST00000494098 812 ntTSL 59.11□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 BCAS3-227ENST00000591371 527 ntTSL 58.68□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-211ENST00000460096 629 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 MTA3-215ENST00000482875 2504 ntTSL 28.4□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 BCAS3-226ENST00000591147 590 ntTSL 38.29□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 RPS6KA3-205ENST00000479809 847 ntTSL 57.8□□□□□ -1.163e-6■■■■□ 22.2
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