Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP38Q8NB14 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP38Q8NB14 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms