RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.97■■■□□ 2.71
USP25-204ENST00000400183 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
USP25-204ENST00000400183 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.87■■■□□ 2.37
USP25-204ENST00000400183 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.63■■■□□ 2.33
USP25-204ENST00000400183 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.41■■■□□ 2.3
USP25-204ENST00000400183 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
USP25-204ENST00000400183 APLP2Q06481 763 aa29.13■■■□□ 2.25
USP25-204ENST00000400183 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
USP25-204ENST00000400183 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
USP25-204ENST00000400183 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.39■■■□□ 2.14
USP25-204ENST00000400183 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
USP25-204ENST00000400183 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
USP25-204ENST00000400183 TRIM41Q8WV44 630 aa28.13■■■□□ 2.09
USP25-204ENST00000400183 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
USP25-204ENST00000400183 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
USP25-204ENST00000400183 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
USP25-204ENST00000400183 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.99■■■□□ 2.07
USP25-204ENST00000400183 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
USP25-204ENST00000400183 MYT1Q01538 1121 aa27.71■■■□□ 2.03
USP25-204ENST00000400183 NEFLP07196 543 aa27.62■■■□□ 2.01
USP25-204ENST00000400183 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
USP25-204ENST00000400183 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
USP25-204ENST00000400183 HRCP23327 699 aa27.26■■□□□ 1.95
USP25-204ENST00000400183 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
USP25-204ENST00000400183 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
USP25-204ENST00000400183 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP25-204ENST00000400183 ITGAEP38570 1179 aa27.01■■□□□ 1.91
USP25-204ENST00000400183 MYT1LQ9UL68 1186 aa27■■□□□ 1.91
USP25-204ENST00000400183 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.92■■□□□ 1.9
USP25-204ENST00000400183 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USP25-204ENST00000400183 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.75■■□□□ 1.87
USP25-204ENST00000400183 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.7■■□□□ 1.87
USP25-204ENST00000400183 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
USP25-204ENST00000400183 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
USP25-204ENST00000400183 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
USP25-204ENST00000400183 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
USP25-204ENST00000400183 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.28■■□□□ 1.8
USP25-204ENST00000400183 TRIM52Q96A61 297 aa26.22■■□□□ 1.79
USP25-204ENST00000400183 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
USP25-204ENST00000400183 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
USP25-204ENST00000400183 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.09■■□□□ 1.77
USP25-204ENST00000400183 NEUROD1Q13562 356 aa26.08■■□□□ 1.77
USP25-204ENST00000400183 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
USP25-204ENST00000400183 ANP32CO43423 234 aa25.93■■□□□ 1.74
USP25-204ENST00000400183 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
USP25-204ENST00000400183 ABCC9O60706 1549 aa25.91■■□□□ 1.74
USP25-204ENST00000400183 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
USP25-204ENST00000400183 BCANQ96GW7 911 aa25.8■■□□□ 1.72
USP25-204ENST00000400183 FBLN2P98095 1184 aa25.79■■□□□ 1.72
USP25-204ENST00000400183 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
USP25-204ENST00000400183 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
USP25-204ENST00000400183 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
USP25-204ENST00000400183 NEFMP07197 916 aa25.61■■□□□ 1.69
USP25-204ENST00000400183 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.57■■□□□ 1.68
USP25-204ENST00000400183 P3H3Q8IVL6 736 aa25.56■■□□□ 1.68
USP25-204ENST00000400183 SLC24A1O60721 1099 aa25.55■■□□□ 1.68
USP25-204ENST00000400183 ARID3CA6NKF2 412 aa25.5■■□□□ 1.67
USP25-204ENST00000400183 BCL11AQ9H165 835 aa25.46■■□□□ 1.67
USP25-204ENST00000400183 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
USP25-204ENST00000400183 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
USP25-204ENST00000400183 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USP25-204ENST00000400183 TONSLQ96HA7 1378 aa25.24■■□□□ 1.63
USP25-204ENST00000400183 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
USP25-204ENST00000400183 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP25-204ENST00000400183 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP25-204ENST00000400183 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.13■■□□□ 1.61
USP25-204ENST00000400183 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
USP25-204ENST00000400183 FKBP8Q14318 412 aa25.07■■□□□ 1.6
USP25-204ENST00000400183 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
USP25-204ENST00000400183 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
USP25-204ENST00000400183 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
USP25-204ENST00000400183 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
USP25-204ENST00000400183 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-204ENST00000400183 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
USP25-204ENST00000400183 SCRIBQ14160 1630 aa24.96■■□□□ 1.59
USP25-204ENST00000400183 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.94■■□□□ 1.58
USP25-204ENST00000400183 TMC1Q8TDI8 760 aa24.92■■□□□ 1.58
USP25-204ENST00000400183 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.92■■□□□ 1.58
USP25-204ENST00000400183 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
USP25-204ENST00000400183 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.577e-9■■■□□ 15.8
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
USP25-204ENST00000400183 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP25-204ENST00000400183 TSPY4P0CV99 314 aa24.87■■□□□ 1.57
USP25-204ENST00000400183 TSPY10P0CW01 314 aa24.87■■□□□ 1.57
USP25-204ENST00000400183 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.84■■□□□ 1.57
USP25-204ENST00000400183 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.84■■□□□ 1.57
USP25-204ENST00000400183 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
USP25-204ENST00000400183 MRS2Q9HD23 443 aa24.78■■□□□ 1.56
USP25-204ENST00000400183 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.78■■□□□ 1.56
USP25-204ENST00000400183 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-204ENST00000400183 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
USP25-204ENST00000400183 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
USP25-204ENST00000400183 MIER1Q8N108 512 aa24.64■■□□□ 1.53
USP25-204ENST00000400183 NBR1Q14596 966 aa24.64■■□□□ 1.53
USP25-204ENST00000400183 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.531e-7■■■□□ 17.9
USP25-204ENST00000400183 CLIP1P30622 1438 aa24.6■■□□□ 1.53
USP25-204ENST00000400183 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.59■■□□□ 1.53
USP25-204ENST00000400183 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.53■■□□□ 1.52
USP25-204ENST00000400183 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
USP25-204ENST00000400183 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms