RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.29■■■□□ 2.28
USP25-201ENST00000285679 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
USP25-201ENST00000285679 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.09■■□□□ 1.77
USP25-201ENST00000285679 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.73■■□□□ 1.71
USP25-201ENST00000285679 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.41■■□□□ 1.66
USP25-201ENST00000285679 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.17■■□□□ 1.62
USP25-201ENST00000285679 HRCP23327 699 aa25.1■■□□□ 1.61
USP25-201ENST00000285679 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.08■■□□□ 1.61
USP25-201ENST00000285679 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP25-201ENST00000285679 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.69■■□□□ 1.54
USP25-201ENST00000285679 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
USP25-201ENST00000285679 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.58■■□□□ 1.52
USP25-201ENST00000285679 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
USP25-201ENST00000285679 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-201ENST00000285679 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP25-201ENST00000285679 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
USP25-201ENST00000285679 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.07■■□□□ 1.44
USP25-201ENST00000285679 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
USP25-201ENST00000285679 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
USP25-201ENST00000285679 TRIM41Q8WV44 630 aa23.91■■□□□ 1.42
USP25-201ENST00000285679 ABCC9O60706 1549 aa23.83■■□□□ 1.41
USP25-201ENST00000285679 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
USP25-201ENST00000285679 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
USP25-201ENST00000285679 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
USP25-201ENST00000285679 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
USP25-201ENST00000285679 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP25-201ENST00000285679 NACADO15069 1562 aa23.48■■□□□ 1.35
USP25-201ENST00000285679 SCRIBQ14160 1630 aa23.47■■□□□ 1.35
USP25-201ENST00000285679 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.4■■□□□ 1.34
USP25-201ENST00000285679 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
USP25-201ENST00000285679 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
USP25-201ENST00000285679 NEUROD1Q13562 356 aa23.29■■□□□ 1.32
USP25-201ENST00000285679 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP25-201ENST00000285679 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.23■■□□□ 1.31
USP25-201ENST00000285679 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP25-201ENST00000285679 MYT1Q01538 1121 aa22.97■■□□□ 1.27
USP25-201ENST00000285679 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP25-201ENST00000285679 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
USP25-201ENST00000285679 APLP2Q06481 763 aa22.85■■□□□ 1.25
USP25-201ENST00000285679 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP25-201ENST00000285679 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
USP25-201ENST00000285679 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.68■■□□□ 1.22
USP25-201ENST00000285679 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP25-201ENST00000285679 MIER1Q8N108 512 aa22.6■■□□□ 1.21
USP25-201ENST00000285679 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.54■■□□□ 1.2
USP25-201ENST00000285679 ITGAEP38570 1179 aa22.53■■□□□ 1.2
USP25-201ENST00000285679 BCANQ96GW7 911 aa22.52■■□□□ 1.2
USP25-201ENST00000285679 WIZO95785 1651 aa22.49■■□□□ 1.19
USP25-201ENST00000285679 SMARCA4P51532 1647 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-201ENST00000285679 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.39■■□□□ 1.18
USP25-201ENST00000285679 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
USP25-201ENST00000285679 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.28■■□□□ 1.16
USP25-201ENST00000285679 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP25-201ENST00000285679 CEP162Q5TB80 1403 aa22.19■■□□□ 1.14
USP25-201ENST00000285679 NEFLP07196 543 aa22.17■■□□□ 1.14
USP25-201ENST00000285679 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP25-201ENST00000285679 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.12■■□□□ 1.13
USP25-201ENST00000285679 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.11■■□□□ 1.13
USP25-201ENST00000285679 SMARCA2P51531 1590 aa22.04■■□□□ 1.12
USP25-201ENST00000285679 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP25-201ENST00000285679 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.01■■□□□ 1.11
USP25-201ENST00000285679 SOGA1O94964 1423 aa22■■□□□ 1.11
USP25-201ENST00000285679 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP25-201ENST00000285679 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.98■■□□□ 1.11
USP25-201ENST00000285679 FKBP8Q14318 412 aa21.97■■□□□ 1.11
USP25-201ENST00000285679 ABCC8Q09428 1581 aa21.95■■□□□ 1.1
USP25-201ENST00000285679 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.87■■□□□ 1.09
USP25-201ENST00000285679 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
USP25-201ENST00000285679 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP25-201ENST00000285679 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP25-201ENST00000285679 TRIM52Q96A61 297 aa21.84■■□□□ 1.09
USP25-201ENST00000285679 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-201ENST00000285679 CLIP1P30622 1438 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-201ENST00000285679 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP25-201ENST00000285679 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.77■■□□□ 1.08
USP25-201ENST00000285679 KCNH8Q96L42 1107 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-201ENST00000285679 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.75■■□□□ 1.07
USP25-201ENST00000285679 GOLGA3Q08378 1498 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-201ENST00000285679 NCAPD3P42695 1498 aa21.7■■□□□ 1.07
USP25-201ENST00000285679 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP25-201ENST00000285679 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-201ENST00000285679 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-201ENST00000285679 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
USP25-201ENST00000285679 BCL11AQ9H165 835 aa21.66■■□□□ 1.06
USP25-201ENST00000285679 HMGXB3Q12766 1538 aa21.64■■□□□ 1.05
USP25-201ENST00000285679 ANP32CO43423 234 aa21.63■■□□□ 1.05
USP25-201ENST00000285679 P3H3Q8IVL6 736 aa21.57■■□□□ 1.04
USP25-201ENST00000285679 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.55■■□□□ 1.04
USP25-201ENST00000285679 EEA1Q15075 1411 aa21.54■■□□□ 1.04
USP25-201ENST00000285679 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP25-201ENST00000285679 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.52■■□□□ 1.03
USP25-201ENST00000285679 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP25-201ENST00000285679 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
USP25-201ENST00000285679 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP25-201ENST00000285679 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.46■■□□□ 1.03
USP25-201ENST00000285679 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.44■■□□□ 1.02
USP25-201ENST00000285679 SYNJ1O43426 1573 aa21.43■■□□□ 1.02
USP25-201ENST00000285679 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP25-201ENST00000285679 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms