RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462143.5

RGS3-210, Transcript of regulator of G protein signaling 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RGS3, Length 2,759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS3-210ENST00000462143 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.18■■■■□ 3.54
RGS3-210ENST00000462143 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.02■■■□□ 2.72
RGS3-210ENST00000462143 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
RGS3-210ENST00000462143 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.09■■■□□ 2.57
RGS3-210ENST00000462143 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.03■■■□□ 2.56
RGS3-210ENST00000462143 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.5■■■□□ 2.47
RGS3-210ENST00000462143 ABCC9O60706 1549 aa30.4■■■□□ 2.46
RGS3-210ENST00000462143 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
RGS3-210ENST00000462143 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.92■■■□□ 2.38
RGS3-210ENST00000462143 SCRIBQ14160 1630 aa29.9■■■□□ 2.38
RGS3-210ENST00000462143 NACADO15069 1562 aa29.79■■■□□ 2.36
RGS3-210ENST00000462143 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.5■■■□□ 2.31
RGS3-210ENST00000462143 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.09■■■□□ 2.25
RGS3-210ENST00000462143 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
RGS3-210ENST00000462143 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.08■■■□□ 2.25
RGS3-210ENST00000462143 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.89■■■□□ 2.22
RGS3-210ENST00000462143 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
RGS3-210ENST00000462143 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.79■■■□□ 2.2
RGS3-210ENST00000462143 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.76■■■□□ 2.19
RGS3-210ENST00000462143 WIZO95785 1651 aa28.7■■■□□ 2.18
RGS3-210ENST00000462143 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
RGS3-210ENST00000462143 SMARCA4P51532 1647 aa28.51■■■□□ 2.15
RGS3-210ENST00000462143 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
RGS3-210ENST00000462143 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.07■■■□□ 2.08
RGS3-210ENST00000462143 SMARCA2P51531 1590 aa28.04■■■□□ 2.08
RGS3-210ENST00000462143 TRIM41Q8WV44 630 aa28.02■■■□□ 2.08
RGS3-210ENST00000462143 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.99■■■□□ 2.07
RGS3-210ENST00000462143 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.98■■■□□ 2.07
RGS3-210ENST00000462143 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
RGS3-210ENST00000462143 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.92■■■□□ 2.06
RGS3-210ENST00000462143 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
RGS3-210ENST00000462143 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
RGS3-210ENST00000462143 ABCC8Q09428 1581 aa27.75■■■□□ 2.03
RGS3-210ENST00000462143 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.61■■■□□ 2.01
RGS3-210ENST00000462143 NCAPD3P42695 1498 aa27.56■■■□□ 2
RGS3-210ENST00000462143 HMGXB3Q12766 1538 aa27.5■■□□□ 1.99
RGS3-210ENST00000462143 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.38■■□□□ 1.97
RGS3-210ENST00000462143 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
RGS3-210ENST00000462143 SOGA1O94964 1423 aa27.3■■□□□ 1.96
RGS3-210ENST00000462143 SYNJ1O43426 1573 aa27.29■■□□□ 1.96
RGS3-210ENST00000462143 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.23■■□□□ 1.95
RGS3-210ENST00000462143 CFTRP13569 1480 aa27.11■■□□□ 1.93
RGS3-210ENST00000462143 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27■■□□□ 1.91
RGS3-210ENST00000462143 PCGF6Q9BYE7 350 aa27■■□□□ 1.91
RGS3-210ENST00000462143 TOP2BQ02880 1626 aa26.99■■□□□ 1.91
RGS3-210ENST00000462143 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.98■■□□□ 1.91
RGS3-210ENST00000462143 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.97■■□□□ 1.91
RGS3-210ENST00000462143 CUX1P39880 1505 aa26.95■■□□□ 1.9
RGS3-210ENST00000462143 EEA1Q15075 1411 aa26.92■■□□□ 1.9
RGS3-210ENST00000462143 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
RGS3-210ENST00000462143 PRDM2Q13029 1718 aa26.87■■□□□ 1.89
RGS3-210ENST00000462143 NESP48681 1621 aa26.85■■□□□ 1.89
RGS3-210ENST00000462143 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RGS3-210ENST00000462143 GOLGA3Q08378 1498 aa26.74■■□□□ 1.87
RGS3-210ENST00000462143 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RGS3-210ENST00000462143 CEP162Q5TB80 1403 aa26.73■■□□□ 1.87
RGS3-210ENST00000462143 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.73■■□□□ 1.87
RGS3-210ENST00000462143 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.72■■□□□ 1.87
RGS3-210ENST00000462143 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.68■■□□□ 1.86
RGS3-210ENST00000462143 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.67■■□□□ 1.86
RGS3-210ENST00000462143 KIF21BO75037 1637 aa26.66■■□□□ 1.86
RGS3-210ENST00000462143 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RGS3-210ENST00000462143 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.59■■□□□ 1.85
RGS3-210ENST00000462143 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RGS3-210ENST00000462143 KIF27Q86VH2 1401 aa26.55■■□□□ 1.84
RGS3-210ENST00000462143 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.53■■□□□ 1.84
RGS3-210ENST00000462143 CUX2O14529 1486 aa26.51■■□□□ 1.84
RGS3-210ENST00000462143 PRXQ9BXM0 1461 aa26.48■■□□□ 1.83
RGS3-210ENST00000462143 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RGS3-210ENST00000462143 TOPBP1Q92547 1522 aa26.46■■□□□ 1.83
RGS3-210ENST00000462143 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.45■■□□□ 1.82
RGS3-210ENST00000462143 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.44■■□□□ 1.82
RGS3-210ENST00000462143 CLIP1P30622 1438 aa26.41■■□□□ 1.82
RGS3-210ENST00000462143 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
RGS3-210ENST00000462143 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RGS3-210ENST00000462143 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.38■■□□□ 1.81
RGS3-210ENST00000462143 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.37■■□□□ 1.81
RGS3-210ENST00000462143 IGF1RP08069 1367 aa26.37■■□□□ 1.81
RGS3-210ENST00000462143 HRCP23327 699 aa26.36■■□□□ 1.81
RGS3-210ENST00000462143 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.36■■□□□ 1.81
RGS3-210ENST00000462143 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.24■■□□□ 1.79
RGS3-210ENST00000462143 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.23■■□□□ 1.79
RGS3-210ENST00000462143 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.18■■□□□ 1.78
RGS3-210ENST00000462143 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RGS3-210ENST00000462143 ARAP1Q96P48 1450 aa26.13■■□□□ 1.77
RGS3-210ENST00000462143 WDR97A6NE52 1622 aa26.12■■□□□ 1.77
RGS3-210ENST00000462143 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.05■■□□□ 1.76
RGS3-210ENST00000462143 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.04■■□□□ 1.76
RGS3-210ENST00000462143 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.01■■□□□ 1.75
RGS3-210ENST00000462143 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
RGS3-210ENST00000462143 GAPVD1Q14C86 1478 aa26■■□□□ 1.75
RGS3-210ENST00000462143 APLP2Q06481 763 aa25.96■■□□□ 1.75
RGS3-210ENST00000462143 CUL7Q14999 1698 aa25.94■■□□□ 1.74
RGS3-210ENST00000462143 P3H3Q8IVL6 736 aa25.93■■□□□ 1.74
RGS3-210ENST00000462143 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
RGS3-210ENST00000462143 ERCC6Q03468 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
RGS3-210ENST00000462143 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RGS3-210ENST00000462143 WDR62O43379 1518 aa25.86■■□□□ 1.73
RGS3-210ENST00000462143 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
RGS3-210ENST00000462143 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms